85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4425 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4425  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 134 aa  270  5.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2617  nucleic acid binding protein  54.2 
 
 		 134 aa  134  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0827  PilT protein domain protein  50.77 
 
 		 133 aa  123  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0926  hypothetical protein  39.69 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3973  high-affinity nickel permease-like protein  51.69 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0271178  normal  0.235405 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0012  PilT protein domain-containing protein  32.54 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.948131 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4581  PilT protein-like  38.68 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.766949  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0074  PilT protein domain protein  35.71 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5170  PilT protein domain protein  32.64 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  32.37 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0983  PilT domain-containing protein  30.77 
 
 		 133 aa  52  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0630  PilT protein domain protein  32.61 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1067  PilT protein domain protein  28.68 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0286  PilT protein domain protein  30.3 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.024358  decreased coverage  0.0024847 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0657  PilT protein domain protein  31.2 
 
 		 129 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4028  PilT protein domain protein  28.06 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3697  PilT protein domain protein  30.95 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  25.86 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2733  PilT protein-like  32.56 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.489446  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1063  PilT protein domain protein  29.41 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.471234  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  29.66 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4764  PilT domain-containing protein  35.14 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.310304 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1337  PilT protein domain protein  26.19 
 
 		 129 aa  47.8  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.1325  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1048  PilT protein domain protein  39.06 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.71366  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3714  PilT protein domain protein  37.38 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  27.12 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1904  PilT protein domain protein  40.62 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2505  PilT protein domain protein  28.47 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1362  plasmid stability protein, putative  33.07 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00298137  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0442  nitrogen regulatory protein NtrR  26.83 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0505  putative plasmid stability protein  36.46 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1213  PilT domain-containing protein  28.57 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5262  PilT protein domain protein  31.75 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0679342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0091  PilT domain-containing protein  29.69 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0483  PilT domain-containing protein  28.57 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2987  PilT protein domain protein  30.4 
 
 		 137 aa  43.5  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2539  PilT domain-containing protein  29.92 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1183  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0058  PilT protein domain protein  30.48 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23550  predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain protein  33.07 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.46968  normal  0.640927 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0057  PilT protein domain protein  32.03 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.033229 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3269  PilT protein-like  31.34 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159462  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2302  plasmid stabilization protein  31.58 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.171886  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4284  prevent-host-death protein  30.94 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.600657  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4574  PilT domain-containing protein  28.37 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0680986  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2669  PilT protein-like  24.39 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0691561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1456  PilT protein domain protein  34.23 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.208651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1780  plasmid stability protein, putative  34.23 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0701  PilT protein domain protein  28.21 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.528227 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3368  plasmid maintenance protein  28.46 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3267  plasmid maintenance protein  28.46 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1848  PilT protein domain protein  25.69 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3757  PilT domain-containing protein  32.31 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272094  normal  0.0228653 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1709  PilT protein-like  26.62 
 
 		 164 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  28.46 
 
 		 135 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0305  PilT protein domain protein  25.76 
 
 		 128 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0032427  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5837  PilT domain-containing protein  29.17 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.380144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3903  PilT protein-like  29.17 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3939  PilT protein domain protein  26.45 
 
 		 133 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1390  PilT domain-containing protein  29.05 
 
 		 141 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1771  hypothetical protein  25.58 
 
 		 133 aa  42  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4465  PilT domain-containing protein  29.17 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0155  PilT protein domain protein  28.68 
 
 		 139 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.538447 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0013  PilT protein-like  31.97 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  27.91 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4420  PilT protein domain protein  28.09 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6402  PilT protein domain protein  40.38 
 
 		 141 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  30.33 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10638  hypothetical protein  33.6 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000594146  normal  0.603416 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1070  PilT protein-like protein  30.71 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3326  PilT domain-containing protein  34.82 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0151  PilT protein domain protein  31.43 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.85559  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2412  PilT domain-containing protein  29.66 
 
 		 140 aa  41.2  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10607  hypothetical protein  33.67 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3889  PilT domain-containing protein  32.5 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  28.57 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0440  PilT protein-like  30.53 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000179252  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7721  plasmid stability protein  32.08 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.859418 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3767  PilT domain-containing protein  29.75 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546918  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  28.43 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1509  PilT domain-containing protein  31.13 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.203613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  28.43 
 
 		 136 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3138  PilT protein-like  31.19 
 
 		 140 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464533  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2719  PilT protein-like  25.76 
 
 		 151 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.116591 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3902  PilT domain-containing protein  28.47 
 
 		 136 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>