82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4599 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 
478 aa  921    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  51.97 
 
 
454 aa  398  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  54.17 
 
 
464 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  53.13 
 
 
479 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  52.47 
 
 
465 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  52.06 
 
 
465 aa  379  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  59.86 
 
 
415 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  48.65 
 
 
464 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  52.52 
 
 
467 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  52.39 
 
 
455 aa  372  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  49.79 
 
 
461 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  51.67 
 
 
459 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  51.03 
 
 
462 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  52.07 
 
 
464 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  50.31 
 
 
459 aa  371  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  51.75 
 
 
468 aa  366  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  50 
 
 
454 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  52.67 
 
 
450 aa  366  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  52.94 
 
 
435 aa  355  1e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  52.1 
 
 
460 aa  354  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  45.98 
 
 
505 aa  351  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  47.72 
 
 
466 aa  348  8e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  48.75 
 
 
454 aa  348  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  49.38 
 
 
452 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  51.54 
 
 
461 aa  342  8e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  48.45 
 
 
464 aa  342  1e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  52.5 
 
 
457 aa  340  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  48.54 
 
 
493 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  52.56 
 
 
441 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  52.75 
 
 
557 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  51.22 
 
 
476 aa  335  1e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  52.8 
 
 
457 aa  333  3e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  48.88 
 
 
462 aa  331  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  48.13 
 
 
466 aa  331  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  48.38 
 
 
489 aa  329  6e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  52.84 
 
 
439 aa  329  6e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  50.82 
 
 
462 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  53.05 
 
 
361 aa  326  6e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  53.77 
 
 
496 aa  325  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  52.83 
 
 
435 aa  311  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  48.24 
 
 
432 aa  311  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  49.38 
 
 
446 aa  300  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  50.2 
 
 
477 aa  292  7e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  50 
 
 
433 aa  286  8e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  46.79 
 
 
448 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  49.17 
 
 
473 aa  262  8.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  41.31 
 
 
483 aa  206  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  38.45 
 
 
509 aa  206  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  41.18 
 
 
476 aa  201  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  38.69 
 
 
481 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  36.83 
 
 
532 aa  180  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  40.29 
 
 
477 aa  179  7e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  38.28 
 
 
523 aa  176  8e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  39.76 
 
 
501 aa  160  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  32.35 
 
 
483 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  32.94 
 
 
477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  37.06 
 
 
673 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  39.9 
 
 
840 aa  100  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  47.06 
 
 
168 aa  70.9  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  34.59 
 
 
2160 aa  65.9  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  27.34 
 
 
1061 aa  60.8  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  32.52 
 
 
530 aa  60.1  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  27.32 
 
 
863 aa  58.9  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  29.67 
 
 
541 aa  58.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  29.36 
 
 
767 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  33.59 
 
 
575 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  31.35 
 
 
523 aa  52.4  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  28.47 
 
 
575 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  29.89 
 
 
1296 aa  51.2  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  38.18 
 
 
362 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  28.37 
 
 
884 aa  51.2  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  35.04 
 
 
1037 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  29.34 
 
 
593 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  30.41 
 
 
852 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  27 
 
 
558 aa  47.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15312  predicted protein  28.57 
 
 
1359 aa  47.4  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1362  hypothetical protein  28.69 
 
 
1023 aa  46.6  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2874  polymorphic outer membrane protein  31.5 
 
 
412 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234984  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1933  hypothetical protein  33.61 
 
 
1003 aa  44.7  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  26.11 
 
 
572 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  30.65 
 
 
759 aa  43.9  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02579  hypothetical protein  29.73 
 
 
516 aa  43.5  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>