90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2509 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  75.46 
 
 		 509 aa  667    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  100 
 
 		 476 aa  943    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  70.87 
 
 		 483 aa  608  1e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  71.28 
 
 		 477 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  45.25 
 
 		 481 aa  309  5.9999999999999995e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  46.89 
 
 		 501 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  43.94 
 
 		 479 aa  225  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  42.94 
 
 		 465 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  39.61 
 
 		 464 aa  212  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  39.75 
 
 		 468 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  38.77 
 
 		 461 aa  211  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  42.38 
 
 		 461 aa  209  9e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  41.58 
 
 		 459 aa  207  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  40.25 
 
 		 462 aa  205  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  37.17 
 
 		 464 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  41.79 
 
 		 466 aa  203  7e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  41.45 
 
 		 450 aa  201  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  39.58 
 
 		 465 aa  197  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  37.29 
 
 		 454 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  39.82 
 
 		 435 aa  194  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  38.44 
 
 		 459 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  39.85 
 
 		 467 aa  190  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  40.14 
 
 		 460 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  37.9 
 
 		 454 aa  188  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  40.43 
 
 		 464 aa  187  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  39.67 
 
 		 454 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  39.25 
 
 		 439 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.61 
 
 		 462 aa  182  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  40.61 
 
 		 361 aa  178  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  37.84 
 
 		 455 aa  177  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  40.66 
 
 		 478 aa  177  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  38.6 
 
 		 452 aa  176  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  35.5 
 
 		 441 aa  176  8e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  40.46 
 
 		 446 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  39.79 
 
 		 505 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  36.72 
 
 		 457 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  38.22 
 
 		 466 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  39.29 
 
 		 473 aa  169  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  39.72 
 
 		 493 aa  169  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  39.79 
 
 		 477 aa  167  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  38.89 
 
 		 415 aa  167  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  35.71 
 
 		 489 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  41.06 
 
 		 557 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  38.21 
 
 		 457 aa  166  9e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  36.9 
 
 		 464 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  40 
 
 		 433 aa  160  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  30.78 
 
 		 483 aa  159  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  37.24 
 
 		 462 aa  159  9e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  31.36 
 
 		 477 aa  157  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  40.15 
 
 		 432 aa  155  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  31.49 
 
 		 523 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  32.33 
 
 		 532 aa  152  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  36.59 
 
 		 435 aa  150  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  35.76 
 
 		 476 aa  147  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  37.72 
 
 		 496 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  35.85 
 
 		 448 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  34.85 
 
 		 673 aa  97.4  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  47.27 
 
 		 840 aa  90.9  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  31.05 
 
 		 1296 aa  77.8  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  30.87 
 
 		 759 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  29.39 
 
 		 767 aa  77  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  27.25 
 
 		 530 aa  74.7  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  31.62 
 
 		 863 aa  74.7  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  28.22 
 
 		 541 aa  67.4  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  28.24 
 
 		 575 aa  63.2  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1921  hypothetical protein  33.79 
 
 		 350 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  31.85 
 
 		 523 aa  60.5  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  30.53 
 
 		 852 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  27.06 
 
 		 591 aa  57  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  29.02 
 
 		 2160 aa  57  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  25.61 
 
 		 575 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  28.39 
 
 		 1037 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  30.31 
 
 		 786 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  28.74 
 
 		 1755 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15312  predicted protein  25.28 
 
 		 1359 aa  52  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  29.59 
 
 		 743 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  27.86 
 
 		 1010 aa  50.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  31.76 
 
 		 884 aa  50.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  28.71 
 
 		 1197 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  27.72 
 
 		 1092 aa  49.3  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  27.64 
 
 		 2192 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  41.28 
 
 		 168 aa  49.3  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  28.24 
 
 		 558 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  35.2 
 
 		 362 aa  47  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0859  OmpA/MotB domain protein  26.81 
 
 		 913 aa  47  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  25.27 
 
 		 1332 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1362  hypothetical protein  27.06 
 
 		 1023 aa  46.6  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  33.82 
 
 		 717 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  28.75 
 
 		 1106 aa  44.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3707  polymorphic outer membrane protein  27.66 
 
 		 518 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000878669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>