65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4963 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4963  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 380 aa  716    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867782  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4449  peptidoglycan-binding LysM  69.17 
 
 		 407 aa  432  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4039  transcriptional regulator, SARP family  34.71 
 
 		 1041 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.039203  normal  0.0409603 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2229  peptidoglycan-binding LysM  33.47 
 
 		 1086 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3426  Peptidoglycan-binding LysM  37.61 
 
 		 1091 aa  82  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0678  transcriptional regulator, SARP family  34.65 
 
 		 1066 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8593  Peptidoglycan-binding LysM  30.11 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902374  normal  0.799796 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2755  Peptidoglycan-binding LysM  40.41 
 
 		 1147 aa  60.8  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00369257  normal  0.0269725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8210  hypothetical protein  28.93 
 
 		 1090 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0453  LysM domain/BON superfamily protein  46.15 
 
 		 158 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1313  hypothetical protein  31.17 
 
 		 969 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1005  Peptidoglycan-binding LysM  43.28 
 
 		 559 aa  53.9  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4135  hypothetical protein  38.55 
 
 		 1002 aa  53.1  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4651  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  43.08 
 
 		 1124 aa  53.1  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.839576 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02210  hypothetical protein  33.71 
 
 		 166 aa  52.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0940  Peptidoglycan-binding LysM  42.42 
 
 		 559 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.147374 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  45.07 
 
 		 954 aa  50.8  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0549  Peptidoglycan-binding LysM  36.23 
 
 		 162 aa  50.4  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2148  LysM domain/BON superfamily protein  43.1 
 
 		 160 aa  50.4  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00099645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0533  peptidoglycan-binding LysM  36.23 
 
 		 162 aa  50.4  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235675  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1297  transport-associated protein  36.23 
 
 		 156 aa  50.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451371  normal  0.073309 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1878  peptidoglycan-binding LysM  48.94 
 
 		 446 aa  49.7  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0622625 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2267  LysM domain/BON superfamily protein  37.93 
 
 		 161 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0461572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2004  LysM domain/BON superfamily protein  39.34 
 
 		 161 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1944  LysM domain/BON superfamily protein  37.93 
 
 		 161 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123188  normal  0.0308749 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4170  peptidoglycan-binding LysM  44.64 
 
 		 163 aa  48.9  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301843  normal  0.177746 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1755  peptidoglycan-binding LysM  35.94 
 
 		 195 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.273127 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1437  peptidoglycan-binding LysM  40.74 
 
 		 453 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0955  peptidoglycan-binding LysM  40.74 
 
 		 453 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310452  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0662  putative cell wall turnover protein  26.79 
 
 		 185 aa  48.9  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2044  LysM domain/BON superfamily protein  33.33 
 
 		 143 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4163  hypothetical protein  39.22 
 
 		 556 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.868125  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3125  integral membrane protein  30.49 
 
 		 628 aa  47.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.435846  hitchhiker  0.000875177 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1730  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  32.42 
 
 		 988 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0938978  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2637  LysM domain-containing protein  43.86 
 
 		 454 aa  47.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  32.76 
 
 		 289 aa  47  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4581  peptidoglycan-binding LysM  39.51 
 
 		 453 aa  47  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0994346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0370  peptidase M23B  38.46 
 
 		 376 aa  46.6  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2006  Peptidoglycan-binding LysM  41.67 
 
 		 154 aa  46.6  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.899391  normal  0.48043 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1415  peptidoglycan-binding LysM  39.51 
 
 		 453 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0737  LysM domain-containing protein  44.68 
 
 		 448 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.990238  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6887  transcriptional regulator, SARP family  32.39 
 
 		 935 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691511  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1074  signal peptide protein  39.58 
 
 		 568 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107534  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0923  LysM domain-containing protein  44.68 
 
 		 454 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1687  lysM domain-containing protein  44.68 
 
 		 454 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1842  LysM domain-containing protein  44.68 
 
 		 454 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1665  lysM domain-containing protein  44.68 
 
 		 454 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0426  LysM domain-containing protein  44.68 
 
 		 448 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1456  LysM domain-containing protein  44.68 
 
 		 448 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2497  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  42.55 
 
 		 190 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2587  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  30.94 
 
 		 992 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.437987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2667  LysM domain/BON superfamily protein  35.71 
 
 		 158 aa  44.7  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000146101  normal  0.333538 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1203  peptidase M23B  32.56 
 
 		 311 aa  44.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000304892  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1317  peptidoglycan-binding LysM  45.83 
 
 		 453 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0518  LysM domain/BON superfamily protein  42 
 
 		 168 aa  44.3  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000100124  decreased coverage  0.00200043 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0523  LysM domain/BON superfamily protein  42 
 
 		 168 aa  43.9  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000072506  hitchhiker  0.00844539 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1356  peptidoglycan-binding LysM  45.83 
 
 		 453 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1043  lipoprotein NlpD  41.51 
 
 		 296 aa  43.9  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4948  Peptidoglycan-binding LysM  36 
 
 		 153 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1826  peptidase M23B  41.79 
 
 		 333 aa  43.9  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0261154  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  27.61 
 
 		 324 aa  43.5  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  34.21 
 
 		 295 aa  43.1  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  40.78 
 
 		 293 aa  43.1  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2479  lysM domain-containing protein  37.25 
 
 		 520 aa  42.7  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13890  Peptidoglycan-binding LysM  47.17 
 
 		 175 aa  42.7  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.582346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>