47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0105 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0105  heparinase II/III-like  100 
 
 
628 aa  1252  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3127  heparinase II/III-like protein  47.64 
 
 
592 aa  488  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1942  heparinase II/III family protein  41.7 
 
 
575 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0023  heparinase II/III family protein  32.31 
 
 
524 aa  201  2e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0196  heparinase II/III-like  31.11 
 
 
584 aa  199  1e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.9561  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1321  heparinase II/III family protein  29.54 
 
 
629 aa  192  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213971  hitchhiker  8.59361e-08 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0157  heparinase II/III-like  31.72 
 
 
584 aa  191  4e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.901723  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0324  hypothetical protein  30.61 
 
 
571 aa  190  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.116041 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1423  Heparinase II/III family protein  30.81 
 
 
569 aa  189  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.332975 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0039  heparinase II/III family protein  30.27 
 
 
614 aa  186  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.644544  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2070  heparinase II/III family protein  30.76 
 
 
581 aa  186  2e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0030  Heparinase II/III family protein  29.65 
 
 
584 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0625  Heparinase II/III family protein  31.94 
 
 
597 aa  182  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.27993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2499  Heparinase II/III family protein  30.15 
 
 
570 aa  176  8e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307447  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3916  Heparinase II/III family protein  30.64 
 
 
548 aa  174  4e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.729618  normal  0.655355 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0085  heparinase II/III-like  30.69 
 
 
584 aa  174  4e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265496  normal  0.158685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4241  Heparinase II/III family protein  29.9 
 
 
548 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.222931 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0718  heparinase II/III-like  29.89 
 
 
628 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.79901 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2567  heparinase II/III family protein  29.41 
 
 
570 aa  171  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2790  Heparinase II/III family protein  29.6 
 
 
570 aa  171  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0024  heparinase II/III-like  30.02 
 
 
592 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4041  heparinase II/III-like  27.94 
 
 
584 aa  169  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2926  heparinase II/III family protein  29.36 
 
 
610 aa  169  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3419  heparinase II/III-like  28.68 
 
 
568 aa  167  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.784393  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4294  hypothetical protein  29.73 
 
 
518 aa  166  1e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166644  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0090  heparinase II/III-like  28.49 
 
 
581 aa  165  2e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.379483  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5221  Heparinase II/III family protein  30.56 
 
 
573 aa  164  4e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452357  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2964  heparinase II/III family protein  31.12 
 
 
573 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.534511  normal  0.040363 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3032  heparinase II/III family protein  30.71 
 
 
572 aa  158  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.310136 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3190  heparinase II/III family protein  27.86 
 
 
568 aa  156  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1815  hypothetical protein  28.19 
 
 
543 aa  155  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.277258  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1748  hypothetical protein  28.19 
 
 
617 aa  154  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.560293  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1088  heparinase II/III family protein  28.81 
 
 
580 aa  154  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5592  heparinase II/III family protein  29.96 
 
 
582 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.658626  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0073  heparinase II/III-like family protein  27.43 
 
 
569 aa  147  7e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  1.68541e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2927  heparinase II/III family protein  31.01 
 
 
565 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.0379947 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2764  heparinase II/III family protein  30.55 
 
 
567 aa  135  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2719  heparinase II/III family protein  30.71 
 
 
549 aa  133  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451444  normal  0.809272 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1101  hypothetical protein  30.85 
 
 
567 aa  132  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4781  heparinase II/III family protein  28.62 
 
 
596 aa  112  2e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0392  Heparinase II/III family protein  26.73 
 
 
557 aa  80.5  8e-14  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.276932  normal  0.686057 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0809  heparinase II/III family protein  25.21 
 
 
547 aa  74.7  4e-12  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00700  hypothetical protein  23.2 
 
 
541 aa  64.7  5e-09  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23430  putative heparinase  23.89 
 
 
550 aa  55.8  2e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  7.12421e-12  hitchhiker  0.00765921 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1501  heparinase II/III-like  24.11 
 
 
561 aa  50.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1481  Heparinase II/III family protein  33.64 
 
 
702 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608961  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1385  Heparinase II/III family protein  33.64 
 
 
702 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>