10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2786 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2786  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  501  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0857143  decreased coverage  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2588  hypothetical protein  83.98 
 
 		 256 aa  427  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2480  putative integral membrane protein  37.34 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000114797  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2774  putative integral membrane protein  35.83 
 
 		 242 aa  89.4  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227897  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10094  hypothetical protein  31.7 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.77599 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1274  integral membrane protein  49.33 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5781  hypothetical protein  33.16 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.834779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2732  hypothetical protein  34.15 
 
 		 200 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0844  putative transmembrane anti-sigma factor  21.99 
 
 		 146 aa  43.9  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000720688  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4250  putative transmembrane protein  33.04 
 
 		 266 aa  42.7  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.939456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>