More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4221 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4221  NUDIX hydrolase  100 
 
 
315 aa  630  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292609  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3831  NUDIX hydrolase  94.29 
 
 
361 aa  597  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363079  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  45.08 
 
 
305 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3830  NUDIX hydrolase  46.41 
 
 
301 aa  236  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4220  NUDIX hydrolase  43.56 
 
 
304 aa  226  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288399  normal  0.0172337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  40.75 
 
 
298 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1950  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 
255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666959  hitchhiker  0.00341622 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1680  hypothetical protein  42.86 
 
 
269 aa  109  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
299 aa  108  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0754  NUDIX hydrolase  40 
 
 
282 aa  84  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  hitchhiker  0.00425905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  38.94 
 
 
173 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 
155 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 
158 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07700  NTP pyrophosphohydrolase  40.98 
 
 
241 aa  65.5  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.054443  normal  0.43952 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  37.86 
 
 
158 aa  62.8  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0519  NUDIX family hydrolase  31.03 
 
 
168 aa  61.2  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.259714  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 
153 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 
142 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  35 
 
 
154 aa  58.2  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  33.33 
 
 
212 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
142 aa  57  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  38.24 
 
 
149 aa  56.6  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0697  MutT related protein  42.65 
 
 
145 aa  56.6  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  normal  0.361701 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  40.38 
 
 
136 aa  56.2  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.46 
 
 
128 aa  56.2  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.46 
 
 
128 aa  56.2  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.46 
 
 
128 aa  56.2  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  50.91 
 
 
347 aa  55.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1537  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 
148 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.537681  normal  0.0457282 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 
146 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 
265 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  35.97 
 
 
200 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  41.35 
 
 
143 aa  54.7  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  51.61 
 
 
161 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.65 
 
 
134 aa  54.3  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  49.25 
 
 
151 aa  54.3  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  37.4 
 
 
139 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  46.55 
 
 
166 aa  53.9  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 
155 aa  53.5  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3460  mutT/nudix family protein  28.46 
 
 
137 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284792  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
153 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3377  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  28.46 
 
 
137 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3732  mutT/nudix family protein  28.46 
 
 
137 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3688  mutT/nudix family protein  28.46 
 
 
137 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.237209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3121  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  32.79 
 
 
156 aa  52.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 
135 aa  52.8  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0870  mutator mutT protein  34.35 
 
 
137 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  49.23 
 
 
136 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  31.25 
 
 
143 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 
134 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 
145 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3378  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 
145 aa  52.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  49.09 
 
 
144 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  37.69 
 
 
165 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5566  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 
153 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.600891  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5931  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 
143 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  41.46 
 
 
153 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3705  mutT/nudix family protein  29.46 
 
 
137 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3426  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  29.23 
 
 
137 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0344425  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 
145 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  30.99 
 
 
155 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4018  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 
154 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 
236 aa  51.6  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  43.66 
 
 
138 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  47.69 
 
 
133 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 
199 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
133 aa  51.6  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3895  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 
151 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  28.3 
 
 
153 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0487  MutT/nudix family protein  31.58 
 
 
151 aa  50.8  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.450276  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  29.01 
 
 
135 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 
144 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  28.57 
 
 
181 aa  50.8  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0647  MutT/nudix family protein  34.83 
 
 
152 aa  50.8  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  32.8 
 
 
147 aa  50.4  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  43.66 
 
 
178 aa  50.4  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0464  MutT/nudix family protein  35.14 
 
 
135 aa  50.4  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.28 
 
 
131 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
155 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
155 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  49.12 
 
 
155 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  51.79 
 
 
157 aa  50.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  29.01 
 
 
137 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 
159 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
141 aa  50.1  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  49.09 
 
 
132 aa  50.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  40.66 
 
 
157 aa  49.7  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  27.34 
 
 
153 aa  49.7  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  46.97 
 
 
129 aa  49.7  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  53.06 
 
 
132 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  53.06 
 
 
132 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.7 
 
 
131 aa  49.7  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5350  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 
205 aa  49.7  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.46762  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  29.01 
 
 
142 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  28.79 
 
 
138 aa  49.7  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  44.12 
 
 
149 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  53.19 
 
 
137 aa  49.7  0.00007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  28.79 
 
 
138 aa  49.7  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2458  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 
138 aa  49.7  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>