More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4091 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  79.1 
 
 		 230 aa  331  6e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  52.25 
 
 		 183 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 191 aa  162  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  47.73 
 
 		 185 aa  161  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  45.7 
 
 		 184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  39.38 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 291 aa  89.4  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 185 aa  87  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  34.12 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  35.76 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  47.76 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  50.75 
 
 		 186 aa  68.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 202 aa  62  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0538  putative transcription regulator protein  29.69 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548249  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2047  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199455 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  45 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1857  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2773  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00136461  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 189 aa  58.2  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  36.08 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  36.08 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0433  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.425009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1677  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 288 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.688428  normal  0.314033 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1256  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259056 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1410  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1037  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397518  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0761  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1265  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1272  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0388  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2189  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.533648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  42.86 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3595  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2311  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3798  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164802  normal  0.867379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>