183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2789 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 197 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  71.36 
 
 		 196 aa  222  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  35.15 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  39.86 
 
 		 226 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  44.64 
 
 		 226 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  36.19 
 
 		 226 aa  86.7  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  41.73 
 
 		 229 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  41.44 
 
 		 118 aa  85.1  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4979  hypothetical protein  35.14 
 
 		 198 aa  85.1  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  36.68 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  35.36 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  40.32 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  38.39 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2571  conserved hypothetical protein containing Cu resistance protein-like domain  37.95 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  41.44 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  33.33 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  30.22 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  35.75 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  35.51 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  35.51 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  37.62 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  35.62 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  31.94 
 
 		 869 aa  74.7  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  34 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  38.53 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  39.37 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  35.68 
 
 		 225 aa  72  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  41.41 
 
 		 265 aa  71.6  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  37.5 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  40.17 
 
 		 126 aa  70.5  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  38.24 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  34.38 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  29.46 
 
 		 544 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  29.46 
 
 		 544 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  27.27 
 
 		 544 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  36.36 
 
 		 528 aa  68.2  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  32.76 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  37.17 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  27.27 
 
 		 549 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  38.79 
 
 		 121 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36820  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  27.49 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00403371  normal  0.543816 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  38.98 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4926  copper resistance protein CopC  38.71 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  36.17 
 
 		 605 aa  66.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  36.19 
 
 		 559 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  37.8 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4407  copper resistance protein CopC  38.71 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  37.8 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  41.75 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5005  copper resistance protein CopC  33.51 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  27.43 
 
 		 547 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3307  copper resistance protein CopC  39.64 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.980594 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2054  copper resistance protein CopC  39.84 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4442  copper resistance protein CopC  35.45 
 
 		 424 aa  65.9  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  33.63 
 
 		 564 aa  65.5  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  39.13 
 
 		 607 aa  65.5  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  33.63 
 
 		 565 aa  65.5  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  37.93 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  33.9 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  27.43 
 
 		 544 aa  64.3  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  37.11 
 
 		 539 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  28.57 
 
 		 547 aa  64.3  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  27.56 
 
 		 547 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  29.25 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  31.58 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  26.55 
 
 		 549 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  36.75 
 
 		 125 aa  62  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5834  copper resistance protein CopC  35.34 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0327152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2163  copper resistance protein CopC  42.16 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.856375  normal  0.693909 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  37.4 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  35.59 
 
 		 576 aa  61.6  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  35.34 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  36.04 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2238  copper resistance protein CopC  35.59 
 
 		 126 aa  60.8  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  35.51 
 
 		 124 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  36.45 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  36.45 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  37.07 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  36.54 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  36.54 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  38.26 
 
 		 551 aa  59.3  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  31.45 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  36.22 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  31.45 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  31.45 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3414  copper resistance protein CopC  34.17 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3575  copper resistance protein CopC  40.4 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.310709  normal  0.0481479 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  29.44 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  36.44 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  37.07 
 
 		 160 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  36.54 
 
 		 146 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 613 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  38.26 
 
 		 519 aa  57  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  35.58 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  34.88 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2514  copper resistance protein CopC  34.95 
 
 		 120 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  32.38 
 
 		 590 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 124 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2347  copper resistance protein CopC  35.07 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  34.11 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>