More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0056 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0056  peptidase M23B  100 
 
 		 414 aa  786    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2546  peptidase M23B  48.65 
 
 		 413 aa  232  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.532046 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0575  peptidase M23B  43.39 
 
 		 405 aa  203  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0163  Peptidase M23  31.77 
 
 		 463 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0448  peptidase M23B  30.75 
 
 		 450 aa  124  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.201796  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0524  peptidase M23B  29.91 
 
 		 469 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.204903  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1233  peptidase M23B  43.71 
 
 		 491 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0415  hypothetical protein  29.56 
 
 		 445 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0567  peptidase M23B  29.7 
 
 		 471 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0165  peptidase M23B  30.21 
 
 		 448 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0257  peptidase M23B  29.7 
 
 		 461 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4222  peptidase M23B  31.73 
 
 		 430 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.831503  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1473  peptidase M23B  27.01 
 
 		 446 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.758633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3452  peptidase M23B  30.28 
 
 		 423 aa  104  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106399  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2932  peptidase M23  27.03 
 
 		 459 aa  104  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4732  Peptidase M23  30.9 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189626  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0099  peptidase M23  29.82 
 
 		 455 aa  99  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2071  peptidase M23B  30.37 
 
 		 477 aa  97.8  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.435077  normal  0.225053 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2245  Peptidase M23  29.19 
 
 		 458 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587035  normal  0.487877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2563  Peptidase M23  28.65 
 
 		 466 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130125 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  29.03 
 
 		 394 aa  94.7  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2288  peptidase M23B  28.65 
 
 		 466 aa  94  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103425 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4723  peptidase M23B  25.95 
 
 		 350 aa  88.6  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452825  normal  0.12326 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0644  Peptidase M23  25.95 
 
 		 457 aa  88.2  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0328694 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  25.96 
 
 		 388 aa  87  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1061  peptidase M23B  26.76 
 
 		 440 aa  86.3  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3015  peptidase M23B  27.48 
 
 		 478 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2161  peptidase M23  36.57 
 
 		 436 aa  85.5  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00288344  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2253  hypothetical protein  36.57 
 
 		 436 aa  85.1  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.945563  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  40.83 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  31.45 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0904  peptidase M23B  36.8 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54116  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2795  peptidase M23B  25.78 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  35.38 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  41.03 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3022  Peptidase M23  38.39 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.051505 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  26.49 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  26.37 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1838  hypothetical protein  27.4 
 
 		 449 aa  80.1  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.331225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1771  hypothetical protein  27.4 
 
 		 449 aa  80.1  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  35.06 
 
 		 481 aa  79.7  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  35.76 
 
 		 445 aa  79.7  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  32.2 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  33.08 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  39.83 
 
 		 372 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  30.62 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  30.08 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  26.37 
 
 		 541 aa  77  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2708  Peptidase M23  33.33 
 
 		 455 aa  76.3  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  23.95 
 
 		 396 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3212  peptidase M23B  23.89 
 
 		 417 aa  75.9  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.321571  normal  0.507005 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  30.94 
 
 		 373 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  24.54 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4343  Peptidase M23  39.32 
 
 		 248 aa  75.5  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  33.09 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  36.44 
 
 		 432 aa  75.1  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  32.41 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  33.61 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  38.98 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  27.34 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0323  M23 peptidase domain-containing protein  21.68 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  21.28 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  38.98 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0059  M24/M37 family peptidase  30.47 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.447213  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4471  peptidase M23B  29.41 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.211003  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  35.25 
 
 		 372 aa  72.8  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  23.2 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  31.62 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  35.71 
 
 		 468 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  32.34 
 
 		 446 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  22.94 
 
 		 399 aa  72  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  30.51 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  31.36 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3950  hypothetical protein  34.03 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.50769 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  32.72 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03471  protease with a role in cell division  34.03 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0092  Peptidase M23  34.03 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0095  hypothetical protein  34.03 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3825  hypothetical protein  34.03 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  36.44 
 
 		 582 aa  70.5  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4041  hypothetical protein  34.03 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  31.55 
 
 		 447 aa  70.5  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4986  hypothetical protein  34.03 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03422  hypothetical protein  34.03 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  31.55 
 
 		 447 aa  70.5  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4117  hypothetical protein  34.03 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3904  hypothetical protein  33.79 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4091  hypothetical protein  33.79 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3923  hypothetical protein  33.79 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  35.83 
 
 		 494 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  35.04 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3985  hypothetical protein  33.79 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.910741 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4030  hypothetical protein  33.79 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  33.33 
 
 		 477 aa  69.7  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0683  Peptidase M23  34.27 
 
 		 472 aa  69.7  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295587 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0525  M23/M37 peptidase domain protein  34.27 
 
 		 472 aa  69.7  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3807  peptidase M23B  27.82 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.759615  normal  0.544086 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  33.88 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  25.27 
 
 		 374 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>