156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4349 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4349  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  645    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3965  hypothetical protein  95.37 
 
 
324 aa  617  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3644  hypothetical protein  61.54 
 
 
307 aa  332  7.000000000000001e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2620  hypothetical protein  60.14 
 
 
296 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6698  hypothetical protein  48.97 
 
 
291 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.490421  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7266  hypothetical protein  46.05 
 
 
334 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3932  hypothetical protein  43.86 
 
 
286 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3854  hypothetical protein  43.06 
 
 
286 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357835  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0059  hypothetical protein  44.41 
 
 
303 aa  209  7e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2688  hypothetical protein  41.32 
 
 
286 aa  208  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.566827  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1071  hypothetical protein  44.7 
 
 
304 aa  206  6e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0151  hypothetical protein  44.26 
 
 
283 aa  206  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5643  hypothetical protein  45.61 
 
 
297 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4343  hypothetical protein  47.26 
 
 
288 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6257  hypothetical protein  41.81 
 
 
285 aa  192  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.949372  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38250  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  43.42 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201502  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1367  hypothetical protein  40.66 
 
 
285 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.134083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0252  hypothetical protein  44.07 
 
 
290 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0952  hypothetical protein  38.01 
 
 
285 aa  176  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5006  hypothetical protein  40.66 
 
 
287 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2385  putative F420-dependent oxidoreductase  41.7 
 
 
288 aa  169  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0497  hypothetical protein  38.62 
 
 
303 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0508  hypothetical protein  38.62 
 
 
303 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0486  hypothetical protein  38.62 
 
 
303 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3207  putative F420-dependent oxidoreductase  40.79 
 
 
272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1512  hypothetical protein  44 
 
 
279 aa  162  8.000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00633715  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1067  hypothetical protein  37.73 
 
 
283 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1083  hypothetical protein  37.73 
 
 
283 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.377526  normal  0.11045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1094  hypothetical protein  37.73 
 
 
283 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3680  putative F420-dependent oxidoreductase  36.88 
 
 
281 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13500  hypothetical protein  40.08 
 
 
285 aa  153  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000277953  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1368  hypothetical protein  37.59 
 
 
281 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233326  normal  0.203451 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5005  hypothetical protein  37.41 
 
 
294 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1068  hypothetical protein  37.91 
 
 
276 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1084  hypothetical protein  37.91 
 
 
276 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0372016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1095  hypothetical protein  37.91 
 
 
276 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1545  hypothetical protein  38.46 
 
 
301 aa  150  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000935429  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4154  hypothetical protein  40.32 
 
 
301 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.238248  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5428  hypothetical protein  34.13 
 
 
275 aa  122  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.24 
 
 
322 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5686  hypothetical protein  32.31 
 
 
271 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0100066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  29.28 
 
 
327 aa  76.6  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  32.31 
 
 
346 aa  73.6  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  27.65 
 
 
318 aa  73.2  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  27.69 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  27.87 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  25.18 
 
 
353 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  27.39 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  25.55 
 
 
344 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  25.73 
 
 
350 aa  65.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  25.73 
 
 
350 aa  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  27.41 
 
 
344 aa  63.5  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  27.92 
 
 
317 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  28.57 
 
 
372 aa  63.9  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  27.56 
 
 
318 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  26.85 
 
 
349 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  28.89 
 
 
346 aa  63.2  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  26.79 
 
 
349 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  26.79 
 
 
349 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.76 
 
 
361 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  26.22 
 
 
349 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  29.52 
 
 
306 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  26.74 
 
 
343 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  24.62 
 
 
345 aa  60.1  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  28.41 
 
 
309 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  26.42 
 
 
345 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  30.64 
 
 
348 aa  59.7  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  28.31 
 
 
301 aa  59.3  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2453  luciferase family protein  29.68 
 
 
317 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  27.3 
 
 
346 aa  59.3  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.28 
 
 
339 aa  59.3  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4973  luciferase family protein  24.23 
 
 
360 aa  59.3  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.61 
 
 
352 aa  58.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  27.9 
 
 
339 aa  58.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  27.36 
 
 
342 aa  57.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  26.13 
 
 
326 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.87 
 
 
346 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  24.7 
 
 
346 aa  57  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  28.21 
 
 
321 aa  57  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.85 
 
 
334 aa  55.8  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  23.28 
 
 
339 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  20.54 
 
 
321 aa  55.5  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2391  luciferase-like  31.76 
 
 
351 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  25.56 
 
 
327 aa  54.3  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  27.75 
 
 
349 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3731  luciferase-like protein  28.57 
 
 
318 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25 
 
 
318 aa  53.5  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3804  luciferase family protein  28.57 
 
 
318 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0754765 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0358  luciferase family protein  29.63 
 
 
348 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3743  luciferase family protein  28.57 
 
 
318 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  27.6 
 
 
350 aa  53.1  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.71 
 
 
336 aa  52.8  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  27.35 
 
 
346 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  24.56 
 
 
359 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  28.72 
 
 
344 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.78 
 
 
333 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1386  putative F420-dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
361 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.46 
 
 
327 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4369  F420-dependent oxidoreductase  28.83 
 
 
329 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.257639  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.34 
 
 
332 aa  50.8  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>