More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4559 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 877 aa  1711    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  32.43 
 
 		 998 aa  202  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  31.8 
 
 		 943 aa  177  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  42.64 
 
 		 946 aa  138  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  33.07 
 
 		 947 aa  135  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  33.14 
 
 		 951 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  34.84 
 
 		 952 aa  127  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  33.59 
 
 		 932 aa  123  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 		 974 aa  122  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  33.16 
 
 		 947 aa  106  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  39.66 
 
 		 948 aa  103  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1178  transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 1104 aa  103  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00127631  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  34.34 
 
 		 940 aa  95.5  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 1151 aa  95.5  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  41.98 
 
 		 919 aa  95.1  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  27.04 
 
 		 998 aa  92.8  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 995 aa  90.1  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2421  transcriptional regulator, LuxR family  35.86 
 
 		 939 aa  89  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.924633  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1619  Tetratricopeptide TPR_4  38.21 
 
 		 855 aa  89.4  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0543738  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3795  ATPase-like protein  30.59 
 
 		 925 aa  88.6  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.978971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  29.21 
 
 		 927 aa  87.8  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  35 
 
 		 893 aa  87.4  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 1015 aa  87.4  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  30.15 
 
 		 1146 aa  87  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  31.59 
 
 		 956 aa  87  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  39.26 
 
 		 894 aa  85.9  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4595  regulatory protein, LuxR  33.61 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.878319  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  33.56 
 
 		 1235 aa  85.1  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  41.75 
 
 		 910 aa  84.7  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  33.63 
 
 		 917 aa  84  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  32.25 
 
 		 925 aa  83.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  27.3 
 
 		 943 aa  84  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 937 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  37.35 
 
 		 937 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  37.35 
 
 		 937 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  36.42 
 
 		 918 aa  82  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  39.06 
 
 		 913 aa  81.6  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  32.26 
 
 		 908 aa  79.7  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 889 aa  79.7  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  27.61 
 
 		 855 aa  79.3  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4854  SARP family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 786 aa  79  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0558013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  41.04 
 
 		 927 aa  78.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  39.09 
 
 		 921 aa  78.2  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  40.34 
 
 		 940 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 940 aa  77  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 921 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 881 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  40 
 
 		 921 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 881 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  40 
 
 		 921 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 876 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  38.31 
 
 		 903 aa  76.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  36.49 
 
 		 189 aa  75.9  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  27.13 
 
 		 1148 aa  74.3  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  37.77 
 
 		 938 aa  73.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2716  transcriptional regulator, LuxR family  33.2 
 
 		 941 aa  74.3  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000419619  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  27.48 
 
 		 928 aa  73.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.31 
 
 		 1081 aa  73.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  30.09 
 
 		 900 aa  73.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  34.75 
 
 		 910 aa  73.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 		 928 aa  73.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  37.17 
 
 		 955 aa  73.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.67 
 
 		 1150 aa  72.4  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  39.39 
 
 		 894 aa  72.4  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  36.71 
 
 		 936 aa  72  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  26.4 
 
 		 1118 aa  72.4  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.89 
 
 		 1149 aa  71.6  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  37.58 
 
 		 923 aa  72  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  27.6 
 
 		 1198 aa  72  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  41.22 
 
 		 953 aa  71.6  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.75 
 
 		 1080 aa  71.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 919 aa  71.2  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 879 aa  71.2  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2696  transcriptional regulator, LuxR family  29.75 
 
 		 931 aa  70.5  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.704955  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  28.96 
 
 		 1121 aa  70.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 920 aa  70.9  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  38.4 
 
 		 928 aa  70.5  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 1000 aa  70.1  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  35.95 
 
 		 905 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  34.5 
 
 		 913 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  35.53 
 
 		 929 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  24.74 
 
 		 1697 aa  69.3  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 919 aa  69.3  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 1141 aa  69.3  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4833  LuxR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 994 aa  69.3  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.010143 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  38.71 
 
 		 919 aa  69.3  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 1141 aa  69.3  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  27.95 
 
 		 919 aa  69.3  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  33.05 
 
 		 897 aa  69.3  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  29.89 
 
 		 892 aa  69.3  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2880  transcriptional regulator, LuxR family  29.54 
 
 		 905 aa  68.6  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349194  hitchhiker  0.00245203 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 904 aa  68.9  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  38.71 
 
 		 919 aa  68.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3437  regulatory protein LuxR  27.38 
 
 		 955 aa  67.8  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.756741  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  36.06 
 
 		 929 aa  67.4  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  38.33 
 
 		 977 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  25.96 
 
 		 1190 aa  67.4  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.3 
 
 		 1089 aa  67.4  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  38.24 
 
 		 961 aa  67  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  28.26 
 
 		 959 aa  67  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>