13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3118 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3118  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  457  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.27418  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2918  hypothetical protein  84.19 
 
 
233 aa  378  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4225  hypothetical protein  46.61 
 
 
227 aa  185  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3494  hypothetical protein  33.82 
 
 
221 aa  57  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0947  hypothetical protein  31.34 
 
 
220 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.667579  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3849  hypothetical protein  31.28 
 
 
263 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2897  hypothetical protein  30.81 
 
 
218 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0093  hypothetical protein  31.25 
 
 
270 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5026  hypothetical protein  32.58 
 
 
198 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2113  hypothetical protein  32.1 
 
 
243 aa  42.7  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0690  hypothetical protein  25 
 
 
237 aa  42.4  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.435926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0318  hypothetical protein  26.67 
 
 
203 aa  42  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1122  hypothetical protein  29.49 
 
 
261 aa  42  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220847  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>