More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3820 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
276 aa  540  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3441  alpha/beta hydrolase fold  84.31 
 
 
309 aa  449  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4242  alpha/beta hydrolase fold protein  59.26 
 
 
271 aa  294  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.992424  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4800  alpha/beta hydrolase fold protein  52.03 
 
 
283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176635  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  51.69 
 
 
277 aa  242  6e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2129  alpha/beta hydrolase fold protein  50.37 
 
 
291 aa  228  8e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  46.79 
 
 
288 aa  221  7e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5124  alpha/beta hydrolase fold protein  50.96 
 
 
272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0146  alpha/beta hydrolase fold protein  50.37 
 
 
281 aa  209  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  50.19 
 
 
278 aa  209  5e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287872  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3859  alpha/beta hydrolase fold  50.55 
 
 
278 aa  202  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1694  alpha/beta hydrolase fold protein  45.85 
 
 
277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0287329  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  45.86 
 
 
273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6199  alpha/beta hydrolase fold protein  44.66 
 
 
296 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82135  normal  0.298395 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  46.42 
 
 
311 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  46.42 
 
 
311 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  47.13 
 
 
349 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  46.42 
 
 
296 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  46.18 
 
 
296 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  46.42 
 
 
296 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  46.42 
 
 
296 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  46.42 
 
 
296 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  48.62 
 
 
274 aa  185  9e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3635  alpha/beta hydrolase fold protein  43.45 
 
 
281 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0485  alpha/beta hydrolase fold  45.25 
 
 
284 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.891583  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0496  alpha/beta hydrolase fold  45.25 
 
 
284 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0507  alpha/beta hydrolase fold  45.25 
 
 
284 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.697131 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  37.08 
 
 
283 aa  159  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  37.22 
 
 
291 aa  155  9e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  39.46 
 
 
289 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  34.53 
 
 
288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4229  alpha/beta hydrolase fold  38.93 
 
 
328 aa  152  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 
293 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  35.66 
 
 
297 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  34.69 
 
 
287 aa  145  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  34.4 
 
 
308 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  36.43 
 
 
287 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  32.84 
 
 
292 aa  143  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.95 
 
 
293 aa  143  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  34.2 
 
 
301 aa  141  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  34.8 
 
 
288 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  35.21 
 
 
288 aa  139  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  36.19 
 
 
328 aa  137  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  35.8 
 
 
286 aa  137  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  34.07 
 
 
288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  33.2 
 
 
284 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  33.82 
 
 
297 aa  136  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  34.63 
 
 
287 aa  135  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  37.1 
 
 
270 aa  135  7.000000000000001e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  36.82 
 
 
300 aa  133  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  30.19 
 
 
290 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 
289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 
289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 
312 aa  126  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1416  Alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
306 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75275  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  32.49 
 
 
304 aa  124  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
287 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  34.59 
 
 
293 aa  123  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 
300 aa  122  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 
287 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  33.94 
 
 
308 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2917  alpha/beta hydrolase  32.73 
 
 
295 aa  119  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 
337 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
313 aa  119  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  34.44 
 
 
311 aa  116  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 
306 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  31.94 
 
 
289 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  35.66 
 
 
304 aa  115  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  34.69 
 
 
308 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 
291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  32.99 
 
 
323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  29.62 
 
 
322 aa  112  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 
314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 
331 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 
307 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  27.81 
 
 
331 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
341 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  32.99 
 
 
323 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  34.75 
 
 
294 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  30.48 
 
 
299 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  31.76 
 
 
317 aa  106  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1919  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
309 aa  105  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
315 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
315 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
328 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  32.45 
 
 
301 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  31.85 
 
 
308 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  35.51 
 
 
311 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  31.62 
 
 
307 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 
315 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  37.13 
 
 
308 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  30.48 
 
 
302 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  25.83 
 
 
303 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 
323 aa  99  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  47.71 
 
 
356 aa  99  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  48.08 
 
 
351 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
306 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>