284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0094 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 222 aa  446  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  67.86 
 
 		 217 aa  261  4.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  61.21 
 
 		 223 aa  241  9e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  57.41 
 
 		 216 aa  238  5e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  62.57 
 
 		 262 aa  237  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  64.29 
 
 		 218 aa  234  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  63.27 
 
 		 218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  63.27 
 
 		 218 aa  231  5e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  61.73 
 
 		 220 aa  229  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  57.08 
 
 		 225 aa  228  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  54.09 
 
 		 239 aa  227  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  59.79 
 
 		 267 aa  224  6e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  59.79 
 
 		 267 aa  223  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  55.24 
 
 		 246 aa  223  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  56.1 
 
 		 243 aa  221  7e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  54.67 
 
 		 244 aa  221  8e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  57.22 
 
 		 270 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  58.59 
 
 		 216 aa  212  4.9999999999999996e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3083  lipoate-protein ligase B  55.83 
 
 		 255 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  55.44 
 
 		 243 aa  210  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3161  lipoate-protein ligase B  55.19 
 
 		 241 aa  209  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1745  lipoate-protein ligase B  60 
 
 		 226 aa  209  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548162  normal  0.138545 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  55.61 
 
 		 228 aa  208  5e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2371  lipoate-protein ligase B  55.71 
 
 		 255 aa  207  9e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417087  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  57.07 
 
 		 244 aa  205  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  57.07 
 
 		 244 aa  205  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0371  lipoate-protein ligase B  44.19 
 
 		 214 aa  203  2e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0131987  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  55.15 
 
 		 236 aa  202  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  50.51 
 
 		 241 aa  202  3e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  57.14 
 
 		 262 aa  202  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  57.61 
 
 		 237 aa  201  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  57.22 
 
 		 237 aa  201  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3579  lipoate-protein ligase B  50.91 
 
 		 245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1731  lipoyltransferase  53.69 
 
 		 231 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.558674  normal  0.523049 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3348  lipoate-protein ligase B  58.76 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  55.12 
 
 		 240 aa  198  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1936  lipoyltransferase  56.99 
 
 		 218 aa  198  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00922586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  57.74 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  54.68 
 
 		 241 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0120  lipoate-protein ligase B  48.86 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.580477  normal  0.0291639 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0640  lipoate-protein ligase B  42.06 
 
 		 214 aa  194  1e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5311  lipoate-protein ligase B  56.07 
 
 		 235 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_002978  WD1014  lipoate-protein ligase B  43.09 
 
 		 205 aa  188  5.999999999999999e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.449501  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3088  lipoyltransferase  53.73 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  44.97 
 
 		 209 aa  175  6e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  47.83 
 
 		 213 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  43.78 
 
 		 211 aa  158  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  44.17 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  47.19 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  45.88 
 
 		 213 aa  148  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  41.92 
 
 		 247 aa  148  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  48.31 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  43.89 
 
 		 239 aa  145  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  43.89 
 
 		 239 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  46.37 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  41.71 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  37.93 
 
 		 209 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  38.99 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  47.78 
 
 		 238 aa  142  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  39.8 
 
 		 214 aa  142  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  47.89 
 
 		 365 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  47.89 
 
 		 365 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3187  lipoate-protein ligase B  42.86 
 
 		 249 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.498526  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0053  lipoate-protein ligase B  42.86 
 
 		 257 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0626  lipoate-protein ligase B  42.86 
 
 		 254 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1374  lipoate-protein ligase B  42.86 
 
 		 249 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  45.74 
 
 		 365 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0219  lipoate-protein ligase B  42.86 
 
 		 249 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0463  lipoate-protein ligase B  42.86 
 
 		 246 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0443  lipoate-protein ligase B  42.86 
 
 		 252 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  43.48 
 
 		 238 aa  139  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0719  lipoate-protein ligase B  41.87 
 
 		 204 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24811e-18 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2641  Lipoyl(octanoyl) transferase  42.05 
 
 		 225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  36.89 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0385  lipoate-protein ligase B  40.59 
 
 		 255 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.915915  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  38.99 
 
 		 234 aa  138  7e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  43.92 
 
 		 247 aa  138  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  43.05 
 
 		 238 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2704  lipoate-protein ligase B  47.83 
 
 		 203 aa  138  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  43.05 
 
 		 238 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  39.29 
 
 		 244 aa  138  7.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  43.05 
 
 		 238 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  40.38 
 
 		 233 aa  137  8.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  42.11 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  42.86 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1599  lipoate-protein ligase B  38.46 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000739675 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  43.98 
 
 		 213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  41.5 
 
 		 212 aa  135  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2034  lipoate-protein ligase B  42.08 
 
 		 244 aa  135  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21776  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0244  lipoate-protein ligase B  40.19 
 
 		 222 aa  135  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15410  lipoate-protein ligase B  43.89 
 
 		 214 aa  135  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  44 
 
 		 232 aa  135  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  42.36 
 
 		 236 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  40.18 
 
 		 245 aa  135  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  37.86 
 
 		 231 aa  135  7.000000000000001e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  44.57 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  41.57 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  43.95 
 
 		 231 aa  133  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  42.41 
 
 		 235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  42.34 
 
 		 383 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>