More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2536 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  100 
 
 
382 aa  738    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2391  geranylgeranyl reductase  88.77 
 
 
375 aa  589  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0162  geranylgeranyl reductase  48.69 
 
 
392 aa  282  6.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4412  geranylgeranyl reductase  47.29 
 
 
426 aa  265  7e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0475548  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  33.25 
 
 
378 aa  166  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  28.9 
 
 
387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  34.39 
 
 
375 aa  152  8.999999999999999e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  33.77 
 
 
384 aa  125  9e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  28.31 
 
 
370 aa  125  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  29.91 
 
 
376 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  31.04 
 
 
373 aa  116  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  28.02 
 
 
368 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  30.57 
 
 
362 aa  113  6e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  31.31 
 
 
379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1604  geranylgeranyl reductase  28.4 
 
 
391 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  29.76 
 
 
373 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2299  geranylgeranyl reductase  29.71 
 
 
374 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.650791  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  31.23 
 
 
376 aa  107  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  31.25 
 
 
384 aa  107  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  33.77 
 
 
383 aa  107  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  31.33 
 
 
380 aa  107  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  29.86 
 
 
389 aa  106  7e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  27.81 
 
 
376 aa  103  7e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  30.67 
 
 
401 aa  102  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  31.07 
 
 
380 aa  101  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  28.71 
 
 
379 aa  100  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  26.14 
 
 
385 aa  99.8  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  30.79 
 
 
380 aa  99.4  9e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  29.33 
 
 
380 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  24.42 
 
 
376 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  26.69 
 
 
382 aa  96.7  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  22.48 
 
 
376 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0709  geranylgeranyl reductase  26.68 
 
 
377 aa  92.8  8e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  30.31 
 
 
430 aa  92.8  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  31.56 
 
 
400 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  30.7 
 
 
368 aa  92  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  30.33 
 
 
403 aa  92.4  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  33.43 
 
 
423 aa  92  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  30.98 
 
 
367 aa  90.9  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  22.69 
 
 
377 aa  90.9  4e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  27.65 
 
 
379 aa  90.5  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  25.87 
 
 
374 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  22.39 
 
 
377 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  30.35 
 
 
421 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  30.15 
 
 
384 aa  87.8  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  29.57 
 
 
380 aa  87.8  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  33.75 
 
 
400 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05221  NAD binding site  25 
 
 
375 aa  87.4  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  30.86 
 
 
420 aa  87  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  29.33 
 
 
393 aa  87  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  30.36 
 
 
406 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  22.02 
 
 
377 aa  86.7  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  28.26 
 
 
376 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  29.05 
 
 
393 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  33.44 
 
 
341 aa  82.8  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  26.14 
 
 
384 aa  82.4  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07601  NAD binding site  26.06 
 
 
375 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  28.28 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  29.35 
 
 
406 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  29.54 
 
 
411 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  29.63 
 
 
423 aa  80.5  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  28.34 
 
 
418 aa  80.5  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0520  NAD binding site  23.28 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  30.71 
 
 
419 aa  79.7  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  27.93 
 
 
362 aa  79.7  0.00000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1739  geranylgeranyl reductase  30.48 
 
 
358 aa  79  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal  0.0147858 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  27.62 
 
 
406 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  27.21 
 
 
426 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  29.11 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  26.96 
 
 
452 aa  77.4  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  29.73 
 
 
425 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  33.66 
 
 
413 aa  77  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  28.36 
 
 
434 aa  77  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  34.45 
 
 
409 aa  77  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  28.43 
 
 
457 aa  76.6  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  27.3 
 
 
406 aa  76.3  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  27.62 
 
 
418 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  26.96 
 
 
455 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  30.31 
 
 
434 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  23.98 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1854  geranylgeranyl reductase  36.71 
 
 
408 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0189229 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  26.89 
 
 
407 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.75 
 
 
446 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1650  geranylgeranyl reductase  28.07 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  38.77 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  26.98 
 
 
457 aa  74.3  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  26.43 
 
 
468 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.19 
 
 
446 aa  73.2  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  29.14 
 
 
431 aa  73.6  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  27.59 
 
 
358 aa  73.2  0.000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  30.89 
 
 
394 aa  73.2  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1088  monooxygenase, FAD-binding  30.19 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129242  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  25.25 
 
 
405 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  28.57 
 
 
406 aa  72.8  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  24.3 
 
 
393 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1304  geranylgeranyl reductase  35.02 
 
 
400 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  25.25 
 
 
405 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  30.06 
 
 
424 aa  72.4  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6424  geranylgeranyl reductase  30.46 
 
 
403 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  25.26 
 
 
405 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>