More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3928 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3928  cobyric acid synthase CobQ  100 
 
 		 575 aa  1129    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111937  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  91.95 
 
 		 521 aa  882    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  66.34 
 
 		 509 aa  632  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  64.06 
 
 		 512 aa  586  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  60.27 
 
 		 529 aa  578  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  61.73 
 
 		 509 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  63.9 
 
 		 501 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0558  cobyric acid synthase CobQ  62.33 
 
 		 511 aa  552  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2034  cobyric acid synthase  61.31 
 
 		 495 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2051  cobyric acid synthase  61.31 
 
 		 495 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831815  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2097  cobyric acid synthase  61.31 
 
 		 495 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0722506  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0360  cobyric acid synthase  57.2 
 
 		 491 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0971172 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  59.09 
 
 		 509 aa  511  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  59.35 
 
 		 507 aa  504  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10258  cobyric acid synthase  58.33 
 
 		 494 aa  502  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0479101 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2603  cobyric acid synthase  57.63 
 
 		 520 aa  504  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.478422  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0377  cobyric acid synthase  57.93 
 
 		 490 aa  504  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2128  cobyric acid synthase CobQ  54.84 
 
 		 517 aa  500  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  57.62 
 
 		 498 aa  496  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0138  cobyric acid synthase  57.72 
 
 		 486 aa  495  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1613  cobyric acid synthase CobQ  57.26 
 
 		 527 aa  489  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2509  cobyric acid synthase  57.89 
 
 		 495 aa  489  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.15189  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2880  cobyric acid synthase  56.58 
 
 		 476 aa  491  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4863  cobyric acid synthase  58.37 
 
 		 508 aa  478  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00498054  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0309  cobyric acid synthase  55.14 
 
 		 501 aa  451  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0634  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  54.31 
 
 		 499 aa  439  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  44.98 
 
 		 506 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  44.79 
 
 		 506 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  43.88 
 
 		 506 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  46.71 
 
 		 500 aa  405  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  44.98 
 
 		 513 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  44.59 
 
 		 506 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  47.91 
 
 		 495 aa  391  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  45.88 
 
 		 863 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  45.29 
 
 		 484 aa  383  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  45.47 
 
 		 863 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2864  cobyric acid synthase  46.27 
 
 		 551 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  42.39 
 
 		 506 aa  381  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  47.55 
 
 		 518 aa  382  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  46.26 
 
 		 484 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  45.62 
 
 		 852 aa  380  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  47.28 
 
 		 484 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  48.19 
 
 		 490 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  46.37 
 
 		 484 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  46.52 
 
 		 487 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  45.45 
 
 		 776 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  44.88 
 
 		 772 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  47.01 
 
 		 539 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  40.85 
 
 		 503 aa  373  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  47.78 
 
 		 490 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  40.81 
 
 		 503 aa  373  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4734  cobyric acid synthase  46.63 
 
 		 485 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  46.67 
 
 		 481 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  39.89 
 
 		 514 aa  371  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  46.17 
 
 		 484 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  42.86 
 
 		 485 aa  366  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  48.89 
 
 		 496 aa  365  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  40.66 
 
 		 515 aa  365  1e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  46.67 
 
 		 483 aa  364  3e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  45.28 
 
 		 494 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  47.27 
 
 		 485 aa  362  8e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  46.39 
 
 		 481 aa  362  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  46.09 
 
 		 498 aa  362  1e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  44.38 
 
 		 483 aa  362  1e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  38.1 
 
 		 513 aa  362  1e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  43.24 
 
 		 541 aa  362  1e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  47.57 
 
 		 510 aa  362  1e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  46.18 
 
 		 481 aa  361  2e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  39.64 
 
 		 501 aa  362  2e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  45.42 
 
 		 483 aa  360  4e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  43.84 
 
 		 797 aa  360  5e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  38.95 
 
 		 507 aa  360  6e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  44.88 
 
 		 486 aa  359  7e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  43.11 
 
 		 787 aa  359  7e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  42.32 
 
 		 517 aa  359  7e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  43.34 
 
 		 503 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  42.94 
 
 		 541 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  43.85 
 
 		 489 aa  358  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  42.83 
 
 		 864 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  42.69 
 
 		 541 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  41.21 
 
 		 536 aa  356  5e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0879  cobyric acid synthase  43.27 
 
 		 523 aa  356  6.999999999999999e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  43.87 
 
 		 560 aa  356  7.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  46.77 
 
 		 495 aa  355  8.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  42.17 
 
 		 475 aa  355  1e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  43.31 
 
 		 858 aa  354  2e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  45.09 
 
 		 481 aa  355  2e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  45.02 
 
 		 506 aa  353  2.9999999999999997e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  42.64 
 
 		 556 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  42.04 
 
 		 490 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  36.88 
 
 		 494 aa  353  4e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3731  cobyric acid synthase  41.58 
 
 		 554 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.699118  normal  0.182347 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  43.25 
 
 		 502 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1038  cobyric acid synthase  42.99 
 
 		 510 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1646  cobyric acid synthase  45.22 
 
 		 488 aa  352  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  44.11 
 
 		 486 aa  351  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0848  cobyric acid synthase  46.32 
 
 		 501 aa  351  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2958  cobyric acid synthase  42.72 
 
 		 534 aa  351  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  43.21 
 
 		 526 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  40.81 
 
 		 777 aa  351  2e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>