More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_5032 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_5032  prephenate dehydratase  100 
 
 		 318 aa  622  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4522  prephenate dehydratase  92.14 
 
 		 318 aa  560  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  60.97 
 
 		 305 aa  353  2.9999999999999997e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2105  prephenate dehydratase  57.1 
 
 		 318 aa  310  2e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.547731 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0268  Prephenate dehydratase  57.14 
 
 		 311 aa  308  9e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0121  Prephenate dehydratase  53.87 
 
 		 305 aa  295  8e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2485  prephenate dehydratase  51.11 
 
 		 349 aa  285  7e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  50.79 
 
 		 315 aa  285  8e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0071  prephenate dehydratase  50.63 
 
 		 324 aa  277  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3053  prephenate dehydratase  48.89 
 
 		 315 aa  276  4e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0141  Prephenate dehydratase  51.28 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3187  Prephenate dehydratase  50.31 
 
 		 322 aa  269  4e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.019372 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0282  Prephenate dehydratase  51.77 
 
 		 326 aa  265  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.209842 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0138  prephenate dehydratase  49.82 
 
 		 327 aa  260  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1594  prephenate dehydratase  47.77 
 
 		 317 aa  260  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0572712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0097  Prephenate dehydratase  50.65 
 
 		 314 aa  249  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0315701 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0245  Prephenate dehydratase  49.53 
 
 		 314 aa  249  4e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00775166  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01130  prephenate dehydratase  47.25 
 
 		 316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13872  prephenate dehydratase  46.84 
 
 		 321 aa  236  3e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0100  Prephenate dehydratase  48.23 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863601  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5662  prephenate dehydratase  47.11 
 
 		 312 aa  228  8e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.963646  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0377  Prephenate dehydratase  43.44 
 
 		 335 aa  224  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5415  prephenate dehydratase  48.11 
 
 		 315 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5034  prephenate dehydratase  48.11 
 
 		 315 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431184  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5122  prephenate dehydratase  48.11 
 
 		 315 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1145  prephenate dehydratase  46.32 
 
 		 309 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0149983  normal  0.0340431 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01190  prephenate dehydratase  48.08 
 
 		 301 aa  212  5.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06790  prephenate dehydratase  40.75 
 
 		 325 aa  199  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.299471  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0218  Prephenate dehydratase  50 
 
 		 314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  45.05 
 
 		 277 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  45.05 
 
 		 277 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  44.69 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0145  Prephenate dehydratase  44.62 
 
 		 311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  38.3 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  40.81 
 
 		 272 aa  169  5e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  42.34 
 
 		 386 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  37.87 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  37.91 
 
 		 358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  37.55 
 
 		 359 aa  164  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  41.48 
 
 		 280 aa  163  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  37.18 
 
 		 359 aa  162  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  38.77 
 
 		 360 aa  161  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  44.16 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  37.45 
 
 		 358 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  40.43 
 
 		 365 aa  161  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  37.45 
 
 		 276 aa  160  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0176  chorismate mutase / prephenate dehydratase  41.18 
 
 		 368 aa  160  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  41.11 
 
 		 306 aa  159  5e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  33.58 
 
 		 277 aa  159  8e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  33.67 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  38.41 
 
 		 279 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  38.91 
 
 		 402 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  37.32 
 
 		 364 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  37.32 
 
 		 367 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.64 
 
 		 358 aa  155  7e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  37.32 
 
 		 364 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  37.32 
 
 		 364 aa  155  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  34.07 
 
 		 278 aa  155  9e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  37.09 
 
 		 365 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  39.27 
 
 		 374 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  36.36 
 
 		 364 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.5 
 
 		 373 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  37.32 
 
 		 364 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  34.23 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  38.55 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.32 
 
 		 364 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  40.94 
 
 		 367 aa  153  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  36 
 
 		 365 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  37.32 
 
 		 364 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40 
 
 		 358 aa  152  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  40 
 
 		 358 aa  152  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.77 
 
 		 360 aa  152  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  35.64 
 
 		 382 aa  151  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  35.64 
 
 		 365 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.55 
 
 		 368 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1193  chorismate mutase  36 
 
 		 366 aa  150  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  40.73 
 
 		 371 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3051  Prephenate dehydratase  37.46 
 
 		 286 aa  151  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  42.05 
 
 		 706 aa  149  5e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  36.86 
 
 		 288 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  37.09 
 
 		 359 aa  149  6e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  39.05 
 
 		 355 aa  149  8e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  35.69 
 
 		 356 aa  148  9e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  36.5 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.82 
 
 		 362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  38.77 
 
 		 374 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2539  chorismate mutase  38.91 
 
 		 399 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.409768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4445  prephenate dehydratase  35.51 
 
 		 274 aa  148  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  35.87 
 
 		 382 aa  145  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  38.41 
 
 		 374 aa  146  6e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  37.82 
 
 		 371 aa  145  6e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  36.45 
 
 		 372 aa  145  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  32.85 
 
 		 356 aa  145  7.0000000000000006e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  37.68 
 
 		 360 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  36.24 
 
 		 413 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  38.71 
 
 		 361 aa  145  8.000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  36.33 
 
 		 360 aa  145  8.000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0568  chorismate mutase  40.36 
 
 		 362 aa  145  9e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  32.97 
 
 		 359 aa  145  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1186  prephenate dehydratase  36 
 
 		 393 aa  144  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.343107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>