281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3535 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3535  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
325 aa  661    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32323  decreased coverage  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3303  ribokinase-like domain-containing protein  91.69 
 
 
325 aa  614  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.121546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4145  PfkB domain-containing protein  69.75 
 
 
327 aa  469  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786211  decreased coverage  0.0063394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3081  PfkB domain protein  67.18 
 
 
324 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1798  adenosine kinase  68.11 
 
 
326 aa  438  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527553  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3120  adenosine kinase  68.11 
 
 
326 aa  436  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2666  PfkB domain protein  68.73 
 
 
328 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1012  putative carbohydrate kinase  66.14 
 
 
324 aa  430  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1286  PfkB domain-containing protein  66.45 
 
 
328 aa  423  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3153  Adenosine kinase  63.78 
 
 
323 aa  413  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1665  Adenosine kinase  62.08 
 
 
329 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3144  ribokinase-like domain-containing protein  61.61 
 
 
327 aa  404  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3257  Adenosine kinase  64.86 
 
 
325 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00285447  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27030  sugar kinase, ribokinase  62.38 
 
 
321 aa  397  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.805869  normal  0.364358 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3294  PfkB domain protein  59.75 
 
 
325 aa  393  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0955  ribokinase-like domain-containing protein  60.37 
 
 
339 aa  390  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.989352  normal  0.38603 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2947  adenosine kinase  59.87 
 
 
323 aa  385  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3063  PfkB domain protein  59.75 
 
 
324 aa  381  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142988  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3300  adenosine kinase  58.51 
 
 
324 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3362  adenosine kinase  58.51 
 
 
324 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3566  adenosine kinase  59.94 
 
 
323 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0415989  normal  0.0392481 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3311  adenosine kinase  58.51 
 
 
324 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.353965  normal  0.464112 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12230  carbohydrate kinase cbhK  59.25 
 
 
324 aa  374  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000530804  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1531  PfkB domain protein  58.77 
 
 
329 aa  368  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0901719  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0158  ribokinase-like domain-containing protein  38.54 
 
 
327 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0487  ribokinase-like domain-containing protein  37.58 
 
 
327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2351  ribokinase-like domain-containing protein  38.14 
 
 
318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153207  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3562  PfkB domain protein  36.86 
 
 
324 aa  201  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0200  PfkB domain protein  36.1 
 
 
318 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3455  PfkB domain protein  33.23 
 
 
312 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.327587  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1195  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
316 aa  182  6e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0471  PfkB  33.55 
 
 
320 aa  179  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000138593  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1489  carbohydrate kinase  32.05 
 
 
308 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000020351  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2548  carbohydrate kinase, PfkB  32.8 
 
 
310 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636589  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0173  PfkB domain protein  31.09 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00145747  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2067  Adenosine kinase  31.09 
 
 
310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2001  ribokinase-like domain-containing protein  32.37 
 
 
308 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2945  PfkB domain protein  35.23 
 
 
298 aa  172  5e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3635  ribokinase-like domain-containing protein  35.23 
 
 
298 aa  172  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.151802  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3388  ribokinase-like domain-containing protein  34.88 
 
 
307 aa  169  7e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.684995 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04263  sugar kinase  31.53 
 
 
362 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.383154  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1103  PfkB  34.56 
 
 
300 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00948504  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0800  ribokinase-like domain-containing protein  32.69 
 
 
312 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2935  PfkB domain protein  31.63 
 
 
308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3036  PfkB domain protein  32.38 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1493  ribokinase-like domain-containing protein  35 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2626  PfkB domain protein  32.38 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1498  ribokinase-like domain-containing protein  33.89 
 
 
300 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  32.06 
 
 
315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0688  PfkB domain protein  32.59 
 
 
313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000405539  hitchhiker  0.000110738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0530  carbohydrate kinase, PfkB family  32.59 
 
 
313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00148509  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0207  ribokinase-like domain-containing protein  30.6 
 
 
319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000760585  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0047  carbohydrate kinase  32.37 
 
 
310 aa  162  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2791  putative sugar kinase transferase protein  32.06 
 
 
311 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00725009  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0209  PfkB  31.43 
 
 
311 aa  162  8.000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0225  PfkB domain protein  30.91 
 
 
319 aa  161  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145112  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3450  PfkB domain protein  33.23 
 
 
311 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3210  putative sugar kinase transferase protein  33.78 
 
 
301 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.258809  decreased coverage  0.003878 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0171  carbohydrate kinase  30.89 
 
 
310 aa  153  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.150341 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0861  ribokinase-like domain-containing protein  33.22 
 
 
298 aa  153  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.035179  normal  0.0608327 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0527  putative sugar kinase transferase, PfkB  31.86 
 
 
312 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2784  ribokinase-like domain-containing protein  31.11 
 
 
312 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.417689  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  28.85 
 
 
315 aa  149  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0526  ribokinase-like domain-containing protein  30.35 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.846303  normal  0.476119 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1158  ribokinase, putative  31.99 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0502  ribokinase-like domain-containing protein  30.74 
 
 
320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3506  sugar kinase  31.65 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3278  putative ribokinase  31.65 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3508  PfkB family kinase  31.65 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3470  PfkB family kinase  31.65 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0427  putative ribokinase  31.65 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1286  putative ribokinase  31.65 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3683  adenosine kinase  31.63 
 
 
312 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235022  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3431  PfkB domain protein  30.48 
 
 
312 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0295739  normal  0.0158701 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2634  ribokinase-like domain-containing protein  30.89 
 
 
314 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.831919  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3935  PfkB  29.62 
 
 
310 aa  145  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0713343  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0386  ribokinase-like domain-containing protein  31 
 
 
302 aa  143  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477103 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0953  PfkB domain protein  31.54 
 
 
300 aa  142  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.940655  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0569  ribokinase-like domain-containing protein  31.21 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  decreased coverage  0.0000690864 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0117  adenosine kinase  31.21 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0600  adenosine kinase  31.21 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  31.83 
 
 
302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  29.9 
 
 
302 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  29.58 
 
 
302 aa  133  5e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  28.3 
 
 
302 aa  123  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2506  ribokinase, putative  30.19 
 
 
283 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.617052  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  26.78 
 
 
298 aa  110  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  30.48 
 
 
299 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  28.22 
 
 
299 aa  97.4  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  31.85 
 
 
300 aa  89.7  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0859  ribokinase-like domain-containing protein  29.29 
 
 
296 aa  89.7  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.826184  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0932  inosine-guanosine kinase / cytidine kinase  28.85 
 
 
298 aa  84  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.934328  normal  0.0821037 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1085  PfkB domain protein  29.49 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000428719  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1080  PfkB domain protein  24.69 
 
 
317 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0480  PfkB domain protein  29.26 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1658  ribokinase-like domain-containing protein  25.49 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.468132  normal  0.0440332 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  23.57 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  26.1 
 
 
380 aa  65.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  26.79 
 
 
308 aa  62.8  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  25.95 
 
 
312 aa  62  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>