More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2597 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  100 
 
 		 509 aa  969    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  89.58 
 
 		 519 aa  820    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  45.08 
 
 		 507 aa  311  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.31 
 
 		 519 aa  302  8.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  39.31 
 
 		 503 aa  292  8e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.96 
 
 		 532 aa  289  7e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  40.93 
 
 		 520 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  45.13 
 
 		 502 aa  284  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.5 
 
 		 534 aa  280  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  39.58 
 
 		 503 aa  272  8.000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.72 
 
 		 520 aa  272  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.42 
 
 		 607 aa  263  8e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.27 
 
 		 525 aa  262  8e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.33 
 
 		 522 aa  259  7e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.07 
 
 		 522 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.41 
 
 		 478 aa  251  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.19 
 
 		 538 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.96 
 
 		 537 aa  249  8e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  38.52 
 
 		 508 aa  248  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  36.4 
 
 		 528 aa  247  4e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.47 
 
 		 531 aa  247  4e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  36.87 
 
 		 509 aa  245  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  38.3 
 
 		 525 aa  240  5e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  38.3 
 
 		 525 aa  240  5e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  38.3 
 
 		 525 aa  240  5e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.74 
 
 		 458 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  35.46 
 
 		 555 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  36.02 
 
 		 518 aa  236  9e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.9 
 
 		 502 aa  235  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  36.95 
 
 		 511 aa  235  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7431  major facilitator superfamily MFS_1  38.04 
 
 		 533 aa  233  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.82 
 
 		 486 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.82 
 
 		 486 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.82 
 
 		 486 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.82 
 
 		 486 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.82 
 
 		 486 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.82 
 
 		 486 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  35.36 
 
 		 562 aa  231  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.01 
 
 		 478 aa  230  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.25 
 
 		 626 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 		 588 aa  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 533 aa  228  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.43 
 
 		 468 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.85 
 
 		 498 aa  227  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.91 
 
 		 532 aa  228  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  38.38 
 
 		 517 aa  226  6e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  37.7 
 
 		 519 aa  226  6e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.9 
 
 		 478 aa  226  7e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  36.93 
 
 		 532 aa  226  8e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  37.84 
 
 		 516 aa  226  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  35.84 
 
 		 516 aa  224  4e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.05 
 
 		 489 aa  224  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.09 
 
 		 528 aa  223  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 		 478 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  34.8 
 
 		 528 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 		 484 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.17 
 
 		 478 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  33.25 
 
 		 467 aa  218  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.79 
 
 		 489 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.82 
 
 		 525 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.166861  hitchhiker  0.0000537278 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  37.68 
 
 		 554 aa  218  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  40.99 
 
 		 528 aa  217  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.12 
 
 		 487 aa  217  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.8 
 
 		 522 aa  217  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.71 
 
 		 488 aa  216  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.68 
 
 		 539 aa  216  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.79 
 
 		 478 aa  216  9e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  38.73 
 
 		 524 aa  215  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.37 
 
 		 504 aa  215  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2493  major facilitator superfamily MFS_1  35.56 
 
 		 517 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000001804  hitchhiker  0.00137453 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 524 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3647  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.72 
 
 		 486 aa  213  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.04243 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  41.05 
 
 		 513 aa  213  7e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.63 
 
 		 488 aa  213  7.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  36.65 
 
 		 492 aa  213  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1476  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39 
 
 		 472 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.71 
 
 		 485 aa  211  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  37.01 
 
 		 517 aa  211  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  38.04 
 
 		 510 aa  209  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3341  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 		 487 aa  209  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 		 553 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3897  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.6 
 
 		 518 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.78 
 
 		 510 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  35.18 
 
 		 503 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2542  major facilitator superfamily MFS_1  35.14 
 
 		 485 aa  207  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494815  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  33.19 
 
 		 490 aa  207  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.91 
 
 		 522 aa  206  7e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  35.33 
 
 		 500 aa  206  8e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2521  major facilitator transporter  34.27 
 
 		 497 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  36.95 
 
 		 535 aa  206  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  34.71 
 
 		 601 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  39.09 
 
 		 476 aa  205  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.28 
 
 		 524 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 528 aa  204  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  36.21 
 
 		 492 aa  204  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  35.17 
 
 		 509 aa  204  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  34.56 
 
 		 500 aa  204  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  35.1 
 
 		 504 aa  204  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.34 
 
 		 474 aa  203  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 584 aa  203  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>