160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_5080 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_5080  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  421  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.6626  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4562  transcriptional regulator PadR family protein  96.23 
 
 		 211 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605184  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  60.39 
 
 		 205 aa  221  9e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5920  transcriptional regulator, PadR-like family  64 
 
 		 198 aa  220  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  54.81 
 
 		 224 aa  211  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  58.1 
 
 		 201 aa  206  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  57.22 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  57.78 
 
 		 212 aa  201  6e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  56.98 
 
 		 213 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  51.17 
 
 		 212 aa  193  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  59.78 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  51.74 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  53.12 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4200  transcriptional regulator, PadR-like family  51.96 
 
 		 209 aa  186  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  58.29 
 
 		 252 aa  185  4e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  49.79 
 
 		 272 aa  182  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  49.75 
 
 		 202 aa  180  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2137  PadR family transcriptional regulator  55.62 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  60 
 
 		 181 aa  178  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  63.89 
 
 		 181 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  57.84 
 
 		 181 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  60.56 
 
 		 184 aa  171  6.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  57.07 
 
 		 180 aa  170  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  47.8 
 
 		 203 aa  168  7e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3510  transcriptional regulator, PadR-like family  46.84 
 
 		 198 aa  160  9e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5375  PadR family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 181 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5464  PadR family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 181 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5751  PadR family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 181 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.410016 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4194  transcriptional regulator, PadR-like family  54.49 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  28.42 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1535  transcriptional regulator, PadR-like family  36.72 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918183  normal  0.0405313 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  26.37 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  25 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  26.37 
 
 		 165 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  26.37 
 
 		 165 aa  60.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  26.37 
 
 		 165 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  26.37 
 
 		 165 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  26.26 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  40.78 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4407  transcriptional regulator protein-like protein  52.83 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0291759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3181  transcriptional regulator, PadR-like family  48.15 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000117068  hitchhiker  0.000000000506359 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  24.43 
 
 		 165 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1958  transcriptional regulator, PadR-like family  32.26 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  27.46 
 
 		 179 aa  51.6  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  29.17 
 
 		 174 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 152 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  33.83 
 
 		 178 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0038  transcriptional regulator, PadR-like family  37.37 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 168 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  22.83 
 
 		 185 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  29.12 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  33.68 
 
 		 177 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 183 aa  48.5  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  22.83 
 
 		 185 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  37.21 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  22.11 
 
 		 185 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 372 aa  46.6  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1303  PadR-like family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 156 aa  46.2  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.213126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  25.52 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  27.43 
 
 		 175 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 176 aa  45.8  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  32.61 
 
 		 121 aa  45.8  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2019  transcriptional regulator, PadR-like family  30.25 
 
 		 160 aa  45.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.41981 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  29.35 
 
 		 232 aa  45.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 159 aa  45.4  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 103 aa  45.1  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  27.37 
 
 		 187 aa  45.1  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1858  PadR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 104 aa  44.3  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000789415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 114 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 122 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2956  PadR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 105 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1999  transcriptional regulator, PadR-like family  35.11 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.893773  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 174 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  26.59 
 
 		 168 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4106  transcriptional repressor PadR  21.05 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  34.12 
 
 		 114 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  28 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  27.51 
 
 		 179 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 127 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 179 aa  43.9  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  29.66 
 
 		 172 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0062  PadR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 113 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 154 aa  43.5  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1133  transcriptional repressor PadR  21.05 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  normal  0.874315 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  32.65 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7568  transcriptional regulator, PadR-like family  35.9 
 
 		 277 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  31.82 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1507  PadR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 152 aa  43.5  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 112 aa  43.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  44.23 
 
 		 150 aa  43.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  29.59 
 
 		 107 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  29.59 
 
 		 107 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0828  transcriptional regulator, PadR-like family  25.24 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.845057 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>