More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0061 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  100 
 
 
387 aa  770    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  46.11 
 
 
402 aa  281  1e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  33.67 
 
 
384 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  41.04 
 
 
454 aa  170  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  39.19 
 
 
423 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  40.08 
 
 
457 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  32.02 
 
 
443 aa  161  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  42.01 
 
 
456 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  40 
 
 
453 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  40.91 
 
 
459 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  40.27 
 
 
455 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  40.93 
 
 
430 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  52.23 
 
 
318 aa  155  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  50.32 
 
 
313 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  35.8 
 
 
459 aa  153  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  39.91 
 
 
455 aa  152  8e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  36.26 
 
 
442 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  30.27 
 
 
413 aa  150  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  37.7 
 
 
392 aa  150  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  38.7 
 
 
460 aa  147  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  48.67 
 
 
229 aa  146  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  43.18 
 
 
450 aa  146  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  29.37 
 
 
445 aa  144  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  39.34 
 
 
415 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  43.56 
 
 
391 aa  143  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  41.21 
 
 
288 aa  143  6e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  50.69 
 
 
392 aa  139  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  38.18 
 
 
491 aa  139  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  41.01 
 
 
382 aa  139  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  47.1 
 
 
305 aa  139  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  28.64 
 
 
447 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  46.3 
 
 
369 aa  138  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  28.64 
 
 
447 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  45.68 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  45.36 
 
 
328 aa  136  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  53.08 
 
 
300 aa  136  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2835  putative transmembrane protein  55.47 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.499363  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  49.62 
 
 
305 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3080  Peptidase M23  55.47 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.387864  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2715  Peptidase M23  55.47 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.795153  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  53.45 
 
 
376 aa  133  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  53.45 
 
 
372 aa  133  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  37.17 
 
 
446 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  39.3 
 
 
319 aa  132  7.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  50.77 
 
 
296 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  48.46 
 
 
305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  48.46 
 
 
305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  48.46 
 
 
305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  46.4 
 
 
299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  47.97 
 
 
318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  43.17 
 
 
332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  47.33 
 
 
315 aa  130  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  36.65 
 
 
305 aa  131  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  35.61 
 
 
327 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  38.36 
 
 
440 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  48.36 
 
 
292 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  49.61 
 
 
290 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  49.22 
 
 
328 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  48.84 
 
 
316 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  39.56 
 
 
442 aa  129  7.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  49.23 
 
 
301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  51.88 
 
 
243 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  38.57 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  38.07 
 
 
439 aa  127  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  39.64 
 
 
316 aa  126  6e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  40.88 
 
 
310 aa  126  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  55.17 
 
 
340 aa  126  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  36.73 
 
 
324 aa  126  7e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  51.15 
 
 
238 aa  126  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  50 
 
 
375 aa  126  8.000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  38.64 
 
 
313 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4455  M23/M37 peptidase domain-containing protein  32.61 
 
 
298 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  47.69 
 
 
301 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  48.85 
 
 
233 aa  125  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  53.45 
 
 
411 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  35.85 
 
 
330 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3119  peptidase M23B  50.77 
 
 
310 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0986889  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  51.52 
 
 
238 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  43.54 
 
 
303 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  50.85 
 
 
367 aa  124  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  46.05 
 
 
316 aa  124  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  33.33 
 
 
282 aa  124  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  50 
 
 
321 aa  123  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  48.03 
 
 
332 aa  123  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  50 
 
 
414 aa  123  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  43.8 
 
 
288 aa  123  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  51.72 
 
 
482 aa  123  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  36.96 
 
 
325 aa  122  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  46.15 
 
 
305 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  43.31 
 
 
394 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  30.27 
 
 
300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  38.6 
 
 
299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  47.41 
 
 
314 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  35.83 
 
 
325 aa  122  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  46.72 
 
 
299 aa  120  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  47.01 
 
 
363 aa  120  3.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  42.74 
 
 
295 aa  119  6e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  48.78 
 
 
216 aa  119  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  50 
 
 
524 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  43.57 
 
 
309 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>