More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4451 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4053  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  98.43 
 
 
510 aa  988    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4451  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  100 
 
 
510 aa  998    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1286  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain M  67.06 
 
 
509 aa  667    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.763724  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6082  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  62.06 
 
 
519 aa  586  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.596347  normal  0.0617522 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4406  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  58.79 
 
 
516 aa  552  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7679  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  58.33 
 
 
526 aa  551  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4546  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  60.59 
 
 
545 aa  555  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.814127  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6670  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  59.13 
 
 
520 aa  550  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0550  NADH dehydrogenase subunit M  56.68 
 
 
562 aa  546  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.291589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0596  NADH dehydrogenase (quinone)  57.39 
 
 
509 aa  546  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.815561  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2683  NADH dehydrogenase subunit M  54.55 
 
 
521 aa  535  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0279  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  55.85 
 
 
507 aa  526  1e-148  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.716259  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0293  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  58.27 
 
 
502 aa  512  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1873  NADH dehydrogenase subunit M  51.06 
 
 
526 aa  491  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03280  NADH dehydrogenase subunit M  52.35 
 
 
534 aa  479  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.992511 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5065  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  57.82 
 
 
555 aa  479  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1589  NADH dehydrogenase subunit M  51.94 
 
 
518 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1565  NADH dehydrogenase subunit M  51.94 
 
 
517 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1535  NADH dehydrogenase subunit M  51.64 
 
 
519 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.486598  normal  0.50499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4493  NADH dehydrogenase subunit M  51.59 
 
 
511 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.803352  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0390  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  52.09 
 
 
535 aa  465  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0986  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  55.31 
 
 
588 aa  464  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13178  NADH dehydrogenase subunit M  47.22 
 
 
553 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.146902  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2704  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  50.78 
 
 
514 aa  451  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0532  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  48.83 
 
 
509 aa  444  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0551  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  49.69 
 
 
507 aa  416  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.253401  normal  0.781277 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.25 
 
 
525 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177133  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0350  NADH dehydrogenase I, M subunit  42.89 
 
 
522 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3343  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.36 
 
 
519 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.62 
 
 
497 aa  392  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0933316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3914  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.82 
 
 
535 aa  382  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0719914  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0481  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.16 
 
 
527 aa  379  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.97 
 
 
535 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000144113 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1875  NADH dehydrogenase subunit M  42.05 
 
 
502 aa  373  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123353  normal  0.162516 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07500  NADH dehydrogenase subunit M  47.01 
 
 
567 aa  374  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0225564 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3217  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  49.77 
 
 
507 aa  372  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141162  normal  0.0503138 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2873  NADH dehydrogenase subunit M  42.31 
 
 
505 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593537  normal  0.190787 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3126  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.13 
 
 
535 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.69 
 
 
542 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2411  NADH dehydrogenase subunit M  41.94 
 
 
502 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139684  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3180  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  48.18 
 
 
491 aa  371  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0442  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.69 
 
 
542 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.990094  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0414  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.69 
 
 
542 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2586  NADH dehydrogenase subunit M  42.19 
 
 
505 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.277846  normal  0.933861 
 
 
-
 
NC_004310  BR0814  NADH dehydrogenase subunit M  41.33 
 
 
502 aa  365  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669912  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3286  NADH dehydrogenase subunit M  41.3 
 
 
505 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573256  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1248  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.6 
 
 
534 aa  365  1e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130648  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0809  NADH dehydrogenase subunit M  41.45 
 
 
502 aa  363  3e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4402  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.7 
 
 
506 aa  363  4e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4138  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.15 
 
 
506 aa  360  3e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.68162  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1034  NADH dehydrogenase subunit M  39.03 
 
 
501 aa  359  7e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0790  NADH dehydrogenase subunit M  39.44 
 
 
489 aa  358  9e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0146664  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4549  NADH dehydrogenase subunit M  40.44 
 
