More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3814 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 331 aa  673    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  80.73 
 
 		 358 aa  537  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  46.29 
 
 		 311 aa  300  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  52.54 
 
 		 311 aa  295  6e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  50.51 
 
 		 311 aa  287  2e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  47.16 
 
 		 320 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2343  periplasmic solute binding protein  48.89 
 
 		 312 aa  279  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  46.03 
 
 		 312 aa  276  4e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  48.31 
 
 		 315 aa  274  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  47.47 
 
 		 312 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  47.91 
 
 		 324 aa  266  5e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  39.39 
 
 		 314 aa  240  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  46.1 
 
 		 311 aa  239  6.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  39.34 
 
 		 308 aa  226  4e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1859  periplasmic solute binding protein  39.39 
 
 		 362 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36810  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  42.02 
 
 		 288 aa  222  8e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00286711  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3749  periplasmic solute binding protein  39.34 
 
 		 294 aa  220  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  hitchhiker  0.00387824 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2168  periplasmic solute binding protein  44.26 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0250158  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0522  periplasmic solute binding protein  43.65 
 
 		 349 aa  217  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17080  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  39.93 
 
 		 347 aa  205  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222095  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0088  periplasmic solute binding protein  40.77 
 
 		 308 aa  202  8e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  34.34 
 
 		 317 aa  199  7e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  40.06 
 
 		 332 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  39.12 
 
 		 349 aa  195  1e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  34.67 
 
 		 309 aa  189  8e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  33.23 
 
 		 307 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  32.23 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  36.31 
 
 		 328 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  34 
 
 		 317 aa  178  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  34 
 
 		 317 aa  178  9e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  33.43 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  34.53 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  34.53 
 
 		 316 aa  176  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  32.53 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  32.83 
 
 		 316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  33.13 
 
 		 316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  32.83 
 
 		 316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  32.83 
 
 		 316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11830  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  34.93 
 
 		 339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00348761  normal  0.825122 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  31.93 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  29.64 
 
 		 314 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  32.83 
 
 		 316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  33.01 
 
 		 514 aa  160  3e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  34.77 
 
 		 333 aa  160  4e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  34.64 
 
 		 345 aa  158  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  32.8 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  31.15 
 
 		 296 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  29.66 
 
 		 293 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  30.15 
 
 		 304 aa  152  8e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  32.85 
 
 		 265 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  32.59 
 
 		 321 aa  149  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  31.23 
 
 		 326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  28.62 
 
 		 323 aa  148  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1234  laminin-binding surface protein  32.92 
 
 		 306 aa  146  5e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000444188  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  30.74 
 
 		 313 aa  146  5e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  31.75 
 
 		 316 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  42.26 
 
 		 506 aa  145  9e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  29.09 
 
 		 307 aa  144  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  26.58 
 
 		 301 aa  142  9e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  30.77 
 
 		 318 aa  139  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2383  ABC transporter, substrate-binding protein  28.09 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  31.09 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  27.11 
 
 		 298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  27.11 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  30.13 
 
 		 304 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0598  periplasmic solute binding protein  26.71 
 
 		 333 aa  129  8.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  29.15 
 
 		 285 aa  129  9.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  27.66 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  29.5 
 
 		 280 aa  127  4.0000000000000003e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2430  ribulose-phosphate 3-epimerase  27.24 
 
 		 515 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000562899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2478  ribulose-phosphate 3-epimerase  27.24 
 
 		 515 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00360703  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  30.38 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  34.04 
 
 		 346 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  28.75 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  29.1 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  32.62 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  29.21 
 
 		 292 aa  123  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  29.06 
 
 		 303 aa  123  5e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  27.39 
 
 		 317 aa  122  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  31 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  29.63 
 
 		 292 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  32.47 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  26.75 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  29.1 
 
 		 309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2140  high-affinity zinc transporter periplasmic component  27.93 
 
 		 318 aa  119  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000251275  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2081  adhesion lipoprotein, putative  24.32 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2027  high-affinity zinc transporter periplasmic component  27.93 
 
 		 318 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000130529  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  30.26 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  30.3 
 
 		 323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  30.92 
 
 		 344 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1697  periplasmic solute binding protein  29.23 
 
 		 347 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  29.78 
 
 		 323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  30.49 
 
 		 294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  30.16 
 
 		 353 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  30.14 
 
 		 308 aa  116  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  29.67 
 
 		 310 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2190  periplasmic solute binding protein  29.8 
 
 		 287 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  25.53 
 
 		 290 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  28.74 
 
 		 368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  29.67 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.165215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>