249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3836 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  100 
 
 
340 aa  659    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  97.94 
 
 
351 aa  643    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  73.9 
 
 
340 aa  470  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  68.25 
 
 
337 aa  436  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  66.08 
 
 
339 aa  425  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  65.19 
 
 
339 aa  423  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  65.38 
 
 
340 aa  419  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  64.41 
 
 
340 aa  411  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  63.5 
 
 
337 aa  412  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  64.31 
 
 
337 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  64.22 
 
 
340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  62.02 
 
 
343 aa  402  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  62.2 
 
 
341 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  61.36 
 
 
343 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  58.82 
 
 
344 aa  390  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  61.36 
 
 
340 aa  388  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  61.65 
 
 
339 aa  386  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  60.77 
 
 
337 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  59.36 
 
 
347 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  59.36 
 
 
347 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  59.36 
 
 
347 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  58.58 
 
 
343 aa  372  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  58.88 
 
 
344 aa  373  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  57.48 
 
 
339 aa  368  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  58.41 
 
 
343 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  57.23 
 
 
343 aa  362  4e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  58.55 
 
 
346 aa  361  1e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  58.53 
 
 
341 aa  350  2e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  58.17 
 
 
351 aa  345  5e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  57.51 
 
 
346 aa  344  1e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  55.19 
 
 
340 aa  334  1e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2236  heat-inducible transcription repressor  54.63 
 
 
337 aa  333  2e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00592229  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1973  heat-inducible transcription repressor  52.99 
 
 
337 aa  314  9.999999999999999e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11690  heat-inducible transcription repressor HrcA  51.91 
 
 
350 aa  308  8e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428721  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12370  heat-inducible transcription repressor HrcA  53.98 
 
 
337 aa  298  7e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0321909  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17300  heat-inducible transcription repressor HrcA  49.41 
 
 
336 aa  292  5e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.03 
 
 
345 aa  267  2e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0443  heat-inducible transcription repressor  41.8 
 
 
372 aa  263  2e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0786222  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.06 
 
 
343 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.2 
 
 
347 aa  209  7e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.06 
 
 
347 aa  205  8e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.55 
 
 
345 aa  203  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.97 
 
 
344 aa  202  7e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.6 
 
 
344 aa  202  9e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  36.69 
 
 
336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  33.63 
 
 
344 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.31 
 
 
343 aa  200  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.92 
 
 
343 aa  199  6e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.52 
 
 
343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  39.41 
 
 
336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.43 
 
 
341 aa  195  9e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  30.84 
 
 
344 aa  193  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  33.24 
 
 
360 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  30.06 
 
 
339 aa  189  5e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  30.06 
 
 
339 aa  189  7e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.71 
 
 
337 aa  187  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.12 
 
 
348 aa  186  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.2 
 
 
342 aa  186  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.83 
 
 
351 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.17 
 
 
354 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.99 
 
 
345 aa  182  7e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.09 
 
 
344 aa  180  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  32.28 
 
 
339 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.27 
 
 
343 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.36 
 
 
344 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.64 
 
 
343 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.55 
 
 
355 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.14 
 
 
343 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.71 
 
 
359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.2 
 
 
353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.2 
 
 
353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.94 
 
 
345 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.47 
 
 
343 aa  172  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  33.52 
 
 
352 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3462  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.95 
 
 
359 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000760738 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0102  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.38 
 
 
363 aa  171  2e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.354305  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.57 
 
 
357 aa  170  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5123  heat-inducible transcription repressor  34.6 
 
 
364 aa  169  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1661  heat-inducible transcription repressor  34.23 
 
 
365 aa  168  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10502  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  30.35 
 
 
342 aa  168  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0712  heat-inducible transcription repressor  32.27 
 
 
370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0259646  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1663  heat-inducible transcription repressor  35.03 
 
 
367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1168  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.4 
 
 
337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.61 
 
 
348 aa  166  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0875  heat-inducible transcription repressor  30.64 
 
 
360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0901  heat-inducible transcription repressor  30.64 
 
 
360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.95 
 
 
357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  28.15 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  28.07 
 
 
338 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3579  heat-inducible transcription repressor  32.87 
 
 
354 aa  162  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.621722  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2083  heat-inducible transcription repressor  33.33 
 
 
355 aa  162  8.000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  28.36 
 
 
338 aa  162  9e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  27.78 
 
 
338 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  33.13 
 
 
349 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.41 
 
 
350 aa  161  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  27.98 
 
 
343 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2127  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.13 
 
 
373 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.65 
 
 
343 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  28.36 
 
 
338 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  27.57 
 
 
338 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>