288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3186 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  85.04 
 
 		 468 aa  724    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  100 
 
 		 467 aa  941    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  73.53 
 
 		 613 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  64.43 
 
 		 551 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1220  Carbohydrate-binding CenC domain protein  63.96 
 
 		 510 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  62 
 
 		 648 aa  395  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0735  glycoside hydrolase family 18  62.21 
 
 		 341 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1458  glycosyl hydrolase family chitinase  63.24 
 
 		 460 aa  341  1e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  52.83 
 
 		 420 aa  331  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  37.85 
 
 		 543 aa  208  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3469  chitinase  34.01 
 
 		 360 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3571  extracellular exochitinase Chi36  34.01 
 
 		 360 aa  200  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.297633  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3854  extracellular exochitinase Chi36  34.01 
 
 		 360 aa  200  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.063231  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3483  chitinase  34.01 
 
 		 360 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.219436  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  35.86 
 
 		 680 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3824  extracellular exochitinase Chi36  32.95 
 
 		 360 aa  188  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  33.62 
 
 		 1362 aa  188  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3490  glycoside hydrolase family protein  33.24 
 
 		 360 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.678093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1478  extracellular exochitinase Chi36  33.24 
 
 		 360 aa  187  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17366  hitchhiker  0.000283046 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3775  extracellular exochitinase Chi36  32.85 
 
 		 360 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3753  extracellular exochitinase Chi36  32.66 
 
 		 360 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.007807  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  33.96 
 
 		 846 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  33.96 
 
 		 846 aa  177  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  33.75 
 
 		 848 aa  172  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4053  glycoside hydrolase family 18  32.47 
 
 		 376 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  33.44 
 
 		 846 aa  169  9e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  63.83 
 
 		 462 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  61.7 
 
 		 459 aa  139  8.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  27.47 
 
 		 1578 aa  123  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  52.29 
 
 		 514 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3735  extracellular exochitinase Chi36  40.88 
 
 		 189 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.72466e-18 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  35.84 
 
 		 539 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  55.56 
 
 		 552 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  30.63 
 
 		 540 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  48.62 
 
 		 637 aa  106  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  32.21 
 
 		 536 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  51.46 
 
 		 466 aa  103  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  27.43 
 
 		 598 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0693  glycoside hydrolase family protein  29.08 
 
 		 471 aa  99.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  29.12 
 
 		 727 aa  99.4  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3568  glycosyl hydrolase family chitinase  29.79 
 
 		 353 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  28.9 
 
 		 507 aa  98.2  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  29.13 
 
 		 483 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1121  hypothetical protein  28.17 
 
 		 782 aa  97.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0611  glycosy hydrolase family protein  28.76 
 
 		 471 aa  97.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  27.14 
 
 		 803 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  32.81 
 
 		 542 aa  95.9  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  29.13 
 
 		 483 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  28.31 
 
 		 565 aa  95.1  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1117  hypothetical protein  27.33 
 
 		 782 aa  92  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2205  glycosyl hydrolase family chitinase  27.22 
 
 		 492 aa  91.7  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4407  hypothetical protein  30.99 
 
 		 245 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  28.43 
 
 		 729 aa  91.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  28.43 
 
 		 729 aa  91.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  27.83 
 
 		 484 aa  91.3  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4225  Carbohydrate-binding CenC domain protein  27.33 
 
 		 551 aa  90.9  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6988  lysozyme  28.45 
 
 		 539 aa  90.5  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14763  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  44.54 
 
 		 652 aa  90.5  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7432  Chitinase-like protein  27.05 
 
 		 516 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  27.24 
 
 		 699 aa  87.8  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  32.3 
 
 		 532 aa  84.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  42.55 
 
 		 489 aa  82  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3736  chitinase D  32.56 
 
 		 174 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61469e-18 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  46.43 
 
 		 456 aa  80.1  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  43 
 
 		 494 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  43.16 
 
 		 1007 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  39.62 
 
 		 562 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  46.43 
 
 		 422 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  46.32 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  42.55 
 
 		 623 aa  77.4  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  44.21 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.38 
 
 		 984 aa  77  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  46.07 
 
 		 366 aa  77  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  44.09 
 
 		 846 aa  77  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  39.39 
 
 		 778 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  44.68 
 
 		 487 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  44.57 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  42.86 
 
 		 934 aa  75.5  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  43.01 
 
 		 580 aa  75.5  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  44.71 
 
 		 1209 aa  75.1  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  45.71 
 
 		 894 aa  75.1  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  44.68 
 
 		 690 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  40.91 
 
 		 474 aa  74.7  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  42.11 
 
 		 842 aa  73.9  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  29.11 
 
 		 486 aa  73.9  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  39.8 
 
 		 925 aa  73.9  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  43.62 
 
 		 646 aa  73.9  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  35.07 
 
 		 1128 aa  73.6  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  44.44 
 
 		 763 aa  73.6  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  28.66 
 
 		 773 aa  73.2  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  38.14 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  41.67 
 
 		 596 aa  72.8  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  44.68 
 
 		 854 aa  73.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  38.46 
 
 		 851 aa  73.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  37.9 
 
 		 997 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  43.88 
 
 		 694 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  45.56 
 
 		 938 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  38.78 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1459  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  68.89 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  42.86 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>