More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4232 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4232  chaperonin Cpn10  100 
 
 		 104 aa  203  8e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0774007 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3842  chaperonin Cpn10  98.04 
 
 		 102 aa  196  7.999999999999999e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4453  chaperonin Cpn10  86.27 
 
 		 102 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4258  chaperonin Cpn10  86.27 
 
 		 102 aa  178  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1086  chaperonin Cpn10  93.75 
 
 		 98 aa  177  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.692359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6002  co-chaperonin GroES  88.24 
 
 		 101 aa  175  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0711534 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0632  co-chaperonin GroES  85.29 
 
 		 101 aa  170  5e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6544  chaperonin Cpn10  86.17 
 
 		 97 aa  166  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.303398  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04660  Co-chaperonin GroES  85.11 
 
 		 97 aa  165  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00798314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4026  Chaperonin Cpn10  78.64 
 
 		 103 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3058  co-chaperonin GroES  80.21 
 
 		 98 aa  162  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.495905 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2589  Chaperonin Cpn10  81.91 
 
 		 97 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.565547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0635  chaperonin Cpn10  81.91 
 
 		 97 aa  161  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0684  chaperonin Cpn10  85.11 
 
 		 98 aa  161  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2599  10 kD chaperone  78.64 
 
 		 103 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1719  chaperonin Cpn10  82.29 
 
 		 99 aa  160  8.000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1170  chaperonin Cpn10  80.41 
 
 		 127 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1180  chaperonin Cpn10  80.41 
 
 		 127 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0241756 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1153  chaperonin Cpn10  80.41 
 
 		 127 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3647  co-chaperonin GroES  81.91 
 
 		 97 aa  157  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1207  chaperonin Cpn10  80.21 
 
 		 99 aa  157  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.867572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13452  co-chaperonin GroES  79.59 
 
 		 100 aa  157  6e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000956292  hitchhiker  0.00171205 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1154  co-chaperonin GroES  79.61 
 
 		 103 aa  156  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0362  chaperonin Cpn10  78.64 
 
 		 102 aa  156  7e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.686615  normal  0.421985 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28700  Co-chaperonin GroES  81.91 
 
 		 97 aa  155  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0619  chaperonin Cpn10  79.41 
 
 		 104 aa  154  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143984  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1494  co-chaperonin GroES  78.35 
 
 		 100 aa  154  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4925  co-chaperonin GroES  78.35 
 
 		 100 aa  154  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16550  Co-chaperonin GroES  79.17 
 
 		 98 aa  150  5.9999999999999996e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.639377  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0735  co-chaperonin GroES  76.04 
 
 		 98 aa  149  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.224017  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0898  chaperonin Cpn10  73.96 
 
 		 99 aa  144  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.520012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1007  chaperonin Cpn10  77.08 
 
 		 98 aa  143  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08630  Co-chaperonin GroES  72.34 
 
 		 98 aa  142  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2887  co-chaperonin GroES  75 
 
 		 97 aa  142  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0300428  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2595  co-chaperonin GroES  73.96 
 
 		 97 aa  142  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000536943 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0234  chaperonin GroS  68.09 
 
 		 97 aa  141  4e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1677  co-chaperonin GroES  67.02 
 
 		 97 aa  139  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07560  Co-chaperonin GroES  70.53 
 
 		 98 aa  137  6e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.371401  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  60.42 
 
 		 96 aa  124  6e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0443  chaperonin Cpn10  63.16 
 
 		 97 aa  123  9e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1856  groes  62.11 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.70749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  64.52 
 
 		 94 aa  121  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 		 96 aa  120  7e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  64.13 
 
 		 94 aa  119  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  60.82 
 
 		 98 aa  119  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  58.95 
 
 		 95 aa  119  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1088  chaperonin Cpn10  58.76 
 
 		 98 aa  119  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466109  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  61.96 
 
 		 94 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  56.25 
 
 		 96 aa  116  9e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  59.78 
 
 		 94 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0252  co-chaperonin GroES  59.78 
 
 		 94 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000529101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0238  co-chaperonin GroES  59.78 
 
 		 94 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.27511e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  59.78 
 
 		 94 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  59.78 
 
 		 94 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0292  co-chaperonin GroES  59.78 
 
 		 94 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0266  co-chaperonin GroES  59.78 
 
 		 94 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0316  co-chaperonin GroES  59.78 
 
 		 94 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000403137  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 96 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  61.29 
 
 		 94 aa  115  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2874  chaperonin Cpn10  61.29 
 
 		 94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282007  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0297  co-chaperonin GroES  59.78 
 
 		 94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000149482  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5027  co-chaperonin GroES  59.78 
 
 		 94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000449913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1789  co-chaperonin GroES  58.89 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0230  co-chaperonin GroES  60.87 
 
 		 94 aa  114  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000701184  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5811  chaperonin Cpn10  61.05 
 
 		 97 aa  114  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907137  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0145  co-chaperonin GroES  51.46 
 
 		 103 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2657  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 96 aa  114  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0245  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 		 94 aa  114  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139504  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0615  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 96 aa  114  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0534  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 96 aa  114  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 		 98 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0316  chaperonin Cpn10  61.05 
 
 		 92 aa  113  7.999999999999999e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0011552  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16161  co-chaperonin GroES  51.96 
 
 		 103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.5001  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  54.17 
 
 		 104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0578  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0545  chaperonin Cpn10  58.06 
 
 		 94 aa  112  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000554341  normal  0.812353 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0678  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2574  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 94 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2276  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 94 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0700  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.0126966 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0641  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3096  chaperonin Cpn10  51.04 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  56.52 
 
 		 96 aa  111  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3678  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 		 100 aa  111  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00275768  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  53.12 
 
 		 98 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1132  co-chaperonin GroES  56.25 
 
 		 96 aa  111  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000135765  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0760  co-chaperonin GroES  56.25 
 
 		 96 aa  111  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000383794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4126  co-chaperonin GroES  53.12 
 
 		 98 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505672  normal  0.752904 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  56.25 
 
 		 96 aa  111  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0564  chaperonin Cpn10  57.14 
 
 		 102 aa  111  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  55.43 
 
 		 98 aa  111  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4725  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 98 aa  110  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4326  co-chaperonin GroES  48.04 
 
 		 103 aa  111  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.212063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0946  chaperonin Cpn10  55.21 
 
 		 96 aa  110  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0150753  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16271  co-chaperonin GroES  50.98 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  54.17 
 
 		 96 aa  110  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0296  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 		 97 aa  110  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018883  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>