More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0135 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0135  methyltransferase GidB  100 
 
 		 230 aa  457  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2855  methyltransferase GidB  49.76 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2847  methyltransferase GidB  47.78 
 
 		 217 aa  165  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0201  methyltransferase GidB  37.98 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2665  methyltransferase GidB  37.5 
 
 		 208 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102332  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2889  methyltransferase GidB  37.37 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1275  methyltransferase GidB  36.59 
 
 		 226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1228  putative GidB, glucose inhibited division protein  36.68 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1027  methyltransferase GidB  40.69 
 
 		 212 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.707991  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0005  methyltransferase GidB  36.67 
 
 		 193 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1835  16S rRNA methyltransferase GidB  38.27 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0884797  normal  0.317572 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1409  methyltransferase GidB  40 
 
 		 212 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302587  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  37.08 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  37.91 
 
 		 213 aa  99.8  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2866  methyltransferase GidB  31.25 
 
 		 205 aa  94.7  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0426802  normal  0.092936 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  36.09 
 
 		 209 aa  92  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  36.59 
 
 		 205 aa  90.5  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5025  methyltransferase GidB  36.17 
 
 		 221 aa  89.4  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.692099 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1584  methyltransferase GidB  36.36 
 
 		 211 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.047924 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2589  methyltransferase GidB  33.68 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103455 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1863  methyltransferase GidB  35.83 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4092  methyltransferase GidB  36.98 
 
 		 211 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.295538  normal  0.0121134 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0166  16S rRNA methyltransferase GidB  35.93 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.851437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1655  methyltransferase GidB  36.56 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  32.7 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  32.56 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1286  methyltransferase GidB  33.68 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0012  16S rRNA methyltransferase GidB  29.19 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017889  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4009  methyltransferase GidB  36.59 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00213525  hitchhiker  0.00000000363002 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  35 
 
 		 210 aa  81.6  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  34.1 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0027  16S rRNA methyltransferase GidB  32.24 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3470  16S rRNA methyltransferase GidB  36.18 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4220  methyltransferase GidB  37.16 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0390  16S rRNA methyltransferase GidB  33.7 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1398  16S rRNA methyltransferase GidB  29.68 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00046822  hitchhiker  0.000739039 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  33.95 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  33.14 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3456  methyltransferase GidB  32.29 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1057  16S rRNA methyltransferase GidB  32.24 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.904694 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  26.59 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0096  16S rRNA methyltransferase GidB  31.91 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0289  16S rRNA methyltransferase GidB  32.4 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.919787 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2962  methyltransferase GidB  36.87 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6366  16S rRNA methyltransferase GidB  32.92 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  34.16 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5740  16S rRNA methyltransferase GidB  32 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0209353  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0860  16S rRNA methyltransferase GidB  30.89 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  32.69 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  37.32 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  31.56 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0431  16S rRNA methyltransferase GidB  34.08 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73360  16S rRNA methyltransferase GidB  32.54 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3626  glucose inhibited division protein  33.51 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5210  16S rRNA methyltransferase GidB  30.56 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0295  16S rRNA methyltransferase GidB  31.91 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  32.14 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3786  16S rRNA methyltransferase GidB  31.01 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.393771  decreased coverage  0.000261644 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3069  16S rRNA methyltransferase GidB  29.21 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2754  methyltransferase GidB  32.64 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1441  16S rRNA methyltransferase GidB  31.37 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  30 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113806  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5609  glucose-inhibited division protein B  28.49 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2336  methyltransferase GidB  30.49 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000208151  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5305  16S rRNA methyltransferase GidB  30 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0052  16S rRNA methyltransferase GidB  31.94 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0064  16S rRNA methyltransferase GidB  37.67 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.75809 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5441  16S rRNA methyltransferase GidB  30 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0197  16S rRNA methyltransferase GidB  29.86 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4387  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 211 aa  75.1  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  26 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0016  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525658  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03243  16S rRNA methyltransferase GidB  33.73 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  33.53 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3929  16S rRNA methyltransferase GidB  39.6 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2570  methyltransferase GidB  35.43 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000427006  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4695  methyltransferase GidB  32.34 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5131  16S rRNA methyltransferase GidB  31.48 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2126  16S rRNA methyltransferase GidB  29.86 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4255  16S rRNA methyltransferase GidB  37.04 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412528  normal  0.61386 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4305  methyltransferase GidB  29.89 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.412707  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3590  methyltransferase GidB  28.86 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1321  16S rRNA methyltransferase GidB  30.26 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4496  16S rRNA methyltransferase GidB  29.45 
 
 		 206 aa  72  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.227983  hitchhiker  0.00000107328 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0383  16S rRNA methyltransferase GidB  38.46 
 
 		 193 aa  72  0.000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2060  16S rRNA methyltransferase GidB  30.98 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.774916  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  29.01 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  32.34 
 
 		 206 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3762  16S rRNA methyltransferase GidB  28.09 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.247019  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0051  16S rRNA methyltransferase GidB  28.65 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2394  16S rRNA methyltransferase GidB  28.57 
 
 		 222 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.547741  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1980  16S rRNA methyltransferase GidB  30.43 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  35.46 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2267  16S rRNA methyltransferase GidB  28.92 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344279 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0050  16S rRNA methyltransferase GidB  36.51 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.368551  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0074  16S rRNA methyltransferase GidB  30.98 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4184  16S rRNA methyltransferase GidB  32.34 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000958004  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1704  16S rRNA methyltransferase GidB  33.54 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0095  16S rRNA methyltransferase GidB  31.76 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.706349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>