More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2800 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
224 aa  449  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  86.61 
 
 
224 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  58.15 
 
 
183 aa  221  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  50.25 
 
 
229 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  42.71 
 
 
210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  44.85 
 
 
197 aa  162  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 
197 aa  159  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  40.5 
 
 
215 aa  158  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  40.5 
 
 
205 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  40.5 
 
 
205 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  40.1 
 
 
200 aa  154  8e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  45.05 
 
 
222 aa  153  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 
208 aa  149  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  40.31 
 
 
197 aa  149  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  43.62 
 
 
204 aa  144  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  39.38 
 
 
216 aa  140  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  32.51 
 
 
206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 
215 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  30.21 
 
 
198 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4158  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
445 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1717  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 
200 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  33.58 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  28.8 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2587  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
434 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2548  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
482 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2593  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
482 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
324 aa  64.3  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
197 aa  64.3  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  30.62 
 
 
208 aa  64.3  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 
208 aa  63.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
196 aa  62.8  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 
201 aa  62.8  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2057  transcriptional regulator, TetR family  40.37 
 
 
212 aa  63.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106608  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 
191 aa  62.4  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
209 aa  62.4  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 
202 aa  62  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  30.85 
 
 
196 aa  62  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  23.47 
 
 
202 aa  62  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 
211 aa  62  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2164  regulatory protein, TetR  26.44 
 
 
209 aa  62  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 
213 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  25 
 
 
190 aa  61.2  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 
209 aa  61.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
291 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 
199 aa  61.6  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 
307 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  24.36 
 
 
196 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  24.36 
 
 
192 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  24.36 
 
 
196 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  24.36 
 
 
192 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  24.36 
 
 
196 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 
195 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7312  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  24.36 
 
 
195 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  24.36 
 
 
196 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
225 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  41.56 
 
 
220 aa  60.8  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  35.4 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  33.81 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 
200 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 
203 aa  60.5  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  24.36 
 
 
196 aa  60.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  24.36 
 
 
196 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
208 aa  59.7  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 
183 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  39.36 
 
 
196 aa  59.3  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 
225 aa  59.7  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 
211 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 
212 aa  58.9  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 
202 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
203 aa  58.9  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
206 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
195 aa  58.5  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
197 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
197 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
197 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
220 aa  58.5  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  40 
 
 
198 aa  58.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  47.14 
 
 
210 aa  58.5  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
224 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6448  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 
222 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264064  hitchhiker  1.59583e-16 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
224 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>