More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0151 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0151  PfkB  100 
 
 		 331 aa  662    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  65.64 
 
 		 332 aa  413  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  51.37 
 
 		 333 aa  335  7.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  54.46 
 
 		 333 aa  333  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  53.87 
 
 		 335 aa  328  6e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  53.82 
 
 		 338 aa  325  9e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  52.27 
 
 		 333 aa  323  2e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  51.67 
 
 		 333 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  52.41 
 
 		 407 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  49.85 
 
 		 333 aa  318  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  48.61 
 
 		 330 aa  317  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  51.37 
 
 		 333 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  51.98 
 
 		 333 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  50.76 
 
 		 331 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  51.38 
 
 		 333 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  51.08 
 
 		 328 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  52.62 
 
 		 329 aa  311  6.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  50.61 
 
 		 337 aa  311  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  51.06 
 
 		 331 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  48.48 
 
 		 342 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  49.7 
 
 		 337 aa  305  6e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  49.7 
 
 		 337 aa  305  6e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  50 
 
 		 337 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  49.25 
 
 		 337 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  45.82 
 
 		 330 aa  300  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  49.2 
 
 		 330 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  47.68 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  47.68 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  46.75 
 
 		 330 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  49.24 
 
 		 333 aa  294  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  49.38 
 
 		 330 aa  293  4e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  52.71 
 
 		 333 aa  292  5e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  49.7 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  47.22 
 
 		 338 aa  290  2e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  49.07 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  45.68 
 
 		 335 aa  290  3e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  46.44 
 
 		 330 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  45.06 
 
 		 335 aa  288  9e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  49.39 
 
 		 330 aa  288  9e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  47.53 
 
 		 337 aa  287  1e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  45.06 
 
 		 348 aa  286  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  45.77 
 
 		 331 aa  282  7.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  41.67 
 
 		 330 aa  252  6e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  49.22 
 
 		 330 aa  251  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  37.15 
 
 		 338 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  38.12 
 
 		 333 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  45.34 
 
 		 333 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  38.12 
 
 		 333 aa  245  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  37.42 
 
 		 334 aa  245  9e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  44.85 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  42.02 
 
 		 331 aa  238  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  38.22 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  36.5 
 
 		 370 aa  188  9e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  35.38 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  39.25 
 
 		 360 aa  176  5e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  32.52 
 
 		 336 aa  175  8e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  34.15 
 
 		 327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  33.85 
 
 		 327 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  32.92 
 
 		 328 aa  169  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  31.85 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  36.31 
 
 		 328 aa  159  8e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  29.24 
 
 		 341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  31.36 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  31.16 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  33.44 
 
 		 334 aa  132  9e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  37.12 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  36.36 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  31.76 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  35.36 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  33.46 
 
 		 298 aa  109  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  30.91 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  35.45 
 
 		 304 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  32.11 
 
 		 273 aa  101  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3300  PfkB domain protein  31.06 
 
 		 314 aa  97.8  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  30.45 
 
 		 309 aa  96.3  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  32.71 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  32.74 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  28.57 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  30.16 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  31.13 
 
 		 313 aa  89.7  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  33.08 
 
 		 288 aa  89.4  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  29.09 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  31.94 
 
 		 300 aa  87  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1435  ribokinase-like domain-containing protein  34.33 
 
 		 293 aa  86.7  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000559808 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  32.58 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  30.69 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  29.43 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  30.64 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  30.15 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  27.86 
 
 		 645 aa  84.3  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  27.74 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  33.91 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  32.06 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  32.71 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  28.53 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  27.36 
 
 		 323 aa  82.4  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4394  ribokinase-like domain-containing protein  29.5 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0284996  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  27.96 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  31.62 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2845  inosine kinase  29.27 
 
 		 434 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000469104  decreased coverage  0.00000000256797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>