More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3595 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 402 aa  790    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  84.71 
 
 		 412 aa  612  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  52.75 
 
 		 383 aa  356  3.9999999999999996e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  54.11 
 
 		 378 aa  347  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  51.52 
 
 		 369 aa  347  3e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  55.42 
 
 		 391 aa  344  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  49.75 
 
 		 356 aa  335  5.999999999999999e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  48.87 
 
 		 365 aa  323  4e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  48.87 
 
 		 365 aa  323  4e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  48.87 
 
 		 365 aa  323  4e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  49.75 
 
 		 370 aa  321  9.999999999999999e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  47.82 
 
 		 411 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  47.15 
 
 		 440 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  50 
 
 		 378 aa  302  7.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  50.25 
 
 		 378 aa  301  2e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  48.73 
 
 		 363 aa  298  9e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  51.27 
 
 		 364 aa  298  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  46.85 
 
 		 382 aa  296  6e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  45.29 
 
 		 401 aa  272  7e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  48.23 
 
 		 366 aa  239  8e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  42.79 
 
 		 412 aa  219  6e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  50.23 
 
 		 427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  71.76 
 
 		 137 aa  182  8.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  63.38 
 
 		 452 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  48.8 
 
 		 218 aa  157  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  46.04 
 
 		 215 aa  156  6e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  59.54 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  54.96 
 
 		 133 aa  129  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  47.97 
 
 		 198 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  35.92 
 
 		 208 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 		 209 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  33.5 
 
 		 200 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  35.78 
 
 		 200 aa  113  6e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  35.78 
 
 		 200 aa  113  6e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  46.77 
 
 		 254 aa  113  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  35.78 
 
 		 200 aa  113  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  36.27 
 
 		 243 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  34.85 
 
 		 200 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  40.74 
 
 		 214 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  45.16 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  45.16 
 
 		 168 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  45.16 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  35.92 
 
 		 200 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  47.29 
 
 		 197 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  37.38 
 
 		 214 aa  107  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1173  ribonuclease H  32.98 
 
 		 194 aa  106  7e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.29 
 
 		 442 aa  106  8e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.52 
 
 		 442 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.27 
 
 		 444 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.18 
 
 		 201 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  32.18 
 
 		 213 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 		 212 aa  103  4e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  37.2 
 
 		 442 aa  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  34.8 
 
 		 235 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 213 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  32.73 
 
 		 217 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  36.36 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  34.93 
 
 		 205 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  39.6 
 
 		 211 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  48.03 
 
 		 132 aa  101  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 213 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  32.97 
 
 		 211 aa  100  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  32.21 
 
 		 213 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  31.96 
 
 		 448 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  35.61 
 
 		 211 aa  100  6e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  31.51 
 
 		 448 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.92 
 
 		 443 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  35.61 
 
 		 205 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0341  ribonuclease H  44.7 
 
 		 142 aa  98.2  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  33.84 
 
 		 213 aa  97.8  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 206 aa  97.1  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  31.5 
 
 		 202 aa  96.7  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1556  ribonuclease H  39.39 
 
 		 154 aa  96.3  9e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  36.1 
 
 		 253 aa  96.3  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  34.1 
 
 		 459 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.16 
 
 		 442 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  42.4 
 
 		 126 aa  95.5  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.09 
 
 		 449 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.64 
 
 		 442 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  33.84 
 
 		 200 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  38.42 
 
 		 207 aa  94.7  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  32.73 
 
 		 204 aa  94.4  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  33.01 
 
 		 201 aa  94  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 209 aa  93.6  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  33.01 
 
 		 201 aa  94  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  38.01 
 
 		 227 aa  93.2  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  30.56 
 
 		 447 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.67 
 
 		 442 aa  92.8  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 209 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.74 
 
 		 201 aa  92  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 		 200 aa  92  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 		 203 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  36.26 
 
 		 226 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  38.01 
 
 		 243 aa  90.5  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  35.08 
 
 		 228 aa  90.1  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 		 226 aa  90.1  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  34.95 
 
 		 198 aa  90.1  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  34.3 
 
 		 228 aa  90.1  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  38.67 
 
 		 208 aa  89.7  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  31.19 
 
 		 213 aa  89.7  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>