More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_5097 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  100 
 
 
362 aa  729    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  95.58 
 
 
317 aa  597  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  75.95 
 
 
310 aa  496  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  68.15 
 
 
319 aa  428  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  67.41 
 
 
310 aa  426  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  68.27 
 
 
310 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  66.56 
 
 
310 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  68.35 
 
 
330 aa  417  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  68.57 
 
 
336 aa  414  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  67.41 
 
 
331 aa  413  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  66.03 
 
 
348 aa  409  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  66.67 
 
 
331 aa  403  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  64.89 
 
 
330 aa  403  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  68.47 
 
 
309 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  63.81 
 
 
359 aa  399  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  64.48 
 
 
348 aa  398  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  64.42 
 
 
330 aa  392  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  64.67 
 
 
333 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  64.67 
 
 
333 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  63.58 
 
 
346 aa  393  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  64.67 
 
 
333 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  64.86 
 
 
332 aa  385  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  64.42 
 
 
340 aa  381  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  66.14 
 
 
325 aa  380  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  63.9 
 
 
333 aa  379  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  63.87 
 
 
335 aa  378  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  64.22 
 
 
327 aa  380  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  63.12 
 
 
313 aa  377  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  64.24 
 
 
329 aa  376  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  60.76 
 
 
353 aa  372  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  57.68 
 
 
318 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  57.96 
 
 
333 aa  370  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  65.18 
 
 
344 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3024  thioredoxin reductase  65.06 
 
 
325 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.352085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  58.44 
 
 
318 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  61.09 
 
 
318 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  61.99 
 
 
361 aa  364  1e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  61.01 
 
 
317 aa  364  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  57.19 
 
 
314 aa  362  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  60.7 
 
 
325 aa  362  6e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  57.19 
 
 
314 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  57.14 
 
 
319 aa  358  9e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1914  thioredoxin reductase  58.79 
 
 
325 aa  358  9e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  55.24 
 
 
311 aa  355  5e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  55.91 
 
 
311 aa  354  1e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0214  thioredoxin reductase  63.78 
 
 
329 aa  353  2e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  58.54 
 
 
320 aa  353  2e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  56.69 
 
 
311 aa  352  5e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  56.54 
 
 
314 aa  346  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  55.1 
 
 
311 aa  346  4e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  54.86 
 
 
311 aa  345  5e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  55.59 
 
 
313 aa  345  8.999999999999999e-94  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  57.14 
 
 
334 aa  344  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  53.92 
 
 
311 aa  341  1e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  53.01 
 
 
339 aa  340  2e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  51.89 
 
 
311 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  55.38 
 
 
320 aa  338  9.999999999999999e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  52.88 
 
 
361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  54.78 
 
 
345 aa  335  5.999999999999999e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  55.52 
 
 
321 aa  334  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  54.69 
 
 
332 aa  334  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  55.23 
 
 
314 aa  332  5e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  50.31 
 
 
319 aa  332  7.000000000000001e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3650  thioredoxin reductase  63.1 
 
 
327 aa  331  1e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  53.35 
 
 
324 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  53 
 
 
321 aa  325  7e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  51.5 
 
 
335 aa  325  7e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2943  thioredoxin reductase  52.22 
 
 
333 aa  325  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  53.67 
 
 
324 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  53.5 
 
 
321 aa  324  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1443  thioredoxin reductase  49.68 
 
 
352 aa  323  3e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  49.84 
 
 
317 aa  322  5e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3781  thioredoxin reductase  50.31 
 
 
316 aa  322  5e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0763  thioredoxin reductase  50.16 
 
 
319 aa  322  5e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  54.4 
 
 
321 aa  322  8e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  49.84 
 
 
324 aa  322  9.000000000000001e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1354  thioredoxin reductase  51.12 
 
 
313 aa  321  9.999999999999999e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  53.85 
 
 
312 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  52.78 
 
 
317 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3686  thioredoxin reductase  49.69 
 
 
316 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000489943  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  51.26 
 
 
331 aa  320  3e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  49.39 
 
 
334 aa  320  3e-86  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3139  thioredoxin-disulfide reductase  50.74 
 
 
338 aa  319  3.9999999999999996e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  49.2 
 
 
317 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0488  thioredoxin reductase  50.62 
 
 
316 aa  319  5e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.723059  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  51.25 
 
 
458 aa  319  5e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0023  thioredoxin reductase  49.52 
 
 
316 aa  319  6e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.459849  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  47.81 
 
 
320 aa  319  6e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  47.81 
 
 
320 aa  319  6e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  51.27 
 
 
460 aa  318  7e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003744  thioredoxin reductase  50.15 
 
 
319 aa  318  7e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.891826  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  48 
 
 
316 aa  318  9e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  53.99 
 
 
325 aa  317  2e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  50.8 
 
 
322 aa  317  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4609  thioredoxin reductase  53.77 
 
 
321 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0752942  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  54.75 
 
 
320 aa  317  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  49.21 
 
 
323 aa  316  3e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  49.21 
 
 
323 aa  316  3e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  54.09 
 
 
321 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2959  thioredoxin reductase  52.17 
 
 
317 aa  317  3e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.457436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>