43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3632 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3632  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  708    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.960299  hitchhiker  0.000777335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3390  hypothetical protein  80.4 
 
 
356 aa  568  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0370  hypothetical protein  50.63 
 
 
335 aa  308  6.999999999999999e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0441  hypothetical protein  50.97 
 
 
333 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4018  hypothetical protein  41.35 
 
 
331 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0443  hypothetical protein  41.11 
 
 
366 aa  233  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0531  hypothetical protein  40 
 
 
338 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202558  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1132  hypothetical protein  39.05 
 
 
300 aa  192  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0290503 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1133  hypothetical protein  34.87 
 
 
358 aa  172  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3631  hypothetical protein  28.31 
 
 
336 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2500  hypothetical protein  23.99 
 
 
339 aa  87  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718285  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0804  hypothetical protein  23.91 
 
 
349 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2527  hypothetical protein  33.13 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2434  hypothetical protein  41.84 
 
 
324 aa  77  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.259817  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7309  hypothetical protein  28.16 
 
 
324 aa  76.3  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7968  hypothetical protein  35.48 
 
 
303 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0305  hypothetical protein  33.06 
 
 
317 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.34 
 
 
554 aa  73.6  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0930  hypothetical protein  33.58 
 
 
357 aa  73.2  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0294  hypothetical protein  23.78 
 
 
322 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2764  hypothetical protein  34.96 
 
 
294 aa  68.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  34.38 
 
 
364 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  30.72 
 
 
547 aa  64.3  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1943  hypothetical protein  36.05 
 
 
289 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.762706  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0032  group B streptococcal surface immunogenic protein  29.59 
 
 
434 aa  52.8  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  34.12 
 
 
1048 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27870  hypothetical protein  31.71 
 
 
227 aa  47.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.86582  normal  0.0220968 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3878  LGFP repeat protein  51.11 
 
 
407 aa  47.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0449633 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  29.27 
 
 
391 aa  46.2  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3457  hypothetical protein  30.11 
 
 
220 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102904  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  24.56 
 
 
348 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2934  hypothetical protein  33.33 
 
 
251 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2948  hypothetical protein  33.33 
 
 
251 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2368  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  30.49 
 
 
288 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.238108  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2904  hypothetical protein  33.33 
 
 
251 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  24.81 
 
 
337 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  32.22 
 
 
320 aa  43.9  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  24.19 
 
 
350 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3215  hypothetical protein  38.89 
 
 
216 aa  43.1  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  27.62 
 
 
437 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  27.62 
 
 
437 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  25.15 
 
 
337 aa  42.7  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  23.48 
 
 
333 aa  42.7  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>