More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4235 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4235  methyltransferase type 11  100 
 
 
244 aa  482  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0933321 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2301  methyltransferase type 11  60.49 
 
 
243 aa  286  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  30.47 
 
 
252 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  25.25 
 
 
249 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0455  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  33.78 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  36.94 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  30.88 
 
 
294 aa  65.5  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  34.88 
 
 
457 aa  65.1  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
241 aa  63.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
241 aa  63.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  37.84 
 
 
231 aa  61.6  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4221  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 
220 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.23 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5074  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.23 
 
 
252 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4070  MerR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
260 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.354959 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  36.04 
 
 
295 aa  59.3  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  33.33 
 
 
295 aa  59.3  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0582  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.71 
 
 
241 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  27.81 
 
 
294 aa  58.9  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
237 aa  58.9  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  39.29 
 
 
255 aa  58.9  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  29.21 
 
 
239 aa  58.9  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  33.91 
 
 
284 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4421  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.21 
 
 
236 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  30.3 
 
 
237 aa  58.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30 
 
 
272 aa  57.8  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  29.48 
 
 
268 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.71 
 
 
201 aa  58.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0519  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.17 
 
 
229 aa  58.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0166  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.3 
 
 
239 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00279122 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4848  Methyltransferase type 11  41.82 
 
 
310 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.52 
 
 
241 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  30 
 
 
275 aa  57.4  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.38 
 
 
345 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.71 
 
 
234 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1272  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
228 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  36 
 
 
274 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  28.43 
 
 
241 aa  57.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1236  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.17 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.228899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 
286 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40 
 
 
235 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
235 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  40.57 
 
 
270 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2395  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 
208 aa  57  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000965249  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  28.57 
 
 
629 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  33.02 
 
 
293 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 
255 aa  56.2  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  31.74 
 
 
288 aa  56.2  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  31.52 
 
 
268 aa  56.2  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  34.03 
 
 
251 aa  56.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  36.3 
 
 
255 aa  56.2  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.53 
 
 
252 aa  55.8  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.85 
 
 
230 aa  55.8  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.04 
 
 
235 aa  55.8  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  26.49 
 
 
202 aa  55.8  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  29.75 
 
 
238 aa  55.5  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  35 
 
 
274 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0600  methyltransferase type 11  30.65 
 
 
218 aa  55.5  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.93996  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1262  type 11 methyltransferase  32.35 
 
 
273 aa  55.5  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.653357  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1055  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 
248 aa  55.5  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  39.58 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  29.15 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  35.43 
 
 
241 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1836  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  26.2 
 
 
246 aa  54.7  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.62 
 
 
236 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.61729  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.55 
 
 
233 aa  55.1  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2682  Methyltransferase type 11  36 
 
 
262 aa  55.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  35.43 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1353  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 
280 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0337053  hitchhiker  0.000000492717 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  26.71 
 
 
253 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3798  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  34.65 
 
 
270 aa  54.3  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.0023997  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  40.21 
 
 
269 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  45.74 
 
 
260 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1137  transcriptional regulator  28.66 
 
 
395 aa  54.3  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000736319  hitchhiker  0.00587761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  32.43 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  44.68 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  30.63 
 
 
292 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.85 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.251701  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1102  methyltransferase type 11  33.94 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  30.63 
 
 
292 aa  53.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  36.89 
 
 
267 aa  53.5  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4560  Methyltransferase type 11  39.39 
 
 
272 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.605076 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  34.38 
 
 
282 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3488  Methyltransferase type 11  39.39 
 
 
272 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.299223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0278  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.06 
 
 
251 aa  53.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.831577  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  53.85 
 
 
331 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  32.69 
 
 
267 aa  53.1  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.21 
 
 
250 aa  53.1  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2158  methyltransferase type 11  32.9 
 
 
363 aa  53.1  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  31.9 
 
 
235 aa  53.1  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  32.69 
 
 
267 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0467  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.73 
 
 
231 aa  53.1  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.197938  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2233  Methyltransferase type 11  33.9 
 
 
204 aa  53.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.569046  hitchhiker  0.00169364 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.06 
 
 
234 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  32.69 
 
 
267 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  36.28 
 
 
225 aa  53.1  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.46 
 
 
233 aa  52.8  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0336  Methyltransferase type 11  36.81 
 
 
259 aa  52.8  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0390472  normal  0.038594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>