18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0098 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0098  O-antigen and teichoic acid-like export protein  100 
 
 		 507 aa  982    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0449  polysaccharide biosynthesis protein  30.18 
 
 		 502 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.757285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2783  polysaccharide biosynthesis protein  31.01 
 
 		 494 aa  122  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2873  O-antigen and teichoic acid-like export protein  29.75 
 
 		 508 aa  109  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.793444  normal  0.427284 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  20.81 
 
 		 499 aa  74.3  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  26.79 
 
 		 495 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  26.65 
 
 		 440 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  24.32 
 
 		 539 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0259  polysaccharide biosynthesis protein  25.75 
 
 		 498 aa  53.9  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  27.06 
 
 		 463 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  20.55 
 
 		 430 aa  50.4  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  23.82 
 
 		 514 aa  50.4  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2006  polysaccharide biosynthesis protein  28.97 
 
 		 529 aa  48.5  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.300214  normal  0.433718 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  27.68 
 
 		 489 aa  47.8  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 		 495 aa  47.4  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  27.2 
 
 		 504 aa  46.6  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 		 440 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  26.6 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>