More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4589 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
237 aa  476  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.72 
 
 
234 aa  209  4e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.72 
 
 
234 aa  209  4e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.97 
 
 
231 aa  202  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0836078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7619  short chain oxidoreductase  50.63 
 
 
244 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493234  normal  0.169233 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.1 
 
 
231 aa  201  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.34 
 
 
232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.04 
 
 
272 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
260 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 
245 aa  146  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 
246 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
257 aa  143  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135845  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
252 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519755  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.67 
 
 
245 aa  140  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035289  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.08 
 
 
242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
251 aa  138  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350436  normal  0.454063 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 
241 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409582  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
250 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0227742 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 
247 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.15 
 
 
270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1818  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1616  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124879  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1782  short chain dehydrogenase  32.92 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
245 aa  132  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
244 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.120829  normal  0.282186 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
233 aa  132  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.88 
 
 
263 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230027  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3562  short chain dehydrogenase  32.23 
 
 
236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.13 
 
 
227 aa  129  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.3 
 
 
246 aa  126  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
237 aa  126  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
238 aa  125  7e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
237 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
240 aa  123  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.42 
 
 
244 aa  123  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0980  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 
238 aa  121  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633587  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2677  putative short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  35.66 
 
 
245 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334903  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02369  short chain dehydrogenase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G15350)  33.88 
 
 
309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.406317 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
239 aa  118  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  36.02 
 
 
240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.51 
 
 
229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0814  putative short-chain dehydrogenase/reductase  35.18 
 
 
257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.968056 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 
250 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  decreased coverage  0.000126478 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475837  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.84 
 
 
236 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0167749  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
244 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
250 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0163958 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.39 
 
 
229 aa  105  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2801  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
248 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01679  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase  30.96 
 
 
242 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.774728  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07268  short chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00840)  34.5 
 
 
245 aa  99.8  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.886513 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1084  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 
248 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.64 
 
 
232 aa  99.4  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  33.95 
 
 
316 aa  97.1  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 
244 aa  97.1  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0396  carbonyl reductase  29.55 
 
 
243 aa  96.7  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.32 
 
 
273 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  0.457646 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.83 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  38.02 
 
 
272 aa  94.7  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3423  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  29.49 
 
 
234 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  33.97 
 
 
304 aa  93.6  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.71 
 
 
279 aa  92.8  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229534  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 
253 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0795693 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1603  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.87 
 
 
248 aa  92.4  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000401343  decreased coverage  0.000161546 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 
289 aa  92.4  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2801  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  36.27 
 
 
247 aa  92  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 
247 aa  92  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188516 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  32.87 
 
 
301 aa  91.3  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.21 
 
 
234 aa  91.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.137706  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  34.87 
 
 
272 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  34.65 
 
 
277 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
273 aa  89.7  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07999  conserved hypothetical protein  32.42 
 
 
266 aa  89.4  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.12 
 
 
247 aa  89.4  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.92 
 
 
307 aa  89.4  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 
236 aa  89.4  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497428  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 
236 aa  89  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2494  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.86 
 
 
248 aa  89  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000082608  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02039  short chain oxidoreductase (CsgA), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00910)  33.91 
 
 
251 aa  88.6  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.049775  normal  0.21203 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00525  conserved hypothetical protein  31.13 
 
 
263 aa  87.8  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.30588 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3218  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.78 
 
 
234 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.156646  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.42 
 
 
303 aa  87.8  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1187  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 
256 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.206395 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3471  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.78 
 
 
234 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0106  short chain dehydrogenase  34.55 
 
 
284 aa  87.8  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.417565  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1608  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36 
 
 
244 aa  87.8  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000263068  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.73 
 
 
261 aa  87.8  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3450  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  28.63 
 
 
234 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  33.64 
 
 
302 aa  87.4  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2451  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.5 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26523  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2697  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  36.44 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 
273 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 
249 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3353  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 
273 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 
266 aa  87  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 
273 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212071  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.06 
 
 
281 aa  86.7  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>