77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4397 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  888    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  64.3 
 
 		 468 aa  497  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  59.48 
 
 		 464 aa  481  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  61.14 
 
 		 455 aa  474  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  62.26 
 
 		 464 aa  468  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  60.95 
 
 		 462 aa  460  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  58.21 
 
 		 464 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  54.72 
 
 		 465 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  54.19 
 
 		 459 aa  404  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  54.33 
 
 		 454 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  55.43 
 
 		 450 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  53.76 
 
 		 464 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  51.31 
 
 		 454 aa  381  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  52.97 
 
 		 465 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  51.59 
 
 		 466 aa  371  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  54.12 
 
 		 467 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  50.43 
 
 		 462 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  52.12 
 
 		 461 aa  366  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  51.14 
 
 		 479 aa  363  5.0000000000000005e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  50.11 
 
 		 459 aa  360  3e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  46.67 
 
 		 505 aa  359  6e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  50.42 
 
 		 461 aa  358  9.999999999999999e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  52.16 
 
 		 460 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  52.4 
 
 		 557 aa  352  5e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  49.19 
 
 		 493 aa  352  8.999999999999999e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  52.03 
 
 		 435 aa  351  1e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  52.06 
 
 		 457 aa  341  1e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  54.9 
 
 		 457 aa  340  4e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  57.1 
 
 		 361 aa  334  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  47.53 
 
 		 466 aa  334  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  49.04 
 
 		 462 aa  332  7.000000000000001e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  48.43 
 
 		 476 aa  332  1e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  51.65 
 
 		 446 aa  331  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  52.07 
 
 		 477 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  49.57 
 
 		 432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  49.25 
 
 		 452 aa  320  3e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  52.23 
 
 		 441 aa  318  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  49.79 
 
 		 496 aa  317  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  48.75 
 
 		 478 aa  309  8e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  52.48 
 
 		 448 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  49.32 
 
 		 435 aa  306  7e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  46.78 
 
 		 489 aa  295  9e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  51.52 
 
 		 415 aa  294  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  45.65 
 
 		 439 aa  289  6e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  48.74 
 
 		 473 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  48.26 
 
 		 433 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  40.14 
 
 		 509 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  41.5 
 
 		 476 aa  182  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  39.4 
 
 		 483 aa  176  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  35.19 
 
 		 481 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  37.96 
 
 		 477 aa  155  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  39.6 
 
 		 501 aa  154  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  33.17 
 
 		 477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  31.93 
 
 		 532 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  32.62 
 
 		 523 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  31.35 
 
 		 483 aa  142  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  38.59 
 
 		 840 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  34.92 
 
 		 673 aa  94  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  46.9 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  30.88 
 
 		 530 aa  65.1  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  30.77 
 
 		 759 aa  60.1  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  33 
 
 		 2160 aa  59.7  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  29.35 
 
 		 863 aa  59.3  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  29.26 
 
 		 523 aa  58.5  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  28.42 
 
 		 591 aa  56.6  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  30.93 
 
 		 541 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  28.06 
 
 		 767 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  27.48 
 
 		 1296 aa  53.5  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.06 
 
 		 884 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  28.23 
 
 		 1318 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  28.87 
 
 		 1755 aa  51.2  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  31.55 
 
 		 558 aa  50.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3328  polymorphic outer membrane protein  37.5 
 
 		 272 aa  47  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000184033 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  39.2 
 
 		 362 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  28.39 
 
 		 575 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  25.32 
 
 		 575 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2246  hypothetical protein  27.6 
 
 		 591 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.105015  normal  0.0180285 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>