88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3043 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  100 
 
 
464 aa  920  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  63.11 
 
 
464 aa  491  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  60.5 
 
 
468 aa  478  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  61.74 
 
 
455 aa  475  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  61.1 
 
 
462 aa  463  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  3.56618e-05 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  59.48 
 
 
454 aa  458  1e-128  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  56.78 
 
 
465 aa  422  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  6.65337e-05 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  53.12 
 
 
464 aa  418  1e-115  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  5.19323e-05 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  52.87 
 
 
459 aa  406  1e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  56.33 
 
 
441 aa  408  1e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  52.92 
 
 
454 aa  399  1e-110  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  53.12 
 
 
454 aa  391  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  51.59 
 
 
465 aa  385  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  52.84 
 
 
467 aa  379  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  52.54 
 
 
460 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  53.88 
 
 
450 aa  372  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  52.14 
 
 
557 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  54.24 
 
 
457 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  51.65 
 
 
479 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  51.28 
 
 
459 aa  368  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  5.85185e-05 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  52.55 
 
 
462 aa  360  4e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  50 
 
 
452 aa  353  4e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  50.21 
 
 
461 aa  353  4e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  49 
 
 
493 aa  352  6e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  49.39 
 
 
489 aa  350  3e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  47.66 
 
 
461 aa  346  4e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  56.33 
 
 
361 aa  345  7e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  49.47 
 
 
466 aa  345  1e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  50.11 
 
 
462 aa  340  3e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  50.32 
 
 
457 aa  339  6e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  49.28 
 
 
476 aa  337  3e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  48.39 
 
 
464 aa  335  1e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  51.74 
 
 
446 aa  335  1e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  49.19 
 
 
496 aa  329  6e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  44.19 
 
 
505 aa  328  1e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  47.84 
 
 
478 aa  328  2e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  51.56 
 
 
435 aa  327  3e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  49.18 
 
 
477 aa  325  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  52.02 
 
 
435 aa  320  4e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  44.75 
 
 
466 aa  314  2e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  47.52 
 
 
432 aa  309  8e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  48.61 
 
 
448 aa  293  6e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  47.31 
 
 
473 aa  291  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  3.56618e-05 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  46.48 
 
 
439 aa  288  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  49.13 
 
 
415 aa  288  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  47.93 
 
 
433 aa  276  6e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  39.37 
 
 
509 aa  200  4e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  37.8 
 
 
483 aa  199  7e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  38.24 
 
 
476 aa  192  7e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  35.47 
 
 
481 aa  189  7e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  38.04 
 
 
477 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  42.06 
 
 
501 aa  174  3e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  35.19 
 
 
532 aa  172  9e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  34.9 
 
 
523 aa  159  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  31.37 
 
 
477 aa  134  2e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  30.69 
 
 
483 aa  133  7e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  41.57 
 
 
840 aa  99.4  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  39.25 
 
 
673 aa  94.4  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  46.43 
 
 
168 aa  75.5  2e-12  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  28.25 
 
 
767 aa  70.9  5e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  28.91 
 
 
1296 aa  66.6  9e-10  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  28.91 
 
 
759 aa  66.2  1e-09  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  27.21 
 
 
558 aa  65.5  2e-09  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  3.00518e-08 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  26.1 
 
 
530 aa  64.3  5e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  27.49 
 
 
541 aa  63.5  7e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1790  polymorphic membrane protein  31.01 
 
 
799 aa  61.6  3e-08  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  25.65 
 
 
591 aa  59.7  1e-07  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  37.4 
 
 
362 aa  57  6e-07  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  28.51 
 
 
575 aa  57  8e-07  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  31.52 
 
 
523 aa  55.5  2e-06  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.25 
 
 
884 aa  55.5  2e-06  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  25.66 
 
 
527 aa  54.3  5e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  27.39 
 
 
852 aa  52.8  1e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2156  polymorphic outer membrane protein  36.84 
 
 
526 aa  51.6  3e-05  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927153  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  26.52 
 
 
601 aa  51.2  4e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  1.40285e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  26.89 
 
 
1318 aa  50.8  5e-05  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  28.73 
 
 
2160 aa  49.7  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1921  hypothetical protein  33.7 
 
 
350 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2246  hypothetical protein  23.51 
 
 
591 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.105015  normal  0.0180285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  36.91 
 
 
1037 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  28.11 
 
 
593 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  28.52 
 
 
575 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3707  polymorphic outer membrane protein  26.09 
 
 
518 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  8.78669e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  24.54 
 
 
1106 aa  44.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  25.79 
 
 
1010 aa  43.9  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  30.82 
 
 
1332 aa  43.9  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0765  hypothetical protein  34.59 
 
 
294 aa  43.5  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  25.35 
 
 
5453 aa  43.5  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.119049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>