More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_5004 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4490  glycosyl transferase, group 1  81.57 
 
 
398 aa  659    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5004  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
435 aa  859    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000372843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6389  glycosyl transferase group 1  51.3 
 
 
387 aa  436  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  34.74 
 
 
394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  33.57 
 
 
384 aa  209  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 
391 aa  201  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  35.82 
 
 
392 aa  194  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  38.37 
 
 
404 aa  192  9e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  34.12 
 
 
401 aa  183  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  37.13 
 
 
390 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  38.32 
 
 
393 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  32.73 
 
 
392 aa  169  8e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 
410 aa  168  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  36.01 
 
 
391 aa  167  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  34.96 
 
 
409 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  35.84 
 
 
403 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  36.39 
 
 
445 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  34.65 
 
 
426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1077  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 
402 aa  145  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000145174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  35.5 
 
 
415 aa  139  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 
414 aa  129  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 
415 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1095  glycosyl transferase group 1  33.87 
 
 
376 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174275  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  31.41 
 
 
401 aa  124  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5224  glycosyl transferase group 1  35.26 
 
 
384 aa  122  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1203  glycosyl transferase, group 1  32.81 
 
 
386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359152  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
403 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  31.64 
 
 
405 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  24.92 
 
 
401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 
403 aa  117  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
404 aa  111  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 
426 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 
353 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0177  glycosyl transferase group 1  31.32 
 
 
445 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0643614  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  29.93 
 
 
452 aa  92  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 
418 aa  88.2  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 
413 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  29.35 
 
 
413 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
414 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 
424 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  26.24 
 
 
425 aa  73.2  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  25.89 
 
 
425 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  28 
 
 
403 aa  70.9  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0472  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 
424 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465878  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
403 aa  70.9  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0471  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
422 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 
405 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 
441 aa  70.1  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 
394 aa  69.3  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4282  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 
396 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5607  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 
428 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 
438 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.62 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3926  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760133 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3429  glycosyl transferase group 1  23.05 
 
 
440 aa  67.4  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3806  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 
428 aa  67  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773329  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  44.74 
 
 
401 aa  67  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  28.66 
 
 
440 aa  66.6  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4355  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
420 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  28.53 
 
 
403 aa  64.7  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  25.96 
 
 
401 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 
398 aa  64.3  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.78 
 
 
360 aa  63.9  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21451  putative glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
392 aa  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  34.39 
 
 
391 aa  64.3  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 
390 aa  63.2  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
539 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2182  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 
443 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.347756  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  34.13 
 
 
407 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 
395 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  25.47 
 
 
439 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 
439 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  25.47 
 
 
439 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2160  glycosyl transferase, group 1  38.89 
 
 
461 aa  62  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355932  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4705  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 
440 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.625922 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  31.33 
 
 
405 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  31.33 
 
 
405 aa  61.6  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3571  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 
397 aa  61.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414166  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  22.22 
 
 
778 aa  60.5  0.00000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  36.91 
 
 
404 aa  60.5  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4045  glycosyl transferase, group 1  37.25 
 
 
360 aa  60.5  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
436 aa  60.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3557  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 
417 aa  60.1  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6400  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
389 aa  59.7  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3540  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 
431 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.782852  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2754  glycosyl transferase group 1  35.11 
 
 
388 aa  59.3  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.48024 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2498  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.01 
 
 
398 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0028  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.01 
 
 
398 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  27.96 
 
 
401 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  34.11 
 
 
370 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0807  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.64 
 
 
398 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.64262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  30.8 
 
 
384 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 
391 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0628  glycosyltransferase  26.01 
 
 
398 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0521  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.09 
 
 
398 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.908615  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0643  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.64 
 
 
398 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2876  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.01 
 
 
398 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1914  glycosyl transferase group 1  34.42 
 
 
344 aa  58.9  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  35.88 
 
 
377 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2208  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.01 
 
 
398 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.274165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>