48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_5017 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_5017  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  246  6e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000206604 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4507  hypothetical protein  93.44 
 
 
122 aa  231  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6315  membrane protein-like protein  64.52 
 
 
109 aa  127  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3816  hypothetical protein  59.81 
 
 
121 aa  124  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911141 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2130  hypothetical protein  60.44 
 
 
110 aa  122  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.733046  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2861  hypothetical protein  56.36 
 
 
116 aa  121  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147308  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1160  protein of unknown function DUF485  50.88 
 
 
115 aa  120  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280766  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3374  protein of unknown function DUF485  60.19 
 
 
119 aa  117  7.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3168  protein of unknown function DUF485  58.51 
 
 
114 aa  116  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0533569  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0070  protein of unknown function DUF485  54.72 
 
 
118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12110  predicted membrane protein  53.15 
 
 
114 aa  113  7.999999999999999e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.185749  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4563  hypothetical protein  54.95 
 
 
116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.973146  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2140  hypothetical protein  52.73 
 
 
138 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533174  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4129  hypothetical protein  51.4 
 
 
105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.660738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4054  hypothetical protein  51.4 
 
 
105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.785898  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4283  hypothetical protein  50.47 
 
 
105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03070  predicted membrane protein  51.04 
 
 
110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1395  protein of unknown function DUF485  49.56 
 
 
126 aa  108  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000134862 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1377  hypothetical protein  50 
 
 
126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0218  protein of unknown function DUF485  47.66 
 
 
133 aa  104  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0348  hypothetical protein  52.08 
 
 
120 aa  103  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.614159  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1968  protein of unknown function DUF485  51.46 
 
 
122 aa  102  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.611939  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06900  predicted membrane protein  44.14 
 
 
124 aa  100  5e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4126  protein of unknown function DUF485  45.45 
 
 
132 aa  99.8  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1813  protein of unknown function DUF485  47.32 
 
 
115 aa  96.7  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0695  protein of unknown function DUF485  50.89 
 
 
118 aa  90.1  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1074  protein of unknown function DUF485  45.71 
 
 
112 aa  89.7  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111715  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13330  predicted membrane protein  51.06 
 
 
136 aa  89.4  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221279  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3658  protein of unknown function DUF485  45.26 
 
 
111 aa  85.5  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285838  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5173  protein of unknown function DUF485  45.76 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2995  protein of unknown function DUF485  45.71 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.987637  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0828  protein of unknown function DUF485  30.21 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0144  hypothetical protein  29.7 
 
 
104 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1339  hypothetical protein  29.67 
 
 
102 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1725  hypothetical protein  29.09 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.370617  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1702  hypothetical protein  30.77 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1776  hypothetical protein  30.77 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.298522  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1634  hypothetical protein  30.77 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1479  hypothetical protein  30.77 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1489  hypothetical protein  30.77 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0531536  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1517  hypothetical protein  30.77 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.768712  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1522  hypothetical protein  30.77 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1329  hypothetical protein  32.29 
 
 
113 aa  45.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392251  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2636  hypothetical protein  25.25 
 
 
102 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.236815  normal  0.0699685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2623  hypothetical protein  25.25 
 
 
102 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2486  hypothetical protein  25.25 
 
 
102 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.424644  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3273  hypothetical protein  25.25 
 
 
102 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3287  hypothetical protein  32.81 
 
 
102 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>