271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0046 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0046  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  100 
 
 
271 aa  543  1e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4752  PhzF family phenazine biosynthesis protein  59.93 
 
 
264 aa  295  4e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460768  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0653  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  57.99 
 
 
273 aa  293  3e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1877  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.62 
 
 
261 aa  205  7e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1103  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  47.37 
 
 
277 aa  204  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.968305  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1565  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.78 
 
 
261 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18020  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.4 
 
 
261 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.229067  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2134  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.85 
 
 
263 aa  188  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2098  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.61 
 
 
269 aa  185  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4529  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  43.28 
 
 
260 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765532  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1583  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.64 
 
 
275 aa  177  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1217  hypothetical protein  36.19 
 
 
262 aa  175  6e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1211  hypothetical protein  36.19 
 
 
262 aa  175  8e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0989  phenazine-like biosynthesis protein  38.01 
 
 
263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598359  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0616  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.75 
 
 
270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404723  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0790  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.4 
 
 
263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3344  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.43 
 
 
268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2334  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.45 
 
 
281 aa  172  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.486392 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2001  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.55 
 
 
287 aa  172  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1124  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.45 
 
 
259 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1499  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  36.36 
 
 
270 aa  170  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0704716  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0915  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.12 
 
 
270 aa  170  3e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.577735  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2693  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.3 
 
 
264 aa  168  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3504  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.76 
 
 
281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281882  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2672  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.38 
 
 
262 aa  166  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2465  hypothetical protein  39.1 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1968  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.72 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28280  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.33 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00267906  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3642  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.95 
 
 
262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0208065  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2845  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.03 
 
 
273 aa  163  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.236505  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3143  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.97 
 
 
260 aa  163  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.373465  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3883  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.09 
 
 
262 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02191  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  33.96 
 
 
263 aa  161  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0600  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.24 
 
 
266 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4473  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.04 
 
 
277 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278924  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0211  hypothetical protein  33.58 
 
 
264 aa  159  7e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0573  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  43.49 
 
 
266 aa  158  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1552  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.37 
 
 
262 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1488  hypothetical protein  34.09 
 
 
261 aa  156  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4367  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  40.38 
 
 
264 aa  156  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0608  phenazine biosynthesis protein PhzF family  42.86 
 
 
266 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4315  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.37 
 
 
262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.366101  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1349  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.36 
 
 
258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1495  hypothetical protein  33.71 
 
 
261 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0096  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  42.16 
 
 
267 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4574  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.33 
 
 
260 aa  152  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00533064  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1106  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.85 
 
 
262 aa  151  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0023  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.46 
 
 
258 aa  151  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0589  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.52 
 
 
273 aa  151  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00061091 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3058  hypothetical protein  36.74 
 
 
265 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8947  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.77 
 
 
262 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1102  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  36.15 
 
 
263 aa  149  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0628  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.55 
 
 
266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3116  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.7 
 
 
263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00210126  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1284  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.1 
 
 
273 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01000  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.19 
 
 
261 aa  145  8.000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.265489 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.6 
 
 
300 aa  145  9e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001406  phenazine biosynthesis PhzF family protein  34.21 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2070  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.57 
 
 
275 aa  138  7.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.35447 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1598  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  38.01 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.847307 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06618  epimerase  34.94 
 
 
266 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0771  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.66 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.659452 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000097  phenazine biosynthesis PhzF family protein  36.26 
 
 
266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.55856  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1506  putative phenazine biosynthesis-like protein  33.58 
 
 
266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0733788  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0048  phenazine biosynthesis protein PhzF family  26.24 
 
 
264 aa  123  4e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.521637  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2294  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31 
 
 
265 aa  122  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.84 
 
 
268 aa  118  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0415  phenazine biosynthesis protein  28.24 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3444  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.33 
 
 
282 aa  109  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0134295 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0680  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.92 
 
 
283 aa  108  8.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000121985 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0187  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.81 
 
 
280 aa  106  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696184  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0671  seryl-tRNA synthetase (Serine--tRNA ligase; SerRS)  33.83 
 
 
210 aa  102  7e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2271  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.97 
 
 
293 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000390  phenazine biosynthesis protein PhzF  29.41 
 
 
251 aa  96.3  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46420  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF-like protein  30.14 
 
 
292 aa  95.9  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0927  hypothetical protein  29.63 
 
 
279 aa  94.7  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3317  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.87 
 
 
302 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0849237  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2184  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  27.66 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000556407  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.52 
 
 
340 aa  92.4  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2389  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.95 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3538  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.99 
 
 
283 aa  91.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00577442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1989  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.35 
 
 
279 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.797447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6782  putative phenazine biosynthesis protein  29.75 
 
 
278 aa  89.4  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0835253 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2310  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.27 
 
 
273 aa  89.4  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1761  hypothetical protein  31.64 
 
 
297 aa  89  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1510  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.94 
 
 
276 aa  88.2  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0741  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.52 
 
 
311 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.75 
 
 
278 aa  87.8  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2374  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.55 
 
 
294 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1580  hypothetical protein  32.12 
 
 
297 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.136945  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1696  hypothetical protein  32.12 
 
 
297 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.778607 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1759  hypothetical protein  32.12 
 
 
297 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1698  hypothetical protein  32.12 
 
 
297 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874362  normal  0.235458 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2240  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.46 
 
 
299 aa  86.3  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000508525  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5876  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.85 
 
 
279 aa  86.3  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.201483 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1741  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  31.51 
 
 
294 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46630  hypothetical protein  30.15 
 
 
278 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000930854  hitchhiker  0.00000437655 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2353  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.51 
 
 
294 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3846  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.41 
 
 
291 aa  85.5  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0926  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.17 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.591994 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>