More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4534 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
490 aa  999    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  89.84 
 
 
492 aa  871    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.18 
 
 
466 aa  345  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  39.09 
 
 
444 aa  345  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  38.86 
 
 
444 aa  342  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5613  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.2 
 
 
445 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  36.49 
 
 
448 aa  306  7e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0479  hypothetical protein  38.53 
 
 
328 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0479005  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  32.82 
 
 
479 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.44 
 
 
449 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  29.87 
 
 
461 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.16 
 
 
461 aa  223  7e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  32.31 
 
 
479 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  30 
 
 
448 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.19 
 
 
472 aa  220  5e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.48 
 
 
479 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  31.22 
 
 
479 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  29.03 
 
 
461 aa  209  7e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  32.07 
 
 
459 aa  207  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  30.63 
 
 
474 aa  207  5e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  29.56 
 
 
448 aa  207  5e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  31.13 
 
 
463 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  33.71 
 
 
461 aa  200  6e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  32.9 
 
 
469 aa  196  9e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  31.86 
 
 
465 aa  195  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.78 
 
 
464 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  31.52 
 
 
487 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0518  histidine kinase  31 
 
 
501 aa  191  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.13 
 
 
474 aa  189  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  34.16 
 
 
495 aa  189  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  30.34 
 
 
463 aa  188  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.67 
 
 
461 aa  187  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  33.47 
 
 
465 aa  186  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  29.39 
 
 
473 aa  186  8e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  30.38 
 
 
462 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  32.97 
 
 
465 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  31.19 
 
 
456 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  33.48 
 
 
456 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  30.07 
 
 
468 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  30.79 
 
 
458 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.16 
 
 
490 aa  177  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  29.54 
 
 
602 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  32.39 
 
 
460 aa  173  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  29.78 
 
 
499 aa  173  6.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  33.26 
 
 
456 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  31.61 
 
 
477 aa  171  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3628  FAD linked oxidase domain protein  31.93 
 
 
451 aa  170  6e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  27.77 
 
 
473 aa  169  8e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  30.06 
 
 
477 aa  169  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  29.39 
 
 
478 aa  167  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  31.74 
 
 
465 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  30.11 
 
 
470 aa  164  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.74 
 
 
444 aa  164  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  32.24 
 
 
466 aa  162  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  32.1 
 
 
461 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.23 
 
 
465 aa  157  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  29.41 
 
 
465 aa  157  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  26.93 
 
 
473 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  29.6 
 
 
532 aa  151  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.44 
 
 
469 aa  150  7e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  29.93 
 
 
476 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.1 
 
 
451 aa  147  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0042  FAD linked oxidase domain protein  29.04 
 
 
545 aa  146  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  30.29 
 
 
480 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  38.81 
 
 
462 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.36 
 
 
448 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.74 
 
 
478 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  28.32 
 
 
466 aa  134  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7289  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.13 
 
 
542 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0772845  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.19 
 
 
472 aa  130  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2435  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.65 
 
 
471 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0684957  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4048  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.45 
 
 
476 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225855  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  32.9 
 
 
446 aa  126  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10062  oxidoreductase  28.74 
 
 
479 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.761932 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2448  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.39 
 
 
476 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.370857  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  25.38 
 
 
462 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.62 
 
 
484 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  28.13 
 
 
758 aa  121  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  28.8 
 
 
753 aa  121  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10388  glucooligosaccharide oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14340)  25.11 
 
 
471 aa  121  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451589  normal  0.284571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  26.59 
 
 
448 aa  120  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  30.53 
 
 
705 aa  117  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.78 
 
 
726 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  29.04 
 
 
461 aa  113  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.97 
 
 
481 aa  113  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  29.07 
 
 
754 aa  113  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  32.64 
 
 
447 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  26.32 
 
 
467 aa  110  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.13941 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05846  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14630)  27.31 
 
 
472 aa  109  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  26.59 
 
 
459 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  25.27 
 
 
474 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3765  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.78 
 
 
495 aa  106  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378557  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2758  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.33 
 
 
896 aa  106  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0318  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  25.27 
 
 
491 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000970405  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  26.45 
 
 
734 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.44 
 
 
460 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0127  FAD linked oxidase domain protein  28.98 
 
 
775 aa  104  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.48716 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2583  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.32 
 
 
896 aa  104  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.15241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2650  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.91 
 
 
896 aa  104  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  33.85 
 
 
459 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>