49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0099 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 
318 aa  641    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1194  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.73 
 
 
311 aa  152  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.82 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2070  hypothetical protein  23.67 
 
 
308 aa  94.7  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.32 
 
 
319 aa  94  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1626  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
236 aa  65.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.45 
 
 
216 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.5 
 
 
499 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0408  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.77 
 
 
372 aa  49.7  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.08 
 
 
410 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.06 
 
 
530 aa  47.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0888  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.03 
 
 
258 aa  47.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3539  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.06 
 
 
226 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3067  putative phosphatidyltransferase  30.69 
 
 
402 aa  47.8  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.802926  normal  0.32934 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.06 
 
 
226 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  0.387897 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2359  hypothetical protein  31.62 
 
 
359 aa  47.4  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278145  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  29.63 
 
 
212 aa  46.6  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4467  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.59 
 
 
226 aa  46.6  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38713  normal  0.760185 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1910  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.75 
 
 
226 aa  46.2  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5003  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.49 
 
 
238 aa  46.2  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000296609 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1803  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.5 
 
 
221 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4168  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.25 
 
 
243 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866648  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3394  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.58 
 
 
231 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2238  hypothetical protein  31.78 
 
 
367 aa  45.4  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.502937  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4241  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.58 
 
 
231 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4125  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.58 
 
 
231 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.484601  normal  0.461056 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0552  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  27.33 
 
 
315 aa  44.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5669  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.68 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.109368 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0564  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  27.33 
 
 
315 aa  45.1  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36 
 
 
233 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636256  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.73 
 
 
205 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243953 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0286  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35 
 
 
316 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.87 
 
 
203 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00859125  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  31.87 
 
 
193 aa  43.9  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0784  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  33 
 
 
229 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.46 
 
 
194 aa  43.9  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0174  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.25 
 
 
200 aa  43.5  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0624  hypothetical protein  36 
 
 
233 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2070  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.95 
 
 
276 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0999876  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  30.77 
 
 
193 aa  43.1  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33864  predicted protein  28.57 
 
 
465 aa  42.7  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0421094  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01792  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.64 
 
 
218 aa  42.7  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0564739  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.57 
 
 
428 aa  42.7  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0754  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  33 
 
 
229 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.623389  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1047  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  33 
 
 
229 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0695  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  33 
 
 
229 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0352071  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  33 
 
 
229 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_93031  predicted protein  30.95 
 
 
409 aa  42.4  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2022  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  33 
 
 
229 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>