More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_5049 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  52.56 
 
 		 1032 aa  939    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0167  UvrD/REP helicase  48.54 
 
 		 1161 aa  900    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  58.33 
 
 		 1050 aa  1099    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  40.5 
 
 		 1132 aa  716    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  39.66 
 
 		 1232 aa  676    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3744  UvrD/REP helicase  52.14 
 
 		 1124 aa  954    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  58.18 
 
 		 1089 aa  1123    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0634  UvrD/REP helicase  59 
 
 		 1001 aa  1110    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5049  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1062 aa  2103    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107382 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4539  UvrD/REP helicase  92 
 
 		 1067 aa  1835    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  39.36 
 
 		 1033 aa  620  1e-176  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1930  UvrD/REP helicase  38.81 
 
 		 1082 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00120508  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  43.81 
 
 		 1075 aa  609  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3266  DNA helicase II, putative  44.8 
 
 		 1078 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2402  UvrD/REP helicase  39.34 
 
 		 1027 aa  605  1.0000000000000001e-171  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3499  ATP-dependent DNA helicase UvrD  38.92 
 
 		 1089 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0992  UvrD/REP helicase  65.6 
 
 		 1156 aa  572  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7469  ATP-dependent DNA helicase  64.13 
 
 		 428 aa  530  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0022  UvrD/REP helicase  39.87 
 
 		 1174 aa  512  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3587  UvrD/REP helicase  56.67 
 
 		 446 aa  451  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249291  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2545  hypothetical protein  52.17 
 
 		 408 aa  439  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0632  hypothetical protein  51.43 
 
 		 414 aa  436  1e-120  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2483  UvrD/REP helicase  54.16 
 
 		 1127 aa  432  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  53.61 
 
 		 1244 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1328  hypothetical protein  51.81 
 
 		 411 aa  416  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2955  hypothetical protein  50.6 
 
 		 411 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1268  PHP domain protein  42.55 
 
 		 414 aa  350  1e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  33.08 
 
 		 707 aa  278  3e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  33.08 
 
 		 705 aa  264  6e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  28.77 
 
 		 731 aa  261  5.0000000000000005e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.11 
 
 		 795 aa  260  8e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.01 
 
 		 718 aa  258  4e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.52 
 
 		 737 aa  256  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  32.48 
 
 		 768 aa  255  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.08 
 
 		 742 aa  253  9.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  35.14 
 
 		 671 aa  252  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  34.3 
 
 		 671 aa  249  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  34.3 
 
 		 671 aa  248  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  31.71 
 
 		 741 aa  248  4.9999999999999997e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.38 
 
 		 751 aa  245  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  32.75 
 
 		 728 aa  244  7e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.06 
 
 		 786 aa  243  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  32.97 
 
 		 739 aa  240  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  31.42 
 
 		 727 aa  239  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2836  DNA helicase II  29.46 
 
 		 858 aa  238  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  28.08 
 
 		 735 aa  238  5.0000000000000005e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4951  UvrD/REP helicase  32.7 
 
 		 797 aa  237  9e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120082  decreased coverage  0.0000000995546 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  29.7 
 
 		 723 aa  236  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  32.61 
 
 		 798 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  30.32 
 
 		 678 aa  235  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0233  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.72 
 
 		 639 aa  235  3e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0748  UvrD/REP helicase  32.81 
 
 		 653 aa  234  7.000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00311747  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  33.13 
 
 		 725 aa  233  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0678  UvrD/REP helicase  32.7 
 
 		 783 aa  232  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0563949  normal  0.0143494 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.05 
 
 		 732 aa  232  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2563  UvrD/REP helicase  30.7 
 
 		 825 aa  232  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2092  ATP-dependent DNA helicase Rep  32.39 
 
 		 783 aa  232  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0227682  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  32.48 
 
 		 795 aa  232  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0766  UvrD/REP helicase  32.39 
 
 		 786 aa  232  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.423643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0367  UvrD/REP helicase  32.25 
 
 		 795 aa  231  6e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.944301  normal  0.78423 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1536  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.83 
 
 		 768 aa  230  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.27 
 
 		 851 aa  230  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  32.31 
 
 		 726 aa  229  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0595  UvrD/REP helicase  32.65 
 
 		 790 aa  228  4e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77908 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1988  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.86 
 
 		 876 aa  228  5.0000000000000005e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2822  UvrD/REP helicase  30.06 
 
 		 826 aa  227  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.467404 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.92 
 
 		 715 aa  226  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  29.54 
 
 		 783 aa  226  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.3 
 
 		 730 aa  225  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.3 
 
 		 730 aa  225  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  29.25 
 
 		 764 aa  225  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0211  UvrD/REP helicase  30.95 
 
 		 760 aa  225  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0344755 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.9 
 
 		 747 aa  225  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.51 
 
 		 725 aa  225  4e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.9 
 
 		 751 aa  224  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  33.9 
 
 		 751 aa  224  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.9 
 
 		 751 aa  224  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.73 
 
 		 747 aa  224  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.9 
 
 		 747 aa  224  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.73 
 
 		 753 aa  224  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.73 
 
 		 753 aa  224  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0356  UvrD/Rep family helicase  27.32 
 
 		 630 aa  224  6e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.190335  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  33.9 
 
 		 753 aa  224  7e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.9 
 
 		 751 aa  224  7e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  29.04 
 
 		 724 aa  224  7e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  29.89 
 
 		 845 aa  223  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  28.39 
 
 		 625 aa  223  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2140  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.92 
 
 		 667 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.90387  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0963  helicase II - UvrD/PcrA  28.12 
 
 		 638 aa  223  1.9999999999999999e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.82 
 
 		 756 aa  223  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.74 
 
 		 694 aa  223  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  29.15 
 
 		 817 aa  223  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0599  DNA-dependent helicase II  30.66 
 
 		 717 aa  222  3.9999999999999997e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  33.5 
 
 		 757 aa  222  3.9999999999999997e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  31.04 
 
 		 736 aa  222  3.9999999999999997e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2037  UvrD/REP helicase  29.04 
 
 		 850 aa  221  7e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114912  normal  0.635195 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0932  putative DNA helicase II  28.84 
 
 		 816 aa  221  7e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.156274  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.45 
 
 		 768 aa  221  7.999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.49 
 
 		 741 aa  221  7.999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.17 
 
 		 751 aa  221  7.999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>