More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2774 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  81 
 
 		 520 aa  766    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  100 
 
 		 521 aa  1029    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  59.69 
 
 		 528 aa  553  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  55.47 
 
 		 532 aa  512  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.7 
 
 		 572 aa  497  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  58.21 
 
 		 521 aa  488  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  55.94 
 
 		 545 aa  470  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  51.12 
 
 		 527 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.14 
 
 		 518 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  50.28 
 
 		 529 aa  457  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  52.68 
 
 		 525 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  52.68 
 
 		 525 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  52.68 
 
 		 525 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  52.76 
 
 		 540 aa  445  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  50.29 
 
 		 527 aa  430  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  52.58 
 
 		 524 aa  430  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  50.19 
 
 		 531 aa  421  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  48.52 
 
 		 534 aa  390  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  47.87 
 
 		 550 aa  355  8.999999999999999e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  37.25 
 
 		 556 aa  337  2.9999999999999997e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.29 
 
 		 533 aa  320  6e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  38.98 
 
 		 552 aa  312  7.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  37.48 
 
 		 531 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.76 
 
 		 531 aa  299  9e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  37.45 
 
 		 531 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  36.1 
 
 		 583 aa  293  4e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  34.27 
 
 		 563 aa  293  7e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  32.13 
 
 		 559 aa  286  7e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.58 
 
 		 534 aa  285  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  37.52 
 
 		 584 aa  282  9e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  33.72 
 
 		 554 aa  276  5e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  34.45 
 
 		 538 aa  276  9e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  40.43 
 
 		 546 aa  274  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.38 
 
 		 565 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  36.12 
 
 		 557 aa  269  8e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.86 
 
 		 579 aa  260  4e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.96 
 
 		 568 aa  259  6e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  31.97 
 
 		 586 aa  253  5.000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13124  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase agpS  39.35 
 
 		 527 aa  250  5e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3120  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.71 
 
 		 535 aa  243  6e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0913078  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3350  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.17 
 
 		 536 aa  241  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0117199 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1454  FAD linked oxidase domain protein  38.44 
 
 		 531 aa  236  8e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5107  FAD linked oxidase-like  34.48 
 
 		 534 aa  234  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6436  FAD linked oxidase domain protein  35.5 
 
 		 534 aa  234  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466111 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.05 
 
 		 564 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2483  FAD linked oxidase-like  34.05 
 
 		 502 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.0195086 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  35.06 
 
 		 465 aa  227  4e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1270  FAD linked oxidase-like  37.8 
 
 		 532 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544288 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  36.99 
 
 		 467 aa  226  8e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  37.26 
 
 		 470 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3848  FAD linked oxidase-like  36.07 
 
 		 532 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.44 
 
 		 510 aa  207  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.14 
 
 		 520 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.63 
 
 		 516 aa  203  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  33.64 
 
 		 513 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02617  predicted FAD containing dehydrogenase  30.29 
 
 		 484 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0916  FAD linked oxidase domain protein  30.29 
 
 		 484 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02580  hypothetical protein  30.29 
 
 		 484 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0940  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.37 
 
 		 484 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2461  alkylglycerone-phosphate synthase  31.25 
 
 		 484 aa  200  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2901  FAD binding domain-containing protein  30.02 
 
 		 484 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4029  FAD binding domain protein  29.81 
 
 		 484 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.637066 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2912  FAD binding domain-containing protein  30.08 
 
 		 484 aa  200  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3074  FAD binding domain-containing protein  30.08 
 
 		 484 aa  200  6e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.87 
 
 		 516 aa  192  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  33.47 
 
 		 517 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.69 
 
 		 523 aa  189  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  34.21 
 
 		 520 aa  187  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2367  FAD linked oxidase domain protein  31.19 
 
 		 451 aa  178  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44190  predicted protein  27.61 
 
 		 554 aa  162  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  32.92 
 
 		 472 aa  156  9e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2900  FAD linked oxidase domain protein  31.72 
 
 		 472 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  32.07 
 
 		 472 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3321  FAD linked oxidase domain protein  41.96 
 
 		 572 aa  153  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0988206  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  32.02 
 
 		 476 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  31.42 
 
 		 471 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  31 
 
 		 471 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  30 
 
 		 485 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  31.22 
 
 		 473 aa  147  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1149  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.59 
 
 		 467 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.930112 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2026  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.09 
 
 		 475 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0174906  normal  0.155014 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0816  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.83 
 
 		 477 aa  143  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513401  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.22 
 
 		 473 aa  141  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.47 
 
 		 474 aa  140  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  30.83 
 
 		 495 aa  140  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.08 
 
 		 474 aa  140  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0040  Fis family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 474 aa  140  7.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.19101 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  30.63 
 
 		 462 aa  139  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1780  FAD linked oxidase domain protein  31.68 
 
 		 506 aa  139  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000119799 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  31.71 
 
 		 474 aa  139  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1985  FAD linked oxidase-like  30.14 
 
 		 465 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0845932  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3364  FAD linked oxidase-like  30.86 
 
 		 475 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1422  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.91 
 
 		 470 aa  137  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.524008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0777  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.56 
 
 		 482 aa  137  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.47 
 
 		 469 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  29.24 
 
 		 474 aa  136  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0025  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.07 
 
 		 470 aa  136  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4018  FAD linked oxidase domain protein  29.93 
 
 		 475 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3276  FAD linked oxidase-like  30.7 
 
 		 472 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734148  normal  0.868231 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.51 
 
 		 469 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>