127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3295 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3295  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  523  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000891733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3068  hypothetical protein  90.81 
 
 
272 aa  450  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.125457 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1559  hypothetical protein  60.8 
 
 
266 aa  283  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0584838  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1735  hypothetical protein  59.92 
 
 
460 aa  263  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0241629  decreased coverage  0.000466005 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1153  protein of unknown function DUF692  45.73 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.298078  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2208  hypothetical protein  30.35 
 
 
287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3694  hypothetical protein  32.45 
 
 
279 aa  145  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0410237 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2222  hypothetical protein  33.2 
 
 
278 aa  145  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2180  hypothetical protein  30.35 
 
 
287 aa  142  5e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0967  hypothetical protein  31.8 
 
 
319 aa  142  8e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3406  hypothetical protein  30.62 
 
 
310 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11414  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6045  hypothetical protein  34.77 
 
 
283 aa  136  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0730342  normal  0.483974 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3392  hypothetical protein  31.4 
 
 
299 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1262  hypothetical protein  33.98 
 
 
318 aa  135  8e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.328602  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3517  hypothetical protein  31.01 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.753401 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3296  hypothetical protein  31.4 
 
 
299 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4062  hypothetical protein  30.86 
 
 
305 aa  133  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1061  hypothetical protein  31.01 
 
 
299 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359459 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0527  hypothetical protein  29.53 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.754891  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2831  hypothetical protein  33.46 
 
 
301 aa  130  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0904  hypothetical protein  30.47 
 
 
312 aa  129  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1558  hypothetical protein  33.73 
 
 
283 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.103302 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4400  hypothetical protein  39.41 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4684  hypothetical protein  37.86 
 
 
278 aa  125  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34246  normal  0.868171 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2359  hypothetical protein  34.39 
 
 
311 aa  125  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00353  hypothetical protein  33.59 
 
 
308 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0735  hypothetical protein  31.1 
 
 
294 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.291211 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6305  hypothetical protein  36.76 
 
 
280 aa  123  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.380484  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4291  hypothetical protein  39.23 
 
 
288 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4401  hypothetical protein  39.23 
 
 
288 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3398  hypothetical protein  33.07 
 
 
303 aa  122  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0783117  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3066  hypothetical protein  36.84 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.37853  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5938  hypothetical protein  33.46 
 
 
308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002084  hypothetical protein  31.06 
 
 
289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0303  hypothetical protein  35.5 
 
 
296 aa  119  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.371477 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2398  hypothetical protein  35.82 
 
 
277 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2450  hypothetical protein  32.83 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00881658  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0992  hypothetical protein  34.69 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3153  hypothetical protein  36.12 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0753442  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2259  hypothetical protein  32.45 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000651935  normal  0.545232 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2032  hypothetical protein  39.13 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.392339  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2190  hypothetical protein  36.6 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.84391  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2174  hypothetical protein  34.87 
 
 
303 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2030  hypothetical protein  34.87 
 
 
293 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2008  hypothetical protein  32.83 
 
 
279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1009  hypothetical protein  30.15 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1029  hypothetical protein  34.31 
 
 
277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.752115 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4775  hypothetical protein  29.17 
 
 
290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0971  hypothetical protein  30.15 
 
 
293 aa  116  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6425 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2857  hypothetical protein  32.33 
 
 
278 aa  116  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000347655 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3108  hypothetical protein  35.06 
 
 
283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02372  hypothetical protein  35.45 
 
 
285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.357992  normal  0.0533117 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0975  hypothetical protein  29.96 
 
 
293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2331  hypothetical protein  32.08 
 
 
279 aa  113  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000989316  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3297  hypothetical protein  35.21 
 
 
277 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.867164 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3130  hypothetical protein  34.2 
 
 
292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1775  hypothetical protein  31.46 
 
 
281 aa  112  5e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3094  hypothetical protein  30.22 
 
 
277 aa  112  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0724  hypothetical protein  27.17 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0732  hypothetical protein  32.9 
 
 
275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1242  hypothetical protein  33.83 
 
 
298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.933604 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4384  hypothetical protein  29.77 
 
 
300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0181481 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1004  hypothetical protein  29.55 
 
 
290 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863702  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1138  hypothetical protein  27.59 
 
 
367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2240  hypothetical protein  31.58 
 
 
278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000381376  hitchhiker  0.000876549 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2695  hypothetical protein  30.94 
 
 
289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00011236  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2003  hypothetical protein  35.02 
 
 
277 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.912952  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5128  hypothetical protein  32.57 
 
 
307 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0944  hypothetical protein  29.12 
 
 
284 aa  109  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.98615 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2900  hypothetical protein  31.32 
 
 
282 aa  109  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0712  hypothetical protein  32.9 
 
 
275 aa  108  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1607  hypothetical protein  34.34 
 
 
320 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1764  hypothetical protein  30.94 
 
 
289 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0025937  normal  0.0109092 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1554  hypothetical protein  37.5 
 
 
280 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.220831 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2579  hypothetical protein  30.94 
 
 
289 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00624438  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2620  hypothetical protein  31.32 
 
 
288 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000591272  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0773  hypothetical protein  32.44 
 
 
316 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.91386  normal  0.243423 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0704  hypothetical protein  27.17 
 
 
289 aa  106  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0846  hypothetical protein  29.93 
 
 
311 aa  106  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4790  hypothetical protein  33.33 
 
 
300 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0757  hypothetical protein  34.85 
 
 
276 aa  106  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1723  hypothetical protein  32.05 
 
 
283 aa  105  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01094  hypothetical protein  28.41 
 
 
283 aa  105  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0997289  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1788  hypothetical protein  30.22 
 
 
278 aa  105  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000100134 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1305  hypothetical protein  34.36 
 
 
291 aa  105  9e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.330385 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1430  hypothetical protein  32.95 
 
 
307 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.51935  normal  0.711146 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1381  hypothetical protein  27.53 
 
 
295 aa  104  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0499971  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3267  protein of unknown function DUF692  29.3 
 
 
339 aa  104  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2307  hypothetical protein  30.38 
 
 
300 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2081  hypothetical protein  36.47 
 
 
279 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0291  protein of unknown function DUF692  35.09 
 
 
282 aa  102  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3392  hypothetical protein  31.82 
 
 
300 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1763  protein of unknown function DUF692  34.23 
 
 
297 aa  102  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.944957  normal  0.0149585 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1305  hypothetical protein  31.66 
 
 
278 aa  102  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0297196  normal  0.064547 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0120  hypothetical protein  28.52 
 
 
290 aa  102  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2412  hypothetical protein  28.79 
 
 
287 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00339272  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0989  hypothetical protein  35.71 
 
 
276 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3962  hypothetical protein  31.8 
 
 
296 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.019618 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20741  hypothetical protein  27.67 
 
 
292 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2533  hypothetical protein  32.34 
 
 
309 aa  99.4  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00022761 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>