288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3185 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3185  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 442 aa  907    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304651  hitchhiker  0.000303065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1725  monooxygenase, FAD-binding  94.34 
 
 		 442 aa  868    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.600174 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3109  monooxygenase FAD-binding  66.06 
 
 		 444 aa  584  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3959  monooxygenase FAD-binding  39.37 
 
 		 411 aa  250  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2934  monooxygenase, FAD-binding  39.02 
 
 		 402 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2294  monooxygenase, FAD-binding  39.02 
 
 		 407 aa  242  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.539275  hitchhiker  0.00707471 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1150  monooxygenase FAD-binding protein  36.45 
 
 		 397 aa  206  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862466  normal  0.995827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4487  monooxygenase FAD-binding  39.45 
 
 		 385 aa  189  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2577  monooxygenase FAD-binding  33.89 
 
 		 397 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.205259 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4239  monooxygenase FAD-binding  36 
 
 		 407 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2256  FAD-binding monooxygenase  35.63 
 
 		 399 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2944  monooxygenase, FAD-binding protein  30.17 
 
 		 436 aa  134  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  29.06 
 
 		 413 aa  96.7  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  30.59 
 
 		 441 aa  86.7  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  30.55 
 
 		 419 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  30.55 
 
 		 419 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  24.86 
 
 		 461 aa  79  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  29.3 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  27.3 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  28.18 
 
 		 419 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4211  monooxygenase FAD-binding  26.13 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747744  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  26.15 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  32.11 
 
 		 434 aa  74.7  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  28.45 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  33.5 
 
 		 431 aa  73.6  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  24.24 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  25.71 
 
 		 449 aa  72.8  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  25.36 
 
 		 495 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1178  monooxygenase FAD-binding protein  27.3 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.0113639 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  30.73 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5129  monooxygenase FAD-binding  26.82 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  21.91 
 
 		 444 aa  70.5  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  26.08 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  31.33 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  28.02 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  29.26 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  29.63 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  29.63 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  29.63 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0084  putative oxidoreductase FixC  29.63 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  33.85 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0047  putative oxidoreductase FixC  28.88 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0047  putative oxidoreductase FixC  27.96 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  26.83 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3612  putative oxidoreductase FixC  28.88 
 
 		 428 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0214955 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00047  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  28.88 
 
 		 428 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3556  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 		 428 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0075  hypothetical protein  25.5 
 
 		 404 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0049  putative oxidoreductase FixC  28.88 
 
 		 428 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  24.36 
 
 		 414 aa  67  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00046  hypothetical protein  28.88 
 
 		 428 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  25.69 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0904  putative monooxygenase  30.35 
 
 		 401 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09700  putative monooxygenase  30.55 
 
 		 401 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000279069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  25.07 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  33.65 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  27.1 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  33.51 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  25 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  26.92 
 
 		 470 aa  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0045  putative oxidoreductase FixC  28.34 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820288  normal  0.96055 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  31.77 
 
 		 424 aa  63.2  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  24.65 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4276  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  31.96 
 
 		 434 aa  63.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  30.48 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  27.93 
 
 		 455 aa  62.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  22.04 
 
 		 455 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  25 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  29.7 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  30.37 
 
 		 425 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3653  monooxygenase FAD-binding  27.64 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  29.35 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  28.26 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  24.78 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1983  hypothetical protein  33.5 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  30.41 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  24.78 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  31.41 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  25.66 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  32.35 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4041  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1397  hypothetical protein  27.03 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222986  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  28.04 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  25.14 
 
 		 409 aa  59.7  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  24.72 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  28.1 
 
 		 409 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  25.14 
 
 		 491 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  30.41 
 
 		 432 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  26.45 
 
 		 506 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  25.36 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  24.21 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2679  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  28 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  24.64 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  31.22 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  23.42 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7737  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  28.43 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  26.13 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  30.59 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  28.87 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>