More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4773 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4773  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 86 aa  176  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0230746  decreased coverage  0.0000199602 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4331  regulatory protein GntR, HTH  96.39 
 
 		 83 aa  164  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.157834  normal  0.0446909 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  50.79 
 
 		 253 aa  63.5  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  42.25 
 
 		 235 aa  63.5  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  47.69 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  41.33 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1108  transcriptional regulator, GntR family  41.43 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3603  GntR domain-containing protein  47.83 
 
 		 253 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550725  normal  0.904969 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 247 aa  60.8  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  49.18 
 
 		 237 aa  60.1  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1044  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.523425  normal  0.272848 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0787  GntR domain protein  40.54 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.812552  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4344  GntR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0366486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4874  transcriptional regulator, GntR family  44.12 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3332  regulatory protein GntR, HTH  44.93 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326019  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5035  regulatory protein GntR, HTH  44.93 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5249  regulatory protein GntR HTH  44.93 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0157  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  34.72 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  40.54 
 
 		 255 aa  58.2  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3953  regulatory protein GntR, HTH  42.11 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0812  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  44.12 
 
 		 240 aa  58.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3689  GntR domain-containing protein  39.44 
 
 		 247 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2717  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 255 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4876  transcriptional regulator, GntR family  40.85 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 261 aa  57.4  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2966  histidine utilization repressor  38.46 
 
 		 260 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665384  normal  0.740013 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  41.27 
 
 		 250 aa  57  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0717  transcriptional regulator, GntR family  42.19 
 
 		 285 aa  57  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3466  GntR domain protein  32.43 
 
 		 255 aa  57  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1886  GntR domain-containing protein  42.19 
 
 		 242 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  42.25 
 
 		 240 aa  57  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4955  putative transcriptional regulator, GntR family  45.31 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3287  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0416745  normal  0.920841 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0739  GntR domain protein  37.88 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0933877  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0759  GntR domain protein  33.78 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0086  GntR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2570  transcriptional regulator, GntR family  40.62 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000448817  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4963  GntR domain-containing protein  45.45 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0466274  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27100  transcriptional regulator  41.54 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  41.43 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2856  histidine utilization repressor  35.06 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4443  GntR domain-containing protein  45.45 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.552946  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  40.85 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3644  histidine utilization repressor  38.46 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3719  GntR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 255 aa  55.1  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3513  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  37.88 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.494425  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3960  regulatory protein GntR, HTH  40.85 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5106  histidine utilization repressor  40 
 
 		 252 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0814369  hitchhiker  0.00493265 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1934  transcriptional regulator, GntR family  45.31 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.127514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2287  transcriptional regulator, GntR family  45.31 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1542  GntR domain-containing protein  37.84 
 
 		 244 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.408327  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3280  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 257 aa  54.7  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 247 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1841  putative transcriptional regulator, GntR family  41.54 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0164679 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 241 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0154  putative transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 245 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1410  GntR domain protein  50.98 
 
 		 237 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1739  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 251 aa  54.3  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549482  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  40.91 
 
 		 255 aa  53.9  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  43.94 
 
 		 261 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  40.79 
 
 		 239 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3102  GntR domain-containing protein  37.5 
 
 		 246 aa  53.9  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0718  putative transcriptional regulator, GntR family  39.06 
 
 		 238 aa  53.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  45.9 
 
 		 239 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 		 249 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6745  GntR domain-containing protein  41.27 
 
 		 243 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  36.14 
 
 		 249 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0700  putative transcriptional regulator, GntR family  39.06 
 
 		 238 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 254 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0489  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  37.88 
 
 		 264 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298725  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  40.62 
 
 		 284 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2943  GntR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 246 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6904  transcriptional regulator  36.76 
 
 		 483 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0552  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  37.88 
 
 		 264 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.406636  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0426  regulatory protein GntR HTH  38.1 
 
 		 243 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1106  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  37.88 
 
 		 264 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000240199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  36.14 
 
 		 249 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4179  regulatory protein GntR HTH  40 
 
 		 243 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0637  GntR domain-containing protein  40.91 
 
 		 252 aa  52.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0402  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 239 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  47.62 
 
 		 261 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  38.89 
 
 		 270 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2307  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  40.26 
 
 		 259 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.672341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  37.14 
 
 		 249 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0011  GntR domain protein  44.44 
 
 		 254 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3387  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  37.31 
 
 		 258 aa  52  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 272 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  37.14 
 
 		 248 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  38.1 
 
 		 246 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  40.91 
 
 		 498 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0740  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 245 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000268297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>