More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2987 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  94.42 
 
 		 553 aa  965    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  100 
 
 		 555 aa  1102    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  58.96 
 
 		 554 aa  565  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  56.9 
 
 		 536 aa  529  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  57.63 
 
 		 549 aa  528  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  51.69 
 
 		 558 aa  499  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  53.32 
 
 		 541 aa  484  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  50.19 
 
 		 541 aa  479  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  52.27 
 
 		 535 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  49.36 
 
 		 544 aa  464  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  51.4 
 
 		 537 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  51.4 
 
 		 537 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  51.4 
 
 		 537 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  50.95 
 
 		 516 aa  436  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  47.37 
 
 		 548 aa  425  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  49.53 
 
 		 565 aa  395  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  45.39 
 
 		 535 aa  395  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  46.98 
 
 		 520 aa  383  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  43.5 
 
 		 531 aa  380  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0217  ABC transporter related protein  45.58 
 
 		 511 aa  369  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  46.83 
 
 		 530 aa  364  2e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  40.34 
 
 		 531 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  39.73 
 
 		 530 aa  324  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  33.46 
 
 		 534 aa  313  6.999999999999999e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  38.61 
 
 		 527 aa  307  3e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  39.12 
 
 		 524 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  40.75 
 
 		 534 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  38.19 
 
 		 533 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  39.47 
 
 		 532 aa  301  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  38.25 
 
 		 531 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  38.49 
 
 		 535 aa  297  4e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  37.24 
 
 		 526 aa  296  9e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  36.02 
 
 		 557 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  39.51 
 
 		 525 aa  281  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  31.45 
 
 		 528 aa  281  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  30.92 
 
 		 529 aa  279  8e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  40.08 
 
 		 546 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  32.7 
 
 		 529 aa  278  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  38.65 
 
 		 527 aa  272  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  39.1 
 
 		 546 aa  269  8e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  35.85 
 
 		 545 aa  269  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.5 
 
 		 548 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.82 
 
 		 536 aa  263  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  37.6 
 
 		 538 aa  263  6e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  37.66 
 
 		 548 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2310  ABC transporter related  36.59 
 
 		 551 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2924  ABC transporter related  36.59 
 
 		 551 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  39.46 
 
 		 524 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 		 548 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 		 548 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 		 548 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 		 548 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 		 548 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 		 548 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  40.49 
 
 		 534 aa  257  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  35.35 
 
 		 553 aa  257  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 		 548 aa  257  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  34.94 
 
 		 541 aa  257  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  37.22 
 
 		 550 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  29.25 
 
 		 529 aa  256  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  30.14 
 
 		 529 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  35.08 
 
 		 539 aa  255  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2097  ABC transporter related  31.63 
 
 		 530 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0494627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  33.33 
 
 		 530 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  34.72 
 
 		 535 aa  241  2.9999999999999997e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  36.94 
 
 		 532 aa  236  6e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  29.43 
 
 		 639 aa  224  2e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  33.27 
 
 		 525 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0945  ABC transporter related  30.22 
 
 		 580 aa  223  9.999999999999999e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001382  ABC-type transport system ATPase component  31.59 
 
 		 523 aa  219  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0479008  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1807  putative ATP-binding component of ABC transporter  32.05 
 
 		 531 aa  219  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.451616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2265  ABC transporter related  32.78 
 
 		 525 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  31.91 
 
 		 646 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  32.4 
 
 		 667 aa  210  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  32.9 
 
 		 690 aa  209  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  31.8 
 
 		 656 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  30.39 
 
 		 638 aa  204  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  29.47 
 
 		 581 aa  203  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  29.66 
 
 		 634 aa  202  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  32.7 
 
 		 540 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7527  hypothetical protein  36.42 
 
 		 536 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  31.42 
 
 		 540 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  30.4 
 
 		 636 aa  200  7e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  30.48 
 
 		 632 aa  200  7e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  32.42 
 
 		 540 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  30.88 
 
 		 564 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  32.33 
 
 		 540 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  31.5 
 
 		 543 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  27.8 
 
 		 634 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  30.08 
 
 		 630 aa  197  3e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  31.66 
 
 		 552 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  31.05 
 
 		 540 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  29.52 
 
 		 630 aa  196  6e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  31.88 
 
 		 540 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  32.47 
 
 		 545 aa  196  9e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  32.11 
 
 		 645 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  32.14 
 
 		 540 aa  196  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  30.84 
 
 		 540 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  32.86 
 
 		 550 aa  194  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  31.87 
 
 		 545 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>