 
502 aa  358  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.177769 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1728  NADH dehydrogenase subunit M  39.92 
 
 
512 aa  355  7.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.694351  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.58 
 
 
503 aa  354  2e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4621  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.86 
 
 
503 aa  353  2.9999999999999997e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0225414 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2208  NADH dehydrogenase subunit M  41.25 
 
 
502 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1007  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.71 
 
 
527 aa  352  7e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.244989  normal  0.172272 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2529  NADH dehydrogenase subunit M  40 
 
 
513 aa  352  1e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0432269  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1992  NADH dehydrogenase subunit M  40 
 
 
513 aa  352  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2386  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.08 
 
 
507 aa  351  2e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0446554  normal  0.771852 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1304  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.14 
 
 
521 aa  351  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278041  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2232  NADH dehydrogenase subunit M  38.61 
 
 
513 aa  350  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1190  NADH dehydrogenase subunit M  39.81 
 
 
513 aa  350  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.602239  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2416  NADH dehydrogenase subunit M  42.51 
 
 
506 aa  350  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185861  hitchhiker  0.00201163 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2154  NADH dehydrogenase subunit M  40.16 
 
 
496 aa  350  5e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.575239  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1202  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.26 
 
 
527 aa  348  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1567  NADH dehydrogenase subunit M  38.2 
 
 
510 aa  348  1e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1195  NADH dehydrogenase subunit M  39.22 
 
 
514 aa  348  1e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.09 
 
 
585 aa  348  2e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341288  normal  0.991992 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1073  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.26 
 
 
527 aa  348  2e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.397792  normal  0.614174 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2275  NADH dehydrogenase subunit M  39.96 
 
 
496 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229712  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3212  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.42 
 
 
517 aa  347  4e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3625  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.2 
 
 
491 aa  347  4e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1297  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.78 
 
 
517 aa  345  8e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.310609  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5565  NADH dehydrogenase subunit M  39.56 
 
 
496 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0400022  normal  0.331028 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1311  NADH dehydrogenase subunit M  39.36 
 
 
496 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1817  NADH dehydrogenase subunit M  39.36 
 
 
496 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0425  NADH dehydrogenase subunit M  39.36 
 
 
496 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0725  NADH dehydrogenase subunit M  39.36 
 
 
496 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10971  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1448  NADH dehydrogenase subunit M  39.36 
 
 
496 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1142  NADH dehydrogenase subunit M  39.36 
 
 
496 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.400671  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1302  NADH dehydrogenase subunit M  39.36 
 
 
496 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1073  NADH dehydrogenase subunit M  38.76 
 
 
496 aa  344  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2261  NADH dehydrogenase subunit M  39.56 
 
 
496 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.796685  normal  0.444802 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1625  NADH dehydrogenase subunit M  39.56 
 
 
496 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209377  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4155  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.94 
 
 
534 aa  343  5e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0166298 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2237  NADH dehydrogenase subunit M  39.56 
 
 
496 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.759454  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1040  NADH dehydrogenase subunit M  39.56 
 
 
496 aa  342  7e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.926201  normal  0.336803 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2047  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.7 
 
 
506 aa  341  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.688388  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0314  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.63 
 
 
493 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2288  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.05 
 
 
516 aa  338  9.999999999999999e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3214  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.08 
 
 
514 aa  338  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1328  NADH dehydrogenase subunit M  38.52 
 
 
515 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0365587 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1273  NADH dehydrogenase subunit M  38.23 
 
 
503 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218995  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1365  NADH dehydrogenase subunit M  38.43 
 
 
503 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288443  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0720  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.4 
 
 
504 aa  336  5e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.362005  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3202  NADH dehydrogenase subunit M  38.97 
 
 
496 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.422188  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.15 
 
 
494 aa  336  7e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000177754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2618  NADH-quinone oxidoreductase, M subunit  37.15 
 
 
494 aa  336  7e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>