More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2585 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  100 
 
 
308 aa  608  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2430  ABC transporter related  95.05 
 
 
303 aa  568  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0400473  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  59.04 
 
 
756 aa  325  8.000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  55.48 
 
 
741 aa  300  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  52.2 
 
 
301 aa  298  7e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  54.3 
 
 
300 aa  294  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6085  ABC transporter related  43.33 
 
 
312 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  44.55 
 
 
319 aa  229  4e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  42.62 
 
 
304 aa  222  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  41.61 
 
 
305 aa  219  5e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  40.98 
 
 
305 aa  217  2e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  39.93 
 
 
305 aa  215  7e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  39.48 
 
 
319 aa  195  9e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  41.92 
 
 
285 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  41.37 
 
 
312 aa  192  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  37.62 
 
 
323 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  39.66 
 
 
295 aa  191  9e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  39.16 
 
 
305 aa  191  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  39.87 
 
 
303 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  38.81 
 
 
301 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  38.38 
 
 
306 aa  189  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  39.38 
 
 
310 aa  188  9e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  45.75 
 
 
322 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  38.1 
 
 
323 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  34.53 
 
 
308 aa  187  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  38.64 
 
 
303 aa  186  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  43.78 
 
 
302 aa  186  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  38.89 
 
 
283 aa  186  5e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0192  ABC transporter related  42.16 
 
 
329 aa  186  5e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  40.86 
 
 
311 aa  186  6e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  38.67 
 
 
310 aa  185  7e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  41.25 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  37.16 
 
 
293 aa  183  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  41.06 
 
 
317 aa  183  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  37.38 
 
 
326 aa  183  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  37.95 
 
 
322 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  37.94 
 
 
308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  38.39 
 
 
312 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  39.05 
 
 
311 aa  182  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  38.01 
 
 
326 aa  182  7e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  46.85 
 
 
237 aa  181  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  44.73 
 
 
314 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  40.65 
 
 
301 aa  181  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1160  ABC transporter related  37.62 
 
 
315 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  36.3 
 
 
297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  38.12 
 
 
309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  41.31 
 
 
310 aa  179  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  40.89 
 
 
284 aa  179  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  36.88 
 
 
326 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  42.79 
 
 
254 aa  179  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  39.32 
 
 
299 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0563  ABC transporter related  37.17 
 
 
311 aa  179  4.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  39.67 
 
 
315 aa  179  5.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  41.82 
 
 
256 aa  179  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  40.51 
 
 
333 aa  178  8e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  40.73 
 
 
311 aa  178  8e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  39 
 
 
335 aa  178  9e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  38.31 
 
 
322 aa  177  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  39.59 
 
 
293 aa  178  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  36.75 
 
 
316 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  40.79 
 
 
304 aa  177  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  42.34 
 
 
325 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  38.69 
 
 
330 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  39.07 
 
 
332 aa  177  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0277  ABC-2 type transporter ATPase  40.48 
 
 
301 aa  177  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.449682  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  37.92 
 
 
315 aa  177  3e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  37.46 
 
 
322 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  38.51 
 
 
304 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  42.38 
 
 
256 aa  176  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39 
 
 
322 aa  176  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  40.47 
 
 
308 aa  176  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0639  multidrug ABC transporter ATPase  36.07 
 
 
327 aa  176  5e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  39.8 
 
 
301 aa  176  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  37.74 
 
 
328 aa  176  6e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  38.66 
 
 
308 aa  175  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  43.52 
 
 
316 aa  175  8e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3547  ABC transporter-like protein  40.2 
 
 
290 aa  175  9e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.757976 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  39.46 
 
 
282 aa  175  9e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.79 
 
 
317 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2941  ABC transporter related  37.38 
 
 
325 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3150  ABC transporter related  42.66 
 
 
247 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0403  ABC transporter, ATP-binding protein  36.6 
 
 
305 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  44.19 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  39.73 
 
 
374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  35.74 
 
 
305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  36.88 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  39.82 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  36.79 
 
 
321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2475  nodulation ABC transporter NodI  38.51 
 
 
304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  36.39 
 
 
373 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.54 
 
 
317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  37.58 
 
 
280 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  38.64 
 
 
290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  37.46 
 
 
316 aa  172  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2802  ABC transporter related  39.46 
 
 
312 aa  172  5.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.474892  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  33.55 
 
 
312 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  38.54 
 
 
306 aa  172  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2764  ABC transporter related  37.99 
 
 
308 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.15 
 
 
411 aa  172  7.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  37.13 
 
 
321 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